MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Periplaneta americana) str. BPLAN

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013418	AAAG	2	8	37590	37597	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013418	CTTT	2	8	38212	38219	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013418	ATCT	2	8	40316	40323	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013418	TTAC	2	8	41380	41387	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013418	ATAA	2	8	41418	41425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013418	AAAT	2	8	42941	42948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013418	TGTT	2	8	44682	44689	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013418	TATT	2	8	44690	44697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013418	TTTA	2	8	45824	45831	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013418	ATTA	2	8	59821	59828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013418	AAAC	2	8	59977	59984	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013418	TTTA	2	8	63371	63378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013418	ATTT	2	8	72087	72094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013418	AAAT	2	8	79401	79408	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013418	CTTA	2	8	82003	82010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013418	ATTT	2	8	90341	90348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013418	ATTT	2	8	96937	96944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013418	AAAT	2	8	97105	97112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013418	TAAA	2	8	101012	101019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013418	AATT	3	12	102079	102090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013418	AATA	2	8	103566	103573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013418	AATA	2	8	103893	103900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013418	TTAC	2	8	104088	104095	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013418	ATTT	2	8	104216	104223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013418	ATCT	2	8	114805	114812	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013418	TTTA	2	8	126691	126698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013418	AGAA	2	8	127593	127600	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013418	TTAT	2	8	127776	127783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013418	AATT	2	8	130835	130842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013418	AGAA	2	8	134571	134578	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013418	GTAA	2	8	137103	137110	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013418	AATA	2	8	139421	139428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013418	AATT	2	8	139444	139451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013418	ATTT	2	8	139477	139484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013418	TAAT	2	8	140831	140838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013418	AATA	2	8	140942	140949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013418	AGAA	2	8	142174	142181	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013418	ATAA	2	8	146114	146121	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013418	ATTT	2	8	154631	154638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013418	AATA	2	8	160441	160448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013418	AGAA	2	8	163664	163671	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013418	TTTA	2	8	173187	173194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013418	TCTT	2	8	194090	194097	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013418	TCAT	2	8	199323	199330	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013418	TCAT	2	8	199383	199390	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013418	TAAT	2	8	203696	203703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013418	AATA	2	8	203704	203711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013418	TCTT	2	8	225840	225847	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013418	GACT	2	8	236865	236872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013418	ATAA	2	8	236930	236937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013418	TACT	2	8	246120	246127	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013418	TTAC	2	8	250120	250127	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013418	TGTT	2	8	254172	254179	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013418	ATCT	2	8	256792	256799	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013418	TAAA	2	8	283951	283958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013418	GTTT	2	8	290620	290627	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013418	TCAT	2	8	292650	292657	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013418	TAAT	2	8	298657	298664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013418	GATT	2	8	301432	301439	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013418	TAAA	2	8	302764	302771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013418	TAAA	2	8	306004	306011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013418	AAAT	2	8	308726	308733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013418	AATC	2	8	317459	317466	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_013418	GTAC	2	8	317484	317491	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013418	ATTT	2	8	317635	317642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013418	TAAG	2	8	326220	326227	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013418	ATTA	2	8	329977	329984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013418	TGGA	2	8	329985	329992	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013418	ATTC	2	8	330014	330021	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013418	CTTT	2	8	330069	330076	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013418	TTAT	2	8	332190	332197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013418	AAAG	2	8	335103	335110	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013418	TAAT	2	8	335113	335120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013418	TTTA	2	8	337151	337158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013418	TATT	2	8	337199	337206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013418	ATTT	2	8	338453	338460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013418	ACTT	2	8	355221	355228	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013418	GATA	3	12	355235	355246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013418	AATA	2	8	355274	355281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013418	ATAG	2	8	359313	359320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013418	TTGA	2	8	359719	359726	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013418	TCCG	2	8	360450	360457	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013418	CTGT	2	8	360847	360854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013418	TGAT	2	8	361590	361597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013418	TCGC	2	8	361696	361703	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013418	CTAT	2	8	361947	361954	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013418	AATC	2	8	362152	362159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013418	TCCG	2	8	362719	362726	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013418	AACT	2	8	363497	363504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013418	ACGC	2	8	363511	363518	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013418	TACG	2	8	363625	363632	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013418	TTTC	2	8	370498	370505	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013418	TATT	2	8	371875	371882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013418	ATTT	2	8	378213	378220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013418	ATTA	2	8	381855	381862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013418	GTAT	2	8	385635	385642	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013418	CATT	2	8	385704	385711	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013418	TCTA	2	8	385771	385778	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013418	ATAA	2	8	390473	390480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013418	TCCA	2	8	390558	390565	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013418	AGAA	2	8	390929	390936	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013418	TAAT	2	8	391092	391099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013418	TGTA	2	8	391289	391296	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013418	CTTT	2	8	391445	391452	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013418	AGAT	2	8	391582	391589	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013418	ATTC	2	8	392680	392687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013418	ATTT	2	8	399239	399246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013418	ATTT	2	8	427469	427476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013418	AGAA	2	8	432235	432242	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013418	TTTA	2	8	436674	436681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013418	AACG	2	8	436691	436698	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013418	AAAT	2	8	440256	440263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013418	TCAT	2	8	441694	441701	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013418	TAAA	2	8	447264	447271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013418	AATA	2	8	447856	447863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013418	TAAA	2	8	448303	448310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013418	TATT	2	8	451149	451156	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013418	ATTA	2	8	452964	452971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013418	ACAA	2	8	455832	455839	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013418	TTAA	2	8	459616	459623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013418	TTAA	2	8	459630	459637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013418	TTCA	2	8	478760	478767	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013418	ACTA	2	8	479058	479065	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013418	AGGT	2	8	479074	479081	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013418	ATTT	2	8	483680	483687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013418	TAAA	2	8	488017	488024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013418	AATT	2	8	490299	490306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013418	CTTT	2	8	493140	493147	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013418	ATTT	2	8	497586	497593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013418	TAGT	2	8	498783	498790	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013418	TAAA	2	8	501568	501575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013418	TAAA	2	8	513649	513656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013418	TCAA	2	8	516050	516057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013418	AACT	2	8	516095	516102	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_013418	AAAG	2	8	520727	520734	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013418	TATT	2	8	540442	540449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013418	ATAA	2	8	543173	543180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013418	TGCA	2	8	545761	545768	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013418	AATA	2	8	554392	554399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013418	AAAG	2	8	556346	556353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013418	CCAT	2	8	556455	556462	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013418	GTAG	2	8	563880	563887	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013418	TCAA	2	8	587876	587883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_013418	ACTA	2	8	589746	589753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_013418	GCAA	2	8	589761	589768	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_013418	TAAA	2	8	589843	589850	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013418	TTAT	2	8	589857	589864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013418	AATT	2	8	596001	596008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013418	TTTG	2	8	605637	605644	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013418	TAAA	2	8	606764	606771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013418	AAGT	2	8	607852	607859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013418	CTAT	2	8	607963	607970	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_013418	TTAA	2	8	612685	612692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013418	TAAA	3	12	618577	618588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_013418	ATTA	2	8	618595	618602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_013418	GAAT	2	8	620530	620537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013418	AAAG	2	8	620871	620878	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013418	AAGA	2	8	622396	622403	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013418	TATT	2	8	626425	626432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013418	GGGA	2	8	626526	626533	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.