MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Periplaneta americana) str. BPLAN

Total Repeats: 357

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013418	AAATAG	2	12	254	265	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261749099
2	NC_013418	TAGAAA	2	12	4466	4477	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261749101
3	NC_013418	TTTAAA	2	12	5217	5228	50 %	50 %	0 %	0 %	261749101
4	NC_013418	AAATAG	2	12	7849	7860	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261749104
5	NC_013418	TAGGAA	2	12	8457	8468	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	261749104
6	NC_013418	TGGAAA	2	12	9192	9203	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	261749105
7	NC_013418	TTATTT	2	12	10057	10068	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261749106
8	NC_013418	TGTTGA	2	12	10508	10519	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	261749107
9	NC_013418	TTCCTT	2	12	10532	10543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261749107
10	NC_013418	AAAGAA	2	12	10912	10923	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	261749107
11	NC_013418	TCAAAA	2	12	14011	14022	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	261749109
12	NC_013418	TTTTTC	2	12	15545	15556	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	261749111
13	NC_013418	GAATTT	2	12	18008	18019	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	261749113
14	NC_013418	TATTTT	2	12	18194	18205	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261749113
15	NC_013418	TCAAAT	2	12	18508	18519	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	261749113
16	NC_013418	TCTCTA	2	12	19729	19740	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	261749113
17	NC_013418	TTAACA	2	12	19879	19890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	261749113
18	NC_013418	ATATCT	2	12	20166	20177	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	261749114
19	NC_013418	TAGATT	2	12	20230	20241	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	261749114
20	NC_013418	TATTTT	2	12	22632	22643	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261749117
21	NC_013418	AAAAGC	2	12	23289	23300	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	261749118
22	NC_013418	GCTGTA	2	12	24064	24075	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	261749118
23	NC_013418	TAATAT	2	12	25290	25301	50 %	50 %	0 %	0 %	261749119
24	NC_013418	ATTAGG	2	12	26672	26683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261749120
25	NC_013418	TATGGA	2	12	27130	27141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261749120
26	NC_013418	TTATTT	2	12	27247	27258	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261749120
27	NC_013418	GGAAAA	2	12	27632	27643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261749120
28	NC_013418	AACAGC	2	12	29762	29773	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	261749122
29	NC_013418	AAAGAG	2	12	30304	30315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261749122
30	NC_013418	AATAAA	2	12	30509	30520	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	261749122
31	NC_013418	ACTAAA	2	12	32602	32613	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	261749123
32	NC_013418	TTTCAA	2	12	34652	34663	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	261749124
33	NC_013418	TCAATT	2	12	35326	35337	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	261749124
34	NC_013418	GATAAT	2	12	35565	35576	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	261749124
35	NC_013418	GTTTTT	2	12	35706	35717	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	261749124
36	NC_013418	AATAAA	2	12	36083	36094	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	261749124
37	NC_013418	TTTTAA	2	12	40813	40824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261749127
38	NC_013418	TCCATG	2	12	44473	44484	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	261749131
39	NC_013418	ACTTTT	2	12	44559	44570	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	261749131
40	NC_013418	AAAAGT	2	12	46576	46587	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261749133
41	NC_013418	TAAAAA	2	12	48144	48155	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	261749135
42	NC_013418	TATGAA	2	12	48391	48402	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	261749135
43	NC_013418	CAATTA	2	12	50979	50990	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	261749136
44	NC_013418	AAAAAT	2	12	54135	54146	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	261749137
45	NC_013418	TCGTAT	2	12	56272	56283	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	261749138
46	NC_013418	ACTTTA	2	12	56375	56386	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	261749138
47	NC_013418	TTACTA	2	12	58079	58090	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	261749139
48	NC_013418	GCTATA	2	12	58579	58590	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	261749140
49	NC_013418	TAAAAT	2	12	61469	61480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261749142
50	NC_013418	AAAAGA	2	12	63197	63208	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	261749143
51	NC_013418	TAGAAA	2	12	65573	65584	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261749145
52	NC_013418	TTCCTT	2	12	66849	66860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261749147
53	NC_013418	GCTTTA	2	12	66884	66895	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	261749147
54	NC_013418	TCTATT	2	12	68469	68480	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	261749149
55	NC_013418	AGAAAA	2	12	73206	73217	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	261749152
56	NC_013418	ACAGGA	2	12	73861	73872	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	261749152
57	NC_013418	AAAAGA	2	12	74283	74294	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	261749152
58	NC_013418	TTAAAA	2	12	82399	82410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261749160
59	NC_013418	ATAAAT	2	12	84851	84862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261749163
60	NC_013418	ATTTTT	2	12	88023	88034	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261749166
61	NC_013418	AATGAA	2	12	88053	88064	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261749166
62	NC_013418	TTATTT	2	12	88864	88875	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261749166
63	NC_013418	GGATAT	2	12	93680	93691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261749172
64	NC_013418	GAAAAA	2	12	94103	94114	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	261749173
65	NC_013418	TTTGGA	2	12	94859	94870	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	261749174
66	NC_013418	GTAAAA	2	12	94964	94975	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261749174
67	NC_013418	CTGGAA	2	12	95103	95114	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	261749174
68	NC_013418	TTAGGA	2	12	99688	99699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261749177
69	NC_013418	AGATAT	2	12	101438	101449	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	261749179
70	NC_013418	AAGGAA	2	12	101503	101514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261749179
71	NC_013418	TATAGG	2	12	101576	101587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261749179
72	NC_013418	GAATAT	2	12	104272	104283	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	261749181
73	NC_013418	TAAAAA	2	12	104932	104943	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	261749181
74	NC_013418	ATTAGG	2	12	104968	104979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261749181
75	NC_013418	AAAAAT	2	12	106645	106656	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	261749183
76	NC_013418	AATAAA	2	12	108123	108134	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	261749184
77	NC_013418	TTCTAA	2	12	108707	108718	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	261749184
78	NC_013418	ATTTCT	2	12	113570	113581	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	261749191
79	NC_013418	TACATA	2	12	114474	114485	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	261749191
80	NC_013418	AATAAA	2	12	114611	114622	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	261749191
81	NC_013418	ATACTC	2	12	116716	116727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261749194
82	NC_013418	GAACTT	2	12	118807	118818	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	261749195
83	NC_013418	AGCAGA	2	12	121166	121177	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	261749197
84	NC_013418	AAGATG	2	12	122612	122623	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	261749200
85	NC_013418	AAAACT	2	12	123698	123709	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	261749201
86	NC_013418	ATTCCA	2	12	124787	124798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261749201
87	NC_013418	TATTTG	2	12	125114	125125	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	261749202
88	NC_013418	ATATTT	2	12	126438	126449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261749205
89	NC_013418	AAATTT	2	12	127008	127019	50 %	50 %	0 %	0 %	261749206
90	NC_013418	TTGAGA	2	12	130188	130199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261749208
91	NC_013418	AGAAGG	2	12	131890	131901	50 %	0 %	50 %	0 %	261749210
92	NC_013418	GAAAAA	2	12	132233	132244	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	261749210
93	NC_013418	TAGATT	2	12	134505	134516	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	261749213
94	NC_013418	TTTTCT	2	12	140403	140414	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	261749218
95	NC_013418	AATAGA	2	12	143948	143959	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261749223
96	NC_013418	AAAATG	2	12	145420	145431	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261749224
97	NC_013418	AGAAAA	2	12	148449	148460	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	261749225
98	NC_013418	TTTTCC	2	12	149923	149934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261749227
99	NC_013418	TAAAAG	2	12	153178	153189	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261749230
100	NC_013418	TTTTTC	2	12	153847	153858	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	261749231
101	NC_013418	AAAAGA	2	12	153859	153870	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	261749231
102	NC_013418	AATTCA	2	12	154980	154991	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	261749233
103	NC_013418	TAGCTA	2	12	155588	155599	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	261749233
104	NC_013418	AAAAGA	2	12	158307	158318	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	261749234
105	NC_013418	TAGGAT	2	12	160276	160287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261749235
106	NC_013418	GGAAAA	2	12	162396	162407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261749238
107	NC_013418	AGAATT	2	12	164881	164892	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	261749239
108	NC_013418	AAAGAA	2	12	174575	174586	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	261749246
109	NC_013418	GAAAAA	3	18	176816	176833	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	261749248
110	NC_013418	TCCTGG	2	12	177217	177228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261749248
111	NC_013418	TAGAAA	2	12	183818	183829	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261749252
112	NC_013418	ATTTTT	2	12	184916	184927	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261749253
113	NC_013418	GCTGGA	2	12	186104	186115	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	261749254
114	NC_013418	TAGGAA	2	12	186357	186368	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	261749254
115	NC_013418	GTAGCT	2	12	187348	187359	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	261749255
116	NC_013418	TTTTTC	2	12	188299	188310	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	261749257
117	NC_013418	AGGATA	2	12	197556	197567	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	261749268
118	NC_013418	AGAAAA	2	12	198266	198277	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	261749269
119	NC_013418	ATATTT	2	12	199257	199268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261749269
120	NC_013418	ATTTTT	2	12	200426	200437	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261749270
121	NC_013418	TTTTAA	2	12	202609	202620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261749272
122	NC_013418	ATTTTT	2	12	203141	203152	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261749272
123	NC_013418	ATCTAT	2	12	203302	203313	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	261749272
124	NC_013418	ATATTT	2	12	203504	203515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261749272
125	NC_013418	AGAAAA	2	12	206550	206561	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	261749274
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144	NC_013418	ATCCTG	2	12	247045	247056	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	261749316
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149	NC_013418	ATTTTT	2	12	250953	250964	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261749321
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228	NC_013418	ATTTTC	2	12	395708	395719	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	261749438
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230	NC_013418	CATCCT	2	12	399248	399259	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	261749443
231	NC_013418	TACGCA	2	12	401218	401229	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	261749445
232	NC_013418	TTTTTG	2	12	402579	402590	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	261749446
233	NC_013418	CTTTTA	2	12	402749	402760	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	261749447
234	NC_013418	TTGTTT	2	12	403429	403440	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	261749449
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351	NC_013418	AAATCC	2	12	615973	615984	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	261749650
352	NC_013418	AATCAA	2	12	619980	619991	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	261749654
353	NC_013418	GAAAAA	2	12	621141	621152	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	261749655
354	NC_013418	AATATA	2	12	629276	629287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261749665
355	NC_013418	ATAAAA	2	12	633082	633093	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	261749670
356	NC_013418	AAGATC	2	12	634389	634400	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	261749672
357	NC_013418	TGGATC	2	12	635135	635146	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	261749673

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.