MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Periplaneta americana) str. BPLAN

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013418	ATTTA	2	10	10448	10457	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013418	TTCAA	2	10	17152	17161	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013418	AAAAT	2	10	17170	17179	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013418	ATCAT	2	10	26307	26316	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013418	TCTAA	2	10	26481	26490	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013418	TTGTC	2	10	40554	40563	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013418	AATAG	2	10	79418	79427	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013418	TTTAT	2	10	83617	83626	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013418	TTCAA	2	10	87894	87903	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013418	AGAAA	2	10	102115	102124	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013418	TTAGA	2	10	103722	103731	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013418	AATAG	2	10	119079	119088	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013418	ACAAT	2	10	130819	130828	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013418	ATGGA	2	10	138758	138767	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013418	GAAAA	2	10	142204	142213	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013418	AATCC	2	10	149647	149656	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_013418	ATTTT	2	10	154760	154769	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013418	TTAAT	2	10	163677	163686	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013418	GTATA	2	10	173197	173206	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013418	TTTAT	2	10	176015	176024	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013418	AATTT	2	10	179518	179527	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013418	AAAAT	2	10	192003	192012	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013418	ATTAG	2	10	212880	212889	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013418	TTTTA	2	10	225697	225706	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013418	CCTTT	2	10	236849	236858	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_013418	AAAAT	2	10	239483	239492	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013418	AAATT	2	10	250086	250095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013418	ATTTT	2	10	254200	254209	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013418	ATCAT	2	10	254679	254688	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013418	TCAAA	2	10	263726	263735	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013418	TTAGT	2	10	278175	278184	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013418	AAATA	2	10	280905	280914	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013418	CTTTA	2	10	294753	294762	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013418	ATATT	2	10	311316	311325	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013418	TGAAA	2	10	312176	312185	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013418	GATCT	2	10	313497	313506	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_013418	ACTAA	2	10	323104	323113	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013418	ATAGG	2	10	326200	326209	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013418	AAAAT	2	10	332272	332281	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013418	AATAG	2	10	335063	335072	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013418	TTCAA	2	10	335142	335151	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_013418	TCTTA	2	10	337076	337085	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_013418	TTCAT	2	10	355258	355267	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013418	TTTTC	2	10	361727	361736	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_013418	TATGT	2	10	361963	361972	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013418	ATATT	2	10	374351	374360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013418	ATCTC	2	10	390762	390771	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_013418	CCTTT	2	10	391892	391901	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_013418	ATCAA	2	10	392747	392756	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013418	ATTAT	2	10	417062	417071	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013418	GATGT	2	10	432350	432359	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013418	ATTTT	2	10	441668	441677	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013418	TCCAT	2	10	443127	443136	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_013418	ATATT	2	10	448277	448286	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013418	TTTTA	2	10	477168	477177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013418	TTTAT	2	10	479027	479036	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013418	TCCCG	2	10	486438	486447	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_013418	AGAAT	2	10	498764	498773	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013418	TATTT	2	10	498955	498964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013418	TGAAA	2	10	504708	504717	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013418	TAAAT	2	10	505077	505086	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013418	ATTTT	2	10	524229	524238	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013418	AAAGA	2	10	537623	537632	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013418	CTAAA	2	10	540457	540466	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013418	ATTAA	2	10	556504	556513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013418	TATAA	2	10	589608	589617	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013418	TTTTC	2	10	594749	594758	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013418	AAAAC	2	10	620908	620917	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_013418	AATTT	2	10	633735	633744	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.