MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halothiobacillus neapolitanus c2 chromosome

Total Repeats: 4438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013422	GC	4	8	603	610	0 %	0 %	50 %	50 %	261854631
2	NC_013422	CG	3	6	1057	1062	0 %	0 %	50 %	50 %	261854631
3	NC_013422	GC	3	6	1344	1349	0 %	0 %	50 %	50 %	261854631
4	NC_013422	AC	3	6	1541	1546	50 %	0 %	0 %	50 %	261854631
5	NC_013422	AT	3	6	1552	1557	50 %	50 %	0 %	0 %	261854631
6	NC_013422	GT	3	6	1930	1935	0 %	50 %	50 %	0 %	261854632
7	NC_013422	GC	3	6	2432	2437	0 %	0 %	50 %	50 %	261854632
8	NC_013422	GC	3	6	2991	2996	0 %	0 %	50 %	50 %	261854633
9	NC_013422	GC	3	6	3241	3246	0 %	0 %	50 %	50 %	261854633
10	NC_013422	CA	3	6	3626	3631	50 %	0 %	0 %	50 %	261854633
11	NC_013422	CG	3	6	4734	4739	0 %	0 %	50 %	50 %	261854634
12	NC_013422	CG	3	6	4962	4967	0 %	0 %	50 %	50 %	261854634
13	NC_013422	CG	4	8	5226	5233	0 %	0 %	50 %	50 %	261854634
14	NC_013422	GC	3	6	5938	5943	0 %	0 %	50 %	50 %	261854634
15	NC_013422	GC	3	6	6024	6029	0 %	0 %	50 %	50 %	261854634
16	NC_013422	CG	4	8	6179	6186	0 %	0 %	50 %	50 %	261854634
17	NC_013422	GC	3	6	6205	6210	0 %	0 %	50 %	50 %	261854634
18	NC_013422	GC	3	6	6951	6956	0 %	0 %	50 %	50 %	261854635
19	NC_013422	CT	3	6	8735	8740	0 %	50 %	0 %	50 %	261854637
20	NC_013422	CG	3	6	10105	10110	0 %	0 %	50 %	50 %	261854638
21	NC_013422	AG	3	6	11120	11125	50 %	0 %	50 %	0 %	261854638
22	NC_013422	GC	3	6	11255	11260	0 %	0 %	50 %	50 %	261854638
23	NC_013422	GC	3	6	11365	11370	0 %	0 %	50 %	50 %	261854638
24	NC_013422	GC	3	6	11570	11575	0 %	0 %	50 %	50 %	261854638
25	NC_013422	GC	3	6	12601	12606	0 %	0 %	50 %	50 %	261854639
26	NC_013422	TC	4	8	13197	13204	0 %	50 %	0 %	50 %	261854640
27	NC_013422	GC	4	8	13486	13493	0 %	0 %	50 %	50 %	261854640
28	NC_013422	AC	3	6	13823	13828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013422	CG	3	6	14257	14262	0 %	0 %	50 %	50 %	261854641
30	NC_013422	GC	3	6	14948	14953	0 %	0 %	50 %	50 %	261854642
31	NC_013422	GT	3	6	15465	15470	0 %	50 %	50 %	0 %	261854642
32	NC_013422	AC	3	6	15928	15933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013422	AC	3	6	16099	16104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013422	TA	3	6	17722	17727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013422	GC	3	6	17978	17983	0 %	0 %	50 %	50 %	261854645
36	NC_013422	GT	3	6	18015	18020	0 %	50 %	50 %	0 %	261854645
37	NC_013422	GC	3	6	18465	18470	0 %	0 %	50 %	50 %	261854646
38	NC_013422	GC	3	6	18643	18648	0 %	0 %	50 %	50 %	261854646
39	NC_013422	GC	3	6	19153	19158	0 %	0 %	50 %	50 %	261854647
40	NC_013422	TC	3	6	19380	19385	0 %	50 %	0 %	50 %	261854647
41	NC_013422	CA	3	6	20740	20745	50 %	0 %	0 %	50 %	261854649
42	NC_013422	GC	3	6	22213	22218	0 %	0 %	50 %	50 %	261854649
43	NC_013422	CA	3	6	23223	23228	50 %	0 %	0 %	50 %	261854649
44	NC_013422	CA	3	6	23268	23273	50 %	0 %	0 %	50 %	261854649
45	NC_013422	CA	3	6	23605	23610	50 %	0 %	0 %	50 %	261854649
46	NC_013422	GC	3	6	24523	24528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013422	CA	3	6	24671	24676	50 %	0 %	0 %	50 %	261854650
48	NC_013422	GT	4	8	25964	25971	0 %	50 %	50 %	0 %	261854651
49	NC_013422	CA	3	6	26086	26091	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013422	GC	3	6	26495	26500	0 %	0 %	50 %	50 %	261854652
51	NC_013422	GT	3	6	27278	27283	0 %	50 %	50 %	0 %	261854654
52	NC_013422	CG	3	6	27856	27861	0 %	0 %	50 %	50 %	261854654
53	NC_013422	GA	3	6	28273	28278	50 %	0 %	50 %	0 %	261854654
54	NC_013422	CG	3	6	28312	28317	0 %	0 %	50 %	50 %	261854654
55	NC_013422	CG	4	8	28352	28359	0 %	0 %	50 %	50 %	261854654
56	NC_013422	AT	3	6	28507	28512	50 %	50 %	0 %	0 %	261854654
57	NC_013422	GC	3	6	28976	28981	0 %	0 %	50 %	50 %	261854654
58	NC_013422	CG	3	6	29518	29523	0 %	0 %	50 %	50 %	261854654
59	NC_013422	CG	3	6	29633	29638	0 %	0 %	50 %	50 %	261854654
60	NC_013422	TG	4	8	29666	29673	0 %	50 %	50 %	0 %	261854654
61	NC_013422	AC	3	6	30230	30235	50 %	0 %	0 %	50 %	261854655
62	NC_013422	GC	3	6	30274	30279	0 %	0 %	50 %	50 %	261854655
63	NC_013422	GC	3	6	31244	31249	0 %	0 %	50 %	50 %	261854656
64	NC_013422	GT	3	6	31755	31760	0 %	50 %	50 %	0 %	261854656
65	NC_013422	CG	3	6	31800	31805	0 %	0 %	50 %	50 %	261854656
66	NC_013422	GC	3	6	33354	33359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013422	TG	4	8	33582	33589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013422	GC	3	6	34072	34077	0 %	0 %	50 %	50 %	261854658
69	NC_013422	GC	3	6	34140	34145	0 %	0 %	50 %	50 %	261854658
70	NC_013422	GC	3	6	34267	34272	0 %	0 %	50 %	50 %	261854658
71	NC_013422	GC	3	6	34519	34524	0 %	0 %	50 %	50 %	261854659
72	NC_013422	GC	3	6	34803	34808	0 %	0 %	50 %	50 %	261854659
73	NC_013422	CG	3	6	35355	35360	0 %	0 %	50 %	50 %	261854659
74	NC_013422	TG	3	6	35369	35374	0 %	50 %	50 %	0 %	261854659
75	NC_013422	TG	3	6	36148	36153	0 %	50 %	50 %	0 %	261854660
76	NC_013422	GC	3	6	36608	36613	0 %	0 %	50 %	50 %	261854660
77	NC_013422	GC	3	6	37015	37020	0 %	0 %	50 %	50 %	261854660
78	NC_013422	TC	3	6	37316	37321	0 %	50 %	0 %	50 %	261854660
79	NC_013422	AT	3	6	37602	37607	50 %	50 %	0 %	0 %	261854660
80	NC_013422	GA	3	6	38561	38566	50 %	0 %	50 %	0 %	261854662
81	NC_013422	CG	3	6	38675	38680	0 %	0 %	50 %	50 %	261854662
82	NC_013422	GT	3	6	38789	38794	0 %	50 %	50 %	0 %	261854662
83	NC_013422	AC	3	6	39192	39197	50 %	0 %	0 %	50 %	261854662
84	NC_013422	CG	3	6	39271	39276	0 %	0 %	50 %	50 %	261854662
85	NC_013422	GC	3	6	39407	39412	0 %	0 %	50 %	50 %	261854662
86	NC_013422	CG	3	6	39625	39630	0 %	0 %	50 %	50 %	261854663
87	NC_013422	AG	3	6	40400	40405	50 %	0 %	50 %	0 %	261854663
88	NC_013422	GC	4	8	40638	40645	0 %	0 %	50 %	50 %	261854663
89	NC_013422	CG	3	6	41418	41423	0 %	0 %	50 %	50 %	261854663
90	NC_013422	TC	4	8	42786	42793	0 %	50 %	0 %	50 %	261854666
91	NC_013422	CG	4	8	42821	42828	0 %	0 %	50 %	50 %	261854666
92	NC_013422	GC	3	6	42994	42999	0 %	0 %	50 %	50 %	261854666
93	NC_013422	GC	4	8	43945	43952	0 %	0 %	50 %	50 %	261854667
94	NC_013422	TC	3	6	44860	44865	0 %	50 %	0 %	50 %	261854668
95	NC_013422	GT	3	6	46594	46599	0 %	50 %	50 %	0 %	261854670
96	NC_013422	AG	3	6	47217	47222	50 %	0 %	50 %	0 %	261854670
97	NC_013422	GC	3	6	48787	48792	0 %	0 %	50 %	50 %	261854672
98	NC_013422	CG	3	6	49583	49588	0 %	0 %	50 %	50 %	261854672
99	NC_013422	GC	4	8	49637	49644	0 %	0 %	50 %	50 %	261854672
100	NC_013422	CG	3	6	52076	52081	0 %	0 %	50 %	50 %	261854674
101	NC_013422	TG	3	6	52111	52116	0 %	50 %	50 %	0 %	261854674
102	NC_013422	GT	3	6	53104	53109	0 %	50 %	50 %	0 %	261854675
103	NC_013422	CG	3	6	53164	53169	0 %	0 %	50 %	50 %	261854675
104	NC_013422	CA	3	6	54240	54245	50 %	0 %	0 %	50 %	261854676
105	NC_013422	CG	3	6	55079	55084	0 %	0 %	50 %	50 %	261854678
106	NC_013422	AG	3	6	55110	55115	50 %	0 %	50 %	0 %	261854678
107	NC_013422	GC	3	6	55417	55422	0 %	0 %	50 %	50 %	261854678
108	NC_013422	CA	3	6	55515	55520	50 %	0 %	0 %	50 %	261854678
109	NC_013422	CG	3	6	56538	56543	0 %	0 %	50 %	50 %	261854680
110	NC_013422	GC	3	6	56698	56703	0 %	0 %	50 %	50 %	261854680
111	NC_013422	GA	3	6	56856	56861	50 %	0 %	50 %	0 %	261854680
112	NC_013422	GT	3	6	57548	57553	0 %	50 %	50 %	0 %	261854680
113	NC_013422	GC	3	6	57716	57721	0 %	0 %	50 %	50 %	261854680
114	NC_013422	GC	3	6	57898	57903	0 %	0 %	50 %	50 %	261854681
115	NC_013422	CT	3	6	57962	57967	0 %	50 %	0 %	50 %	261854681
116	NC_013422	CG	3	6	58151	58156	0 %	0 %	50 %	50 %	261854681
117	NC_013422	CG	3	6	58606	58611	0 %	0 %	50 %	50 %	261854681
118	NC_013422	GT	3	6	59312	59317	0 %	50 %	50 %	0 %	261854682
119	NC_013422	AC	3	6	59385	59390	50 %	0 %	0 %	50 %	261854682
120	NC_013422	TG	3	6	59662	59667	0 %	50 %	50 %	0 %	261854682
121	NC_013422	CG	3	6	59805	59810	0 %	0 %	50 %	50 %	261854682
122	NC_013422	GC	3	6	61915	61920	0 %	0 %	50 %	50 %	261854683
123	NC_013422	AG	3	6	62102	62107	50 %	0 %	50 %	0 %	261854684
124	NC_013422	CG	3	6	62571	62576	0 %	0 %	50 %	50 %	261854685
125	NC_013422	GC	3	6	62793	62798	0 %	0 %	50 %	50 %	261854685
126	NC_013422	GA	3	6	62935	62940	50 %	0 %	50 %	0 %	261854685
127	NC_013422	CG	3	6	64261	64266	0 %	0 %	50 %	50 %	261854687
128	NC_013422	GA	3	6	64332	64337	50 %	0 %	50 %	0 %	261854687
129	NC_013422	CG	3	6	64580	64585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013422	GT	3	6	64713	64718	0 %	50 %	50 %	0 %	261854688
131	NC_013422	GC	3	6	65813	65818	0 %	0 %	50 %	50 %	261854688
132	NC_013422	CG	3	6	66608	66613	0 %	0 %	50 %	50 %	261854688
133	NC_013422	GC	3	6	67038	67043	0 %	0 %	50 %	50 %	261854688
134	NC_013422	GC	3	6	67096	67101	0 %	0 %	50 %	50 %	261854688
135	NC_013422	GC	4	8	67255	67262	0 %	0 %	50 %	50 %	261854688
136	NC_013422	CG	3	6	67617	67622	0 %	0 %	50 %	50 %	261854689
137	NC_013422	CA	3	6	67717	67722	50 %	0 %	0 %	50 %	261854689
138	NC_013422	TC	3	6	67997	68002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013422	CG	3	6	68062	68067	0 %	0 %	50 %	50 %	261854690
140	NC_013422	CG	4	8	68774	68781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013422	CA	3	6	69251	69256	50 %	0 %	0 %	50 %	261854692
142	NC_013422	CG	3	6	69322	69327	0 %	0 %	50 %	50 %	261854692
143	NC_013422	GC	3	6	69794	69799	0 %	0 %	50 %	50 %	261854692
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