MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 174669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013440	ACG	2	6	56	61	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013440	CGC	2	6	158	163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193327
3	NC_013440	CGA	2	6	288	293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193327
4	NC_013440	GCC	2	6	355	360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193327
5	NC_013440	GAC	2	6	376	381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193327
6	NC_013440	TCC	2	6	410	415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193327
7	NC_013440	GGC	2	6	418	423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193327
8	NC_013440	GCC	2	6	561	566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193327
9	NC_013440	CGC	4	12	578	589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193327
10	NC_013440	TCG	2	6	617	622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193327
11	NC_013440	GGC	2	6	648	653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193327
12	NC_013440	GCG	3	9	707	715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193327
13	NC_013440	CTG	2	6	736	741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193327
14	NC_013440	CGC	3	9	862	870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193327
15	NC_013440	CGA	2	6	900	905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193327
16	NC_013440	TTC	2	6	946	951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262193327
17	NC_013440	CCG	2	6	998	1003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193327
18	NC_013440	CTG	2	6	1066	1071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193327
19	NC_013440	GCC	2	6	1083	1088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193327
20	NC_013440	CGA	2	6	1152	1157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193327
21	NC_013440	GTG	2	6	1159	1164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193327
22	NC_013440	CAC	2	6	1320	1325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193327
23	NC_013440	TCA	2	6	1334	1339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193327
24	NC_013440	ACT	2	6	1352	1357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193327
25	NC_013440	CAC	2	6	1495	1500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193327
26	NC_013440	GCG	2	6	1562	1567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193327
27	NC_013440	CTG	2	6	1591	1596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193327
28	NC_013440	GCT	2	6	2448	2453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193328
29	NC_013440	CGG	2	6	2486	2491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193328
30	NC_013440	GGC	2	6	2518	2523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193328
31	NC_013440	TCG	2	6	2555	2560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193328
32	NC_013440	GTC	2	6	2581	2586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193328
33	NC_013440	ACA	2	6	2600	2605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262193328
34	NC_013440	TCG	2	6	2645	2650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193328
35	NC_013440	GAT	2	6	2733	2738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193328
36	NC_013440	ACG	2	6	2765	2770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193328
37	NC_013440	GCA	2	6	2813	2818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193328
38	NC_013440	ATC	3	9	2902	2910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193328
39	NC_013440	AAG	2	6	2914	2919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262193328
40	NC_013440	AAG	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262193328
41	NC_013440	GCG	2	6	2951	2956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193328
42	NC_013440	GAT	2	6	3009	3014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193328
43	NC_013440	GTC	2	6	3088	3093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193328
44	NC_013440	CTC	2	6	3109	3114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193328
45	NC_013440	TCA	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193328
46	NC_013440	GAG	2	6	3229	3234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193328
47	NC_013440	ACG	2	6	3248	3253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193328
48	NC_013440	GAG	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193328
49	NC_013440	CTG	2	6	3298	3303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193328
50	NC_013440	CTG	2	6	3361	3366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193328
51	NC_013440	CTG	2	6	3430	3435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193329
52	NC_013440	CGC	2	6	3473	3478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193329
53	NC_013440	GCG	2	6	3656	3661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193329
54	NC_013440	GCC	2	6	3701	3706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193329
55	NC_013440	GTG	2	6	3766	3771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193329
56	NC_013440	CGG	2	6	3820	3825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193329
57	NC_013440	GGT	2	6	3894	3899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193329
58	NC_013440	GCT	2	6	3915	3920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193329
59	NC_013440	CAG	2	6	3985	3990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193329
60	NC_013440	AGC	2	6	4172	4177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193329
61	NC_013440	GCC	3	9	4192	4200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193329
62	NC_013440	CTC	2	6	4239	4244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193329
63	NC_013440	GAT	2	6	4261	4266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193329
64	NC_013440	GAG	2	6	4384	4389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193329
65	NC_013440	CGA	2	6	4404	4409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193329
66	NC_013440	TCA	2	6	4484	4489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193329
67	NC_013440	GGC	2	6	4549	4554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193329
68	NC_013440	ACG	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193330
69	NC_013440	CAC	2	6	4777	4782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193330
70	NC_013440	CGG	2	6	4934	4939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193330
71	NC_013440	CGG	2	6	4968	4973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193330
72	NC_013440	GGT	2	6	5005	5010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193330
73	NC_013440	GGT	2	6	5031	5036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193330
74	NC_013440	GCA	2	6	5132	5137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193330
75	NC_013440	CAC	2	6	5142	5147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193330
76	NC_013440	CCG	2	6	5151	5156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193330
77	NC_013440	CGA	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193330
78	NC_013440	CAG	3	9	5299	5307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193330
79	NC_013440	GGC	2	6	5323	5328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193330
80	NC_013440	CAA	2	6	5358	5363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262193330
81	NC_013440	GGT	2	6	5379	5384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193330
82	NC_013440	CGA	2	6	5394	5399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193330
83	NC_013440	CGG	2	6	5493	5498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193330
84	NC_013440	GCT	2	6	5565	5570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193330
85	NC_013440	CAA	2	6	5586	5591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262193330
86	NC_013440	GTC	2	6	5688	5693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193330
87	NC_013440	CTT	2	6	5742	5747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262193330
88	NC_013440	ATC	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193330
89	NC_013440	CGC	2	6	5796	5801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193330
90	NC_013440	CGC	2	6	5814	5819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193330
91	NC_013440	TCG	2	6	5930	5935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193330
92	NC_013440	CCG	2	6	5945	5950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193330
93	NC_013440	ACC	2	6	6131	6136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193330
94	NC_013440	TCA	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193330
95	NC_013440	CTT	3	9	6198	6206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262193330
96	NC_013440	ATC	2	6	6223	6228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193330
97	NC_013440	AAC	2	6	6232	6237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262193330
98	NC_013440	GCC	2	6	6255	6260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193330
99	NC_013440	CGG	2	6	6384	6389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193330
100	NC_013440	TCA	2	6	6434	6439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193330
101	NC_013440	GCG	2	6	6521	6526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193330
102	NC_013440	CAC	2	6	6604	6609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193330
103	NC_013440	CGA	2	6	6645	6650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193330
104	NC_013440	GGC	2	6	6688	6693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193330
105	NC_013440	CCG	2	6	6699	6704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193330
106	NC_013440	CAT	2	6	6711	6716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193330
107	NC_013440	GAG	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193330
108	NC_013440	GAC	2	6	6837	6842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193330
109	NC_013440	CGA	2	6	6846	6851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193330
110	NC_013440	ACC	2	6	6946	6951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193330
111	NC_013440	GAA	2	6	7000	7005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262193330
112	NC_013440	AAC	2	6	7069	7074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262193330
113	NC_013440	ATC	2	6	7176	7181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013440	AGC	2	6	7198	7203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013440	CGG	2	6	7258	7263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193331
116	NC_013440	GCC	2	6	7270	7275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193331
117	NC_013440	CGT	2	6	7279	7284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193331
118	NC_013440	TCG	2	6	7338	7343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193331
119	NC_013440	GGC	2	6	7402	7407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193331
120	NC_013440	CAG	2	6	7568	7573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193331
121	NC_013440	ACC	2	6	7685	7690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193331
122	NC_013440	CGA	3	9	7753	7761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193331
123	NC_013440	GAC	2	6	7865	7870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193331
124	NC_013440	CGA	2	6	7873	7878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193331
125	NC_013440	CAT	2	6	7999	8004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193331
126	NC_013440	GCC	2	6	8059	8064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193331
127	NC_013440	CAA	2	6	8077	8082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262193331
128	NC_013440	CGG	2	6	8106	8111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193331
129	NC_013440	TGG	2	6	8181	8186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193331
130	NC_013440	GAG	2	6	8339	8344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013440	GCA	2	6	8364	8369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013440	CCG	2	6	8442	8447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_013440	ACA	2	6	8460	8465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013440	AGC	2	6	8498	8503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193332
135	NC_013440	GCC	2	6	8578	8583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193332
136	NC_013440	CGA	2	6	8717	8722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193332
137	NC_013440	GCT	2	6	8793	8798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193332
138	NC_013440	CTC	2	6	8812	8817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262193332
139	NC_013440	GCC	3	9	8818	8826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193332
140	NC_013440	TGG	2	6	8849	8854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193332
141	NC_013440	GCA	2	6	8856	8861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193332
142	NC_013440	GAT	2	6	8868	8873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193332
143	NC_013440	TTC	2	6	8890	8895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262193332
144	NC_013440	CTG	2	6	8971	8976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193332
145	NC_013440	GCG	2	6	9002	9007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193332
146	NC_013440	GAA	2	6	9013	9018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262193332
147	NC_013440	CGG	2	6	9030	9035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193332
148	NC_013440	CGC	2	6	9061	9066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193332
149	NC_013440	GCA	2	6	9081	9086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193332
150	NC_013440	GCG	2	6	9087	9092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193332
151	NC_013440	GGT	2	6	9132	9137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193332
152	NC_013440	GCA	2	6	9147	9152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193332
153	NC_013440	CGG	2	6	9162	9167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193332
154	NC_013440	CCG	2	6	9239	9244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193332
155	NC_013440	TGC	2	6	9260	9265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193332
156	NC_013440	GCT	2	6	9342	9347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193332
157	NC_013440	TTC	2	6	9394	9399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262193332
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159	NC_013440	CCG	2	6	9435	9440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193332
160	NC_013440	GAG	2	6	9448	9453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262193332
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162	NC_013440	CGC	2	6	9530	9535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193332
163	NC_013440	CCG	2	6	9551	9556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193332
164	NC_013440	CGA	2	6	9567	9572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193332
165	NC_013440	ATG	2	6	9660	9665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193332
166	NC_013440	ATG	2	6	9678	9683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193333
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170	NC_013440	CGA	2	6	9769	9774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193333
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174	NC_013440	CGA	2	6	9905	9910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193333
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189	NC_013440	GCG	2	6	10714	10719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193333
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194	NC_013440	GCT	2	6	11050	11055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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196	NC_013440	CGC	2	6	11108	11113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
197	NC_013440	CGA	2	6	11134	11139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193334
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239	NC_013440	GGA	2	6	13707	13712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
240	NC_013440	TTC	2	6	13723	13728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262193336
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248	NC_013440	CAC	2	6	13896	13901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262193336
249	NC_013440	CGA	2	6	13905	13910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193336
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254	NC_013440	CAT	2	6	14142	14147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193336
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256	NC_013440	GGC	2	6	14235	14240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193336
257	NC_013440	GGC	2	6	14414	14419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193337
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381	NC_013440	GTC	2	6	20485	20490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193343
382	NC_013440	CTG	2	6	20506	20511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193343
383	NC_013440	GTC	3	9	20539	20547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193343
384	NC_013440	CGT	2	6	20562	20567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193343
385	NC_013440	CAG	2	6	20611	20616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193343
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387	NC_013440	GCT	2	6	20740	20745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193344
388	NC_013440	CGA	2	6	20752	20757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193344
389	NC_013440	GTG	2	6	20888	20893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193344
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402	NC_013440	CGA	2	6	21442	21447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262193344
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409	NC_013440	GCC	2	6	21652	21657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193344
410	NC_013440	GCG	2	6	21667	21672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193344
411	NC_013440	GTG	2	6	21710	21715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193344
412	NC_013440	CGC	2	6	21946	21951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193344
413	NC_013440	CAT	2	6	21964	21969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193344
414	NC_013440	AAG	2	6	22049	22054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262193344
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416	NC_013440	CGG	2	6	22224	22229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
417	NC_013440	GCC	2	6	22342	22347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193345
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487	NC_013440	GCG	2	6	26109	26114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262193347
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495	NC_013440	CGC	2	6	26606	26611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262193348
496	NC_013440	ATC	2	6	26719	26724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193348
497	NC_013440	TCG	2	6	26776	26781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262193348
498	NC_013440	ATG	2	6	26782	26787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262193348
499	NC_013440	TGG	2	6	26795	26800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262193348
500	NC_013440	CAT	2	6	26847	26852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262193348

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