MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013422	ATTG	2	8	3844	3851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013422	AGCA	2	8	6648	6655	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013422	AAAC	2	8	8377	8384	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013422	ACCC	2	8	15757	15764	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_013422	GCTG	2	8	16312	16319	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013422	TTTG	2	8	16369	16376	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013422	TATT	2	8	17252	17259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013422	TAAA	2	8	17269	17276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013422	TGGG	2	8	25196	25203	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013422	CTGA	2	8	25258	25265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013422	TGAA	2	8	29731	29738	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013422	AAGG	2	8	33462	33469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013422	CGTG	2	8	33646	33653	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013422	TCAA	2	8	38472	38479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013422	TGAT	2	8	44094	44101	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013422	CAGC	2	8	48059	48066	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013422	ATCA	2	8	48134	48141	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013422	GGCG	2	8	51396	51403	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013422	AATC	2	8	63116	63123	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013422	GATT	2	8	63124	63131	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013422	AAAT	2	8	63482	63489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013422	TTTG	2	8	64071	64078	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013422	GCCC	2	8	79045	79052	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_013422	GTCT	2	8	79100	79107	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013422	GAAC	2	8	79511	79518	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013422	CCCG	2	8	82360	82367	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_013422	GGGT	2	8	82374	82381	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013422	TTTG	2	8	83338	83345	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013422	CCCG	2	8	84010	84017	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_013422	CTCA	2	8	84184	84191	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013422	TTTG	2	8	85286	85293	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013422	CCCG	2	8	86699	86706	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_013422	AAGA	2	8	86755	86762	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013422	TTTG	2	8	87349	87356	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013422	GGCA	2	8	87486	87493	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013422	CCCG	2	8	88279	88286	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_013422	AAGA	2	8	88336	88343	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013422	TTTG	2	8	88386	88393	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013422	GCCT	2	8	88510	88517	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013422	CCCG	2	8	89840	89847	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_013422	AAAG	2	8	89895	89902	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013422	GGCT	2	8	90083	90090	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013422	CCCG	2	8	90544	90551	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_013422	AAGA	2	8	90600	90607	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013422	ACCA	2	8	93584	93591	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013422	TTTG	2	8	94550	94557	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013422	AATG	2	8	99200	99207	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013422	TCAT	2	8	103654	103661	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013422	CTGT	2	8	113186	113193	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013422	ACTC	2	8	117515	117522	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013422	CAGA	2	8	117671	117678	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013422	ATTG	2	8	117805	117812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013422	AGCG	2	8	126465	126472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013422	GGGC	2	8	133177	133184	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013422	CACT	2	8	135067	135074	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013422	AGGA	2	8	135077	135084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013422	TAAG	2	8	146890	146897	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013422	AATC	2	8	146915	146922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_013422	ATTT	2	8	149396	149403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013422	TCGA	2	8	149544	149551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013422	CAAT	2	8	149689	149696	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013422	GGTT	2	8	149868	149875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013422	CCAT	2	8	150228	150235	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013422	GTTT	2	8	155064	155071	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013422	TGCG	2	8	158168	158175	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013422	ACCC	2	8	166117	166124	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_013422	CAAC	2	8	167245	167252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013422	CGGT	2	8	167980	167987	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013422	GTCG	2	8	169175	169182	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013422	CAGT	2	8	169193	169200	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013422	GGCG	2	8	169258	169265	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013422	TGAT	2	8	173014	173021	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013422	GGCC	2	8	174173	174180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013422	AATA	2	8	175700	175707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013422	TAAT	2	8	176425	176432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013422	GACC	2	8	177762	177769	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013422	AATA	2	8	182222	182229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013422	ATAG	2	8	186978	186985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013422	GAAC	2	8	193805	193812	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013422	TGGA	2	8	202838	202845	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013422	ATCG	2	8	203905	203912	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013422	CAGC	2	8	205971	205978	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013422	CCAT	2	8	212053	212060	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013422	TCTG	2	8	214358	214365	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013422	CTTA	2	8	214507	214514	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013422	GTCT	2	8	214625	214632	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013422	TTGT	2	8	216748	216755	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013422	CTAT	2	8	222886	222893	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_013422	TGTT	2	8	224097	224104	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013422	TTAT	2	8	225850	225857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013422	ATTA	2	8	225899	225906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013422	TTGG	2	8	232217	232224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013422	ATAA	2	8	233642	233649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013422	GGAA	2	8	244055	244062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013422	CCTC	2	8	245387	245394	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
96	NC_013422	GAGG	2	8	245408	245415	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013422	GCGG	2	8	245519	245526	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013422	GGTT	2	8	251694	251701	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013422	CAGG	2	8	251802	251809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013422	TCGC	2	8	252627	252634	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013422	GCGG	2	8	256147	256154	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013422	TTTC	2	8	257340	257347	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_013422	GGAT	2	8	266661	266668	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013422	TGAT	2	8	267677	267684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013422	GGGC	2	8	269130	269137	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013422	AGGC	2	8	274916	274923	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013422	CTGC	2	8	275919	275926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013422	TGTT	2	8	275966	275973	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013422	GCAT	2	8	299080	299087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013422	ATTT	2	8	299334	299341	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013422	GATT	2	8	299693	299700	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013422	TTGT	2	8	306791	306798	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013422	TGTT	2	8	308817	308824	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013422	AGTC	2	8	312862	312869	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013422	TGCC	2	8	313556	313563	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013422	CCAG	2	8	320829	320836	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013422	TCAA	2	8	323274	323281	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013422	TAAG	2	8	339365	339372	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013422	TGAA	2	8	351546	351553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013422	AATA	2	8	358344	358351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013422	ATTC	2	8	365984	365991	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013422	TAAA	2	8	366347	366354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013422	AATA	2	8	366395	366402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013422	GGTT	2	8	366860	366867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013422	CAAT	2	8	372013	372020	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013422	AGGC	2	8	377684	377691	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013422	GCGG	2	8	378027	378034	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013422	CCTG	2	8	378434	378441	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013422	AGTA	2	8	388509	388516	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013422	ATCA	2	8	389065	389072	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013422	CTTC	2	8	389461	389468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013422	GATA	2	8	391706	391713	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013422	TGAT	2	8	393126	393133	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013422	TGGG	2	8	393447	393454	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013422	GGAG	2	8	398332	398339	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013422	CAGA	2	8	399947	399954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_013422	TCAC	2	8	408439	408446	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013422	CGTC	2	8	408465	408472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013422	ATGG	2	8	414073	414080	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013422	CAAA	2	8	414603	414610	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_013422	AAAT	2	8	414611	414618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013422	ATTG	2	8	415616	415623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013422	TGTT	2	8	416690	416697	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013422	TAAA	2	8	423070	423077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013422	AAAC	2	8	427050	427057	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_013422	AAAC	2	8	427141	427148	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013422	GGCA	2	8	428232	428239	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_013422	TGCC	2	8	428250	428257	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_013422	TGAT	2	8	430420	430427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013422	GCGT	2	8	431053	431060	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_013422	TTCA	2	8	434563	434570	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_013422	TGTT	2	8	444330	444337	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_013422	ATCA	2	8	1277902	1277909	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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460	NC_013422	ATTA	2	8	1319316	1319323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_013422	ATCA	2	8	1320139	1320146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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471	NC_013422	ATCG	2	8	1367133	1367140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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482	NC_013422	AAAC	2	8	1394583	1394590	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
483	NC_013422	ATTC	2	8	1394649	1394656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
484	NC_013422	TAAA	2	8	1394871	1394878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_013422	CCAT	2	8	1395314	1395321	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
486	NC_013422	TGAA	2	8	1396456	1396463	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
487	NC_013422	TCGT	2	8	1397159	1397166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
488	NC_013422	ATCC	2	8	1397175	1397182	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
489	NC_013422	AAGA	2	8	1404372	1404379	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_013422	TTTA	2	8	1407147	1407154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_013422	GACA	2	8	1410525	1410532	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
493	NC_013422	AATT	2	8	1414102	1414109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
494	NC_013422	GAAA	2	8	1414264	1414271	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
495	NC_013422	CCTT	2	8	1414414	1414421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
496	NC_013422	GAAA	2	8	1427771	1427778	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
497	NC_013422	TTGA	2	8	1429008	1429015	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
498	NC_013422	CAAA	2	8	1429023	1429030	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
499	NC_013422	CATT	2	8	1429770	1429777	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
500	NC_013422	GATT	2	8	1433008	1433015	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

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