MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans plasmid S25

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013438	TGCTAT	2	12	3000	3011	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	261876189
2	NC_013438	AAAAGC	2	12	7588	7599	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	261876192
3	NC_013438	CTAAAT	2	12	7837	7848	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	261876193
4	NC_013438	AAGCAC	2	12	8710	8721	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	261876194
5	NC_013438	AAGCAA	2	12	10161	10172	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	261876197
6	NC_013438	CAAAAT	2	12	10617	10628	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	261876198
7	NC_013438	AGGCGT	2	12	10739	10750	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	261876198
8	NC_013438	TTAATG	2	12	14975	14986	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	261876202
9	NC_013438	AATAAA	2	12	15236	15247	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	261876202
10	NC_013438	ACAAGT	2	12	15266	15277	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	261876202
11	NC_013438	GTAAAA	2	12	21184	21195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261876210
12	NC_013438	CTAAAG	2	12	21468	21479	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	261876211
13	NC_013438	AAAAAC	2	12	23288	23299	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	261876216
14	NC_013438	CAAGAA	2	12	26950	26961	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	261876222
15	NC_013438	CATTAG	2	12	28139	28150	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	261876223
16	NC_013438	ATCTCA	2	12	30324	30335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261876224
17	NC_013438	TATACT	2	12	30492	30503	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	261876225
18	NC_013438	ATTAAA	2	12	30922	30933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261876225

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.