MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 7128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013422	TTTA	2	8	660	667	25 %	75 %	0 %	0 %	261854631
2	NC_013422	TGGG	2	8	1013	1020	0 %	25 %	75 %	0 %	261854631
3	NC_013422	ATCA	2	8	1662	1669	50 %	25 %	0 %	25 %	261854632
4	NC_013422	TCGA	2	8	1947	1954	25 %	25 %	25 %	25 %	261854632
5	NC_013422	ACGG	2	8	2136	2143	25 %	0 %	50 %	25 %	261854632
6	NC_013422	GCGA	2	8	2562	2569	25 %	0 %	50 %	25 %	261854632
7	NC_013422	GTTT	2	8	3095	3102	0 %	75 %	25 %	0 %	261854633
8	NC_013422	ATCG	2	8	3184	3191	25 %	25 %	25 %	25 %	261854633
9	NC_013422	TTCA	2	8	3310	3317	25 %	50 %	0 %	25 %	261854633
10	NC_013422	GCGG	2	8	3654	3661	0 %	0 %	75 %	25 %	261854633
11	NC_013422	ATTG	2	8	3844	3851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013422	CATG	2	8	4256	4263	25 %	25 %	25 %	25 %	261854634
13	NC_013422	CAAG	2	8	5363	5370	50 %	0 %	25 %	25 %	261854634
14	NC_013422	GATC	2	8	5846	5853	25 %	25 %	25 %	25 %	261854634
15	NC_013422	AGCA	2	8	6648	6655	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013422	TGGG	2	8	7266	7273	0 %	25 %	75 %	0 %	261854636
17	NC_013422	GGGC	2	8	7718	7725	0 %	0 %	75 %	25 %	261854636
18	NC_013422	AAAC	2	8	8377	8384	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013422	TGGC	2	8	8741	8748	0 %	25 %	50 %	25 %	261854637
20	NC_013422	CGAT	2	8	9018	9025	25 %	25 %	25 %	25 %	261854637
21	NC_013422	CTGG	2	8	9073	9080	0 %	25 %	50 %	25 %	261854637
22	NC_013422	GCCC	2	8	9192	9199	0 %	0 %	25 %	75 %	261854637
23	NC_013422	CTGC	2	8	9375	9382	0 %	25 %	25 %	50 %	261854637
24	NC_013422	AAGC	2	8	9853	9860	50 %	0 %	25 %	25 %	261854638
25	NC_013422	CTCG	2	8	10034	10041	0 %	25 %	25 %	50 %	261854638
26	NC_013422	CGGG	2	8	10787	10794	0 %	0 %	75 %	25 %	261854638
27	NC_013422	ACCC	2	8	11157	11164	25 %	0 %	0 %	75 %	261854638
28	NC_013422	CGCC	2	8	11322	11329	0 %	0 %	25 %	75 %	261854638
29	NC_013422	GGCT	2	8	11399	11406	0 %	25 %	50 %	25 %	261854638
30	NC_013422	GCCA	2	8	11705	11712	25 %	0 %	25 %	50 %	261854638
31	NC_013422	CGAG	2	8	12323	12330	25 %	0 %	50 %	25 %	261854639
32	NC_013422	CAAA	2	8	12347	12354	75 %	0 %	0 %	25 %	261854639
33	NC_013422	GGCG	2	8	12357	12364	0 %	0 %	75 %	25 %	261854639
34	NC_013422	ATCA	2	8	12546	12553	50 %	25 %	0 %	25 %	261854639
35	NC_013422	ACGG	2	8	12591	12598	25 %	0 %	50 %	25 %	261854639
36	NC_013422	GCCC	2	8	12705	12712	0 %	0 %	25 %	75 %	261854639
37	NC_013422	GTTC	2	8	12785	12792	0 %	50 %	25 %	25 %	261854639
38	NC_013422	CGGG	2	8	13333	13340	0 %	0 %	75 %	25 %	261854640
39	NC_013422	AAAT	2	8	13737	13744	75 %	25 %	0 %	0 %	261854640
40	NC_013422	CTTG	2	8	14398	14405	0 %	50 %	25 %	25 %	261854641
41	NC_013422	ACGC	2	8	14964	14971	25 %	0 %	25 %	50 %	261854642
42	NC_013422	CCAG	2	8	15015	15022	25 %	0 %	25 %	50 %	261854642
43	NC_013422	TTCA	2	8	15515	15522	25 %	50 %	0 %	25 %	261854642
44	NC_013422	ACCC	2	8	15757	15764	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_013422	GCTG	2	8	16312	16319	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013422	TTTG	2	8	16369	16376	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013422	TGAA	2	8	16944	16951	50 %	25 %	25 %	0 %	261854644
48	NC_013422	TATT	2	8	17252	17259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013422	TAAA	2	8	17269	17276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013422	CAGC	2	8	17781	17788	25 %	0 %	25 %	50 %	261854645
51	NC_013422	TCAT	2	8	18069	18076	25 %	50 %	0 %	25 %	261854645
52	NC_013422	TGAT	2	8	18105	18112	25 %	50 %	25 %	0 %	261854645
53	NC_013422	CAGC	2	8	18347	18354	25 %	0 %	25 %	50 %	261854646
54	NC_013422	GCGG	2	8	18512	18519	0 %	0 %	75 %	25 %	261854646
55	NC_013422	CGTG	2	8	19612	19619	0 %	25 %	50 %	25 %	261854647
56	NC_013422	GGGT	2	8	19812	19819	0 %	25 %	75 %	0 %	261854647
57	NC_013422	AGGG	2	8	20064	20071	25 %	0 %	75 %	0 %	261854648
58	NC_013422	GCTG	2	8	20276	20283	0 %	25 %	50 %	25 %	261854648
59	NC_013422	ACGA	2	8	20503	20510	50 %	0 %	25 %	25 %	261854648
60	NC_013422	ACTT	2	8	21019	21026	25 %	50 %	0 %	25 %	261854649
61	NC_013422	ATTA	2	8	21163	21170	50 %	50 %	0 %	0 %	261854649
62	NC_013422	ACCC	2	8	22226	22233	25 %	0 %	0 %	75 %	261854649
63	NC_013422	ATTG	2	8	22902	22909	25 %	50 %	25 %	0 %	261854649
64	NC_013422	CCGC	2	8	23999	24006	0 %	0 %	25 %	75 %	261854649
65	NC_013422	ATCA	2	8	25093	25100	50 %	25 %	0 %	25 %	261854650
66	NC_013422	TGGG	2	8	25196	25203	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013422	CTGA	2	8	25258	25265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013422	GGCT	2	8	25772	25779	0 %	25 %	50 %	25 %	261854651
69	NC_013422	CGCT	2	8	26290	26297	0 %	25 %	25 %	50 %	261854652
70	NC_013422	GCAA	2	8	26352	26359	50 %	0 %	25 %	25 %	261854652
71	NC_013422	GGGC	2	8	27299	27306	0 %	0 %	75 %	25 %	261854654
72	NC_013422	GCAA	2	8	27426	27433	50 %	0 %	25 %	25 %	261854654
73	NC_013422	AGGT	2	8	28627	28634	25 %	25 %	50 %	0 %	261854654
74	NC_013422	GGCA	2	8	28877	28884	25 %	0 %	50 %	25 %	261854654
75	NC_013422	GGCG	2	8	29457	29464	0 %	0 %	75 %	25 %	261854654
76	NC_013422	TGAA	2	8	29731	29738	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013422	AGAA	2	8	29969	29976	75 %	0 %	25 %	0 %	261854655
78	NC_013422	CCGG	2	8	30611	30618	0 %	0 %	50 %	50 %	261854656
79	NC_013422	CTTG	2	8	32130	32137	0 %	50 %	25 %	25 %	261854656
80	NC_013422	CGGT	2	8	33190	33197	0 %	25 %	50 %	25 %	261854657
81	NC_013422	AAGG	2	8	33462	33469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013422	CGTG	2	8	33646	33653	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013422	GCTG	2	8	34015	34022	0 %	25 %	50 %	25 %	261854658
84	NC_013422	CGGC	2	8	34170	34177	0 %	0 %	50 %	50 %	261854658
85	NC_013422	TCAT	2	8	35119	35126	25 %	50 %	0 %	25 %	261854659
86	NC_013422	AACC	2	8	35247	35254	50 %	0 %	0 %	50 %	261854659
87	NC_013422	GTCG	2	8	36288	36295	0 %	25 %	50 %	25 %	261854660
88	NC_013422	ACCG	2	8	36565	36572	25 %	0 %	25 %	50 %	261854660
89	NC_013422	ACTG	2	8	37149	37156	25 %	25 %	25 %	25 %	261854660
90	NC_013422	GGCA	2	8	37469	37476	25 %	0 %	50 %	25 %	261854660
91	NC_013422	CGGG	2	8	37671	37678	0 %	0 %	75 %	25 %	261854660
92	NC_013422	AATC	2	8	37704	37711	50 %	25 %	0 %	25 %	261854660
93	NC_013422	GATC	2	8	37884	37891	25 %	25 %	25 %	25 %	261854660
94	NC_013422	TGAT	2	8	38119	38126	25 %	50 %	25 %	0 %	261854660
95	NC_013422	TCAA	2	8	38472	38479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013422	CCGC	2	8	38536	38543	0 %	0 %	25 %	75 %	261854662
97	NC_013422	GCGT	2	8	38918	38925	0 %	25 %	50 %	25 %	261854662
98	NC_013422	TTCG	2	8	39374	39381	0 %	50 %	25 %	25 %	261854662
99	NC_013422	ATCG	2	8	40202	40209	25 %	25 %	25 %	25 %	261854663
100	NC_013422	TCGC	2	8	40297	40304	0 %	25 %	25 %	50 %	261854663
101	NC_013422	CGAT	2	8	40419	40426	25 %	25 %	25 %	25 %	261854663
102	NC_013422	AGCG	2	8	41437	41444	25 %	0 %	50 %	25 %	261854663
103	NC_013422	AAAT	2	8	41691	41698	75 %	25 %	0 %	0 %	261854663
104	NC_013422	GGAG	2	8	42405	42412	25 %	0 %	75 %	0 %	261854665
105	NC_013422	GCTC	2	8	42810	42817	0 %	25 %	25 %	50 %	261854666
106	NC_013422	AGCC	2	8	43227	43234	25 %	0 %	25 %	50 %	261854666
107	NC_013422	CCAG	2	8	43296	43303	25 %	0 %	25 %	50 %	261854666
108	NC_013422	GCAG	2	8	43327	43334	25 %	0 %	50 %	25 %	261854666
109	NC_013422	CAAA	2	8	43390	43397	75 %	0 %	0 %	25 %	261854666
110	NC_013422	CAGC	2	8	43485	43492	25 %	0 %	25 %	50 %	261854667
111	NC_013422	CGAT	2	8	43576	43583	25 %	25 %	25 %	25 %	261854667
112	NC_013422	ACGC	2	8	43793	43800	25 %	0 %	25 %	50 %	261854667
113	NC_013422	TGAT	2	8	44094	44101	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013422	GCGG	2	8	44315	44322	0 %	0 %	75 %	25 %	261854668
115	NC_013422	GTCG	2	8	45161	45168	0 %	25 %	50 %	25 %	261854669
116	NC_013422	CGCT	2	8	45186	45193	0 %	25 %	25 %	50 %	261854669
117	NC_013422	GTCA	2	8	45582	45589	25 %	25 %	25 %	25 %	261854669
118	NC_013422	TGAA	2	8	45698	45705	50 %	25 %	25 %	0 %	261854669
119	NC_013422	TCGG	2	8	46156	46163	0 %	25 %	50 %	25 %	261854670
120	NC_013422	TGAA	2	8	46887	46894	50 %	25 %	25 %	0 %	261854670
121	NC_013422	CAGC	2	8	48059	48066	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013422	ATCA	2	8	48134	48141	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013422	GAGC	2	8	49263	49270	25 %	0 %	50 %	25 %	261854672
124	NC_013422	GCCA	2	8	49548	49555	25 %	0 %	25 %	50 %	261854672
125	NC_013422	CTAC	2	8	49565	49572	25 %	25 %	0 %	50 %	261854672
126	NC_013422	TGCC	2	8	49841	49848	0 %	25 %	25 %	50 %	261854672
127	NC_013422	GGAT	2	8	49887	49894	25 %	25 %	50 %	0 %	261854672
128	NC_013422	CGAA	2	8	50685	50692	50 %	0 %	25 %	25 %	261854673
129	NC_013422	GGCG	2	8	51100	51107	0 %	0 %	75 %	25 %	261854673
130	NC_013422	GGCG	2	8	51396	51403	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013422	ATTG	2	8	51786	51793	25 %	50 %	25 %	0 %	261854674
132	NC_013422	GCGG	2	8	51924	51931	0 %	0 %	75 %	25 %	261854674
133	NC_013422	CGCC	2	8	52639	52646	0 %	0 %	25 %	75 %	261854675
134	NC_013422	CGGC	2	8	53483	53490	0 %	0 %	50 %	50 %	261854676
135	NC_013422	GGGC	2	8	53556	53563	0 %	0 %	75 %	25 %	261854676
136	NC_013422	ACCT	2	8	54367	54374	25 %	25 %	0 %	50 %	261854676
137	NC_013422	TCGC	2	8	54673	54680	0 %	25 %	25 %	50 %	261854677
138	NC_013422	GATC	2	8	54818	54825	25 %	25 %	25 %	25 %	261854678
139	NC_013422	GGTT	2	8	54831	54838	0 %	50 %	50 %	0 %	261854678
140	NC_013422	CGAA	2	8	54890	54897	50 %	0 %	25 %	25 %	261854678
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