MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013422	GGATCA	2	12	79159	79170	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013422	CAGCCT	2	12	103959	103970	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013422	GTTTTG	2	12	167282	167293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013422	GGATTT	2	12	172399	172410	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013422	CTTTCT	2	12	181274	181285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013422	AGAGCC	2	12	201873	201884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013422	GAAATT	2	12	204051	204062	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013422	TTGATG	2	12	229909	229920	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013422	CGAATG	2	12	260528	260539	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013422	TTAATT	2	12	275295	275306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013422	AGATAA	2	12	320892	320903	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013422	GTGTGC	2	12	389686	389697	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013422	GGTTTT	2	12	507474	507485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013422	AAACTC	2	12	510779	510790	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013422	TTAAGA	2	12	537129	537140	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013422	TGAAAT	2	12	578028	578039	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013422	GCGGGC	2	12	596793	596804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013422	GATAAG	2	12	666251	666262	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013422	ACTTGA	2	12	666587	666598	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013422	GCGCGT	2	12	727487	727498	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013422	AACGGT	2	12	826299	826310	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013422	TCGTGG	2	12	946998	947009	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013422	AAATTA	2	12	979554	979565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013422	ACGCTG	2	12	1018426	1018437	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013422	TGTTCA	2	12	1020007	1020018	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013422	TGGTTA	2	12	1024600	1024611	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013422	CGGCTT	2	12	1050493	1050504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013422	AATCAG	2	12	1093035	1093046	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013422	ATTTGA	2	12	1150240	1150251	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013422	CATATT	2	12	1160477	1160488	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013422	TGGGAT	2	12	1299341	1299352	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013422	ATAAGT	2	12	1390277	1390288	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013422	CGCCTG	2	12	1394021	1394032	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013422	GGTTTG	2	12	1440741	1440752	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013422	TCAACA	2	12	1490128	1490139	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013422	GACATT	2	12	1518082	1518093	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013422	TGATGC	2	12	1553418	1553429	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013422	TCGGCA	2	12	1554975	1554986	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013422	GGTGCG	2	12	1555205	1555216	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013422	GTTGGA	2	12	1631202	1631213	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013422	ACCACG	2	12	1661518	1661529	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013422	TTACGG	2	12	1744198	1744209	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013422	CACCCT	2	12	1827355	1827366	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_013422	ATACAG	2	12	1838431	1838442	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013422	GAAACC	2	12	1890879	1890890	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013422	TACCCA	2	12	2013405	2013416	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013422	CAGAAA	2	12	2040970	2040981	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013422	AAAATA	2	12	2057512	2057523	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013422	GAATGA	2	12	2080672	2080683	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013422	GCCCCT	2	12	2117130	2117141	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_013422	TGATTT	2	12	2175289	2175300	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013422	AGACAA	2	12	2290024	2290035	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_013422	GCAAAC	2	12	2291061	2291072	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013422	ATTTCA	2	12	2292284	2292295	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013422	CTTTCG	2	12	2296701	2296712	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013422	TTTCTA	2	12	2306084	2306095	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013422	CGCGAA	2	12	2362930	2362941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013422	ATCAAG	2	12	2428546	2428557	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013422	GCCGCA	2	12	2447042	2447053	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013422	TCACCA	2	12	2508347	2508358	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013422	TAATCA	2	12	2508568	2508579	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013422	CACAGG	2	12	2513454	2513465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.