MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 1280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013416	TAAAA	2	10	2206	2215	80 %	20 %	0 %	0 %	261866725
2	NC_013416	GGCTT	2	10	2357	2366	0 %	40 %	40 %	20 %	261866725
3	NC_013416	GTTGC	2	10	3591	3600	0 %	40 %	40 %	20 %	261866726
4	NC_013416	AGCGA	2	10	7842	7851	40 %	0 %	40 %	20 %	261866732
5	NC_013416	TACAC	2	10	8960	8969	40 %	20 %	0 %	40 %	261866733
6	NC_013416	CCTTG	2	10	9411	9420	0 %	40 %	20 %	40 %	261866734
7	NC_013416	TCATC	2	10	9530	9539	20 %	40 %	0 %	40 %	261866735
8	NC_013416	CGGCG	2	10	9561	9570	0 %	0 %	60 %	40 %	261866735
9	NC_013416	CGGCT	2	10	10363	10372	0 %	20 %	40 %	40 %	261866737
10	NC_013416	CGGCG	2	10	11215	11224	0 %	0 %	60 %	40 %	261866738
11	NC_013416	AACTG	2	10	11884	11893	40 %	20 %	20 %	20 %	261866739
12	NC_013416	CCGCC	2	10	11956	11965	0 %	0 %	20 %	80 %	261866739
13	NC_013416	TGAAT	2	10	15031	15040	40 %	40 %	20 %	0 %	261866744
14	NC_013416	GGCAT	2	10	15671	15680	20 %	20 %	40 %	20 %	261866744
15	NC_013416	GTGCG	2	10	17141	17150	0 %	20 %	60 %	20 %	261866746
16	NC_013416	TTCAT	2	10	18285	18294	20 %	60 %	0 %	20 %	261866748
17	NC_013416	CTGCC	2	10	18371	18380	0 %	20 %	20 %	60 %	261866748
18	NC_013416	TCAGG	2	10	24765	24774	20 %	20 %	40 %	20 %	261866754
19	NC_013416	ACAGA	2	10	25776	25785	60 %	0 %	20 %	20 %	261866755
20	NC_013416	TCAAG	2	10	26078	26087	40 %	20 %	20 %	20 %	261866755
21	NC_013416	GATTG	2	10	26974	26983	20 %	40 %	40 %	0 %	261866756
22	NC_013416	GCTTT	2	10	27539	27548	0 %	60 %	20 %	20 %	261866756
23	NC_013416	ATCAA	2	10	38443	38452	60 %	20 %	0 %	20 %	261866767
24	NC_013416	GTACC	2	10	40733	40742	20 %	20 %	20 %	40 %	261866769
25	NC_013416	TGGCA	2	10	41528	41537	20 %	20 %	40 %	20 %	261866769
26	NC_013416	TCCGC	2	10	41657	41666	0 %	20 %	20 %	60 %	261866769
27	NC_013416	GACGA	2	10	43359	43368	40 %	0 %	40 %	20 %	261866774
28	NC_013416	GAACA	2	10	44142	44151	60 %	0 %	20 %	20 %	261866776
29	NC_013416	TCTTT	2	10	49615	49624	0 %	80 %	0 %	20 %	261866784
30	NC_013416	CCGTA	2	10	50717	50726	20 %	20 %	20 %	40 %	261866784
31	NC_013416	GCATT	2	10	59267	59276	20 %	40 %	20 %	20 %	261866789
32	NC_013416	GCCGT	2	10	66909	66918	0 %	20 %	40 %	40 %	261866800
33	NC_013416	AAAGC	2	10	67968	67977	60 %	0 %	20 %	20 %	261866801
34	NC_013416	GCGCC	2	10	70092	70101	0 %	0 %	40 %	60 %	261866803
35	NC_013416	GCCTT	2	10	70716	70725	0 %	40 %	20 %	40 %	261866804
36	NC_013416	CAATG	2	10	71579	71588	40 %	20 %	20 %	20 %	261866804
37	NC_013416	TGGAA	2	10	73037	73046	40 %	20 %	40 %	0 %	261866806
38	NC_013416	TGGAC	2	10	74305	74314	20 %	20 %	40 %	20 %	261866807
39	NC_013416	TTTTG	2	10	80001	80010	0 %	80 %	20 %	0 %	261866814
40	NC_013416	CGAAG	2	10	80741	80750	40 %	0 %	40 %	20 %	261866815
41	NC_013416	CAAAG	2	10	80820	80829	60 %	0 %	20 %	20 %	261866815
42	NC_013416	CAAAA	2	10	80835	80844	80 %	0 %	0 %	20 %	261866815
43	NC_013416	GGTGT	2	10	81447	81456	0 %	40 %	60 %	0 %	261866815
44	NC_013416	ATTAT	2	10	81863	81872	40 %	60 %	0 %	0 %	261866816
45	NC_013416	ATTTC	2	10	83345	83354	20 %	60 %	0 %	20 %	261866819
46	NC_013416	CGCAC	2	10	86783	86792	20 %	0 %	20 %	60 %	261866823
47	NC_013416	TTTGC	2	10	87743	87752	0 %	60 %	20 %	20 %	261866823
48	NC_013416	CAGCG	2	10	88182	88191	20 %	0 %	40 %	40 %	261866824
49	NC_013416	TTTGC	2	10	100046	100055	0 %	60 %	20 %	20 %	261866833
50	NC_013416	CGAAA	2	10	101982	101991	60 %	0 %	20 %	20 %	261866836
51	NC_013416	AATCC	2	10	107273	107282	40 %	20 %	0 %	40 %	261866840
52	NC_013416	CTTGA	2	10	107503	107512	20 %	40 %	20 %	20 %	261866840
53	NC_013416	TTATC	2	10	107692	107701	20 %	60 %	0 %	20 %	261866840
54	NC_013416	AAAAC	2	10	107725	107734	80 %	0 %	0 %	20 %	261866840
55	NC_013416	ATTAC	2	10	109621	109630	40 %	40 %	0 %	20 %	261866841
56	NC_013416	AAAAC	2	10	109769	109778	80 %	0 %	0 %	20 %	261866841
57	NC_013416	TCAAT	2	10	109952	109961	40 %	40 %	0 %	20 %	261866841
58	NC_013416	TTATT	2	10	111055	111064	20 %	80 %	0 %	0 %	261866842
59	NC_013416	ATTTT	2	10	113831	113840	20 %	80 %	0 %	0 %	261866846
60	NC_013416	CTGAT	2	10	116113	116122	20 %	40 %	20 %	20 %	261866847
61	NC_013416	TCCAA	2	10	117562	117571	40 %	20 %	0 %	40 %	261866847
62	NC_013416	TTTGG	2	10	119652	119661	0 %	60 %	40 %	0 %	261866850
63	NC_013416	TAACT	2	10	123404	123413	40 %	40 %	0 %	20 %	261866853
64	NC_013416	TCCGC	2	10	126413	126422	0 %	20 %	20 %	60 %	261866856
65	NC_013416	TCGGT	2	10	127164	127173	0 %	40 %	40 %	20 %	261866857
66	NC_013416	TCCGA	2	10	127592	127601	20 %	20 %	20 %	40 %	261866857
67	NC_013416	GAATG	2	10	129036	129045	40 %	20 %	40 %	0 %	261866858
68	NC_013416	AAAGC	2	10	130141	130150	60 %	0 %	20 %	20 %	261866859
69	NC_013416	TTGAT	2	10	130287	130296	20 %	60 %	20 %	0 %	261866860
70	NC_013416	TGGCG	2	10	130542	130551	0 %	20 %	60 %	20 %	261866860
71	NC_013416	TTCGG	2	10	133063	133072	0 %	40 %	40 %	20 %	261866862
72	NC_013416	GCAAT	2	10	134012	134021	40 %	20 %	20 %	20 %	261866862
73	NC_013416	ATTCC	2	10	135196	135205	20 %	40 %	0 %	40 %	261866865
74	NC_013416	CTGCG	2	10	137416	137425	0 %	20 %	40 %	40 %	261866868
75	NC_013416	AAAAC	2	10	138773	138782	80 %	0 %	0 %	20 %	261866870
76	NC_013416	TTTTC	2	10	141165	141174	0 %	80 %	0 %	20 %	261866872
77	NC_013416	CGGCA	2	10	141226	141235	20 %	0 %	40 %	40 %	261866872
78	NC_013416	TGGCT	2	10	142131	142140	0 %	40 %	40 %	20 %	261866873
79	NC_013416	CCACC	2	10	144654	144663	20 %	0 %	0 %	80 %	261866875
80	NC_013416	CAATT	2	10	147946	147955	40 %	40 %	0 %	20 %	261866878
81	NC_013416	AATGA	2	10	150491	150500	60 %	20 %	20 %	0 %	261866880
82	NC_013416	CAAAA	2	10	154664	154673	80 %	0 %	0 %	20 %	261866883
83	NC_013416	CAACG	2	10	155053	155062	40 %	0 %	20 %	40 %	261866883
84	NC_013416	TTTCA	2	10	156833	156842	20 %	60 %	0 %	20 %	261866887
85	NC_013416	TAAAA	2	10	158023	158032	80 %	20 %	0 %	0 %	261866887
86	NC_013416	TCCTT	2	10	160063	160072	0 %	60 %	0 %	40 %	261866890
87	NC_013416	CATTT	2	10	160278	160287	20 %	60 %	0 %	20 %	261866891
88	NC_013416	GTGCG	2	10	162621	162630	0 %	20 %	60 %	20 %	261866892
89	NC_013416	GTGCG	2	10	163738	163747	0 %	20 %	60 %	20 %	261866893
90	NC_013416	TTATC	2	10	165625	165634	20 %	60 %	0 %	20 %	261866896
91	NC_013416	CTTTT	2	10	167423	167432	0 %	80 %	0 %	20 %	261866898
92	NC_013416	TATTG	2	10	167481	167490	20 %	60 %	20 %	0 %	261866898
93	NC_013416	ACATC	2	10	169184	169193	40 %	20 %	0 %	40 %	261866901
94	NC_013416	GCGTG	2	10	169813	169822	0 %	20 %	60 %	20 %	261866902
95	NC_013416	GGCAT	2	10	169887	169896	20 %	20 %	40 %	20 %	261866902
96	NC_013416	TGATG	2	10	175019	175028	20 %	40 %	40 %	0 %	261866908
97	NC_013416	CAAGG	2	10	179884	179893	40 %	0 %	40 %	20 %	261866912
98	NC_013416	AGCGT	2	10	181338	181347	20 %	20 %	40 %	20 %	261866914
99	NC_013416	TGCAA	2	10	182340	182349	40 %	20 %	20 %	20 %	261866915
100	NC_013416	TGCCG	2	10	183460	183469	0 %	20 %	40 %	40 %	261866916
101	NC_013416	GCCAC	2	10	185337	185346	20 %	0 %	20 %	60 %	261866917
102	NC_013416	CCGAC	2	10	186006	186015	20 %	0 %	20 %	60 %	261866917
103	NC_013416	ACTGC	2	10	187746	187755	20 %	20 %	20 %	40 %	261866920
104	NC_013416	AAATC	2	10	188292	188301	60 %	20 %	0 %	20 %	261866921
105	NC_013416	CCCAA	2	10	188340	188349	40 %	0 %	0 %	60 %	261866921
106	NC_013416	CGCAA	2	10	188568	188577	40 %	0 %	20 %	40 %	261866921
107	NC_013416	CAAGC	2	10	188926	188935	40 %	0 %	20 %	40 %	261866921
108	NC_013416	GTGCG	2	10	191783	191792	0 %	20 %	60 %	20 %	261866923
109	NC_013416	CTTGC	2	10	191814	191823	0 %	40 %	20 %	40 %	261866923
110	NC_013416	ATCAA	2	10	195213	195222	60 %	20 %	0 %	20 %	261866927
111	NC_013416	ATTTA	2	10	196380	196389	40 %	60 %	0 %	0 %	261866929
112	NC_013416	TAAAT	2	10	197015	197024	60 %	40 %	0 %	0 %	261866930
113	NC_013416	ATCAA	2	10	201046	201055	60 %	20 %	0 %	20 %	261866933
114	NC_013416	CCCGA	2	10	204966	204975	20 %	0 %	20 %	60 %	261866939
115	NC_013416	AGGTG	2	10	205591	205600	20 %	20 %	60 %	0 %	261866940
116	NC_013416	GGCGT	2	10	207388	207397	0 %	20 %	60 %	20 %	261866943
117	NC_013416	CAAAC	2	10	207580	207589	60 %	0 %	0 %	40 %	261866943
118	NC_013416	GAAAA	2	10	207856	207865	80 %	0 %	20 %	0 %	261866943
119	NC_013416	ATTCT	2	10	214718	214727	20 %	60 %	0 %	20 %	261866950
120	NC_013416	AAATC	2	10	218223	218232	60 %	20 %	0 %	20 %	261866952
121	NC_013416	TTTAT	2	10	220685	220694	20 %	80 %	0 %	0 %	261866957
122	NC_013416	CCGCA	2	10	221597	221606	20 %	0 %	20 %	60 %	261866957
123	NC_013416	AAATT	2	10	221787	221796	60 %	40 %	0 %	0 %	261866957
124	NC_013416	ATTTT	2	10	222571	222580	20 %	80 %	0 %	0 %	261866958
125	NC_013416	TTGTA	2	10	223550	223559	20 %	60 %	20 %	0 %	261866959
126	NC_013416	TCAAA	2	10	225419	225428	60 %	20 %	0 %	20 %	261866961
127	NC_013416	CGGCA	2	10	228753	228762	20 %	0 %	40 %	40 %	261866963
128	NC_013416	GCGAA	2	10	229545	229554	40 %	0 %	40 %	20 %	261866964
129	NC_013416	GTGAA	2	10	229808	229817	40 %	20 %	40 %	0 %	261866965
130	NC_013416	GGCGT	2	10	230865	230874	0 %	20 %	60 %	20 %	261866966
131	NC_013416	GGCGT	2	10	232544	232553	0 %	20 %	60 %	20 %	261866968
132	NC_013416	ATTTT	2	10	234926	234935	20 %	80 %	0 %	0 %	261866971
133	NC_013416	GTCAG	2	10	236754	236763	20 %	20 %	40 %	20 %	261866973
134	NC_013416	TAACC	2	10	244956	244965	40 %	20 %	0 %	40 %	261866975
135	NC_013416	TTTGA	2	10	248356	248365	20 %	60 %	20 %	0 %	261866978
136	NC_013416	CACCG	2	10	249301	249310	20 %	0 %	20 %	60 %	261866979
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138	NC_013416	GTTAA	2	10	251768	251777	40 %	40 %	20 %	0 %	261866980
139	NC_013416	AATTG	2	10	252823	252832	40 %	40 %	20 %	0 %	261866982
140	NC_013416	CAAGG	2	10	253578	253587	40 %	0 %	40 %	20 %	261866982
141	NC_013416	CGATC	2	10	253739	253748	20 %	20 %	20 %	40 %	261866982
142	NC_013416	ATTGA	2	10	254115	254124	40 %	40 %	20 %	0 %	261866982
143	NC_013416	TGAAC	2	10	254561	254570	40 %	20 %	20 %	20 %	261866982
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148	NC_013416	GCCGT	2	10	266576	266585	0 %	20 %	40 %	40 %	261866995
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256	NC_013416	CGCCA	2	10	428136	428145	20 %	0 %	20 %	60 %	261867175
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259	NC_013416	CTTGG	2	10	434924	434933	0 %	40 %	40 %	20 %	261867184
260	NC_013416	GAAGC	2	10	435691	435700	40 %	0 %	40 %	20 %	261867186
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262	NC_013416	ATCAA	2	10	438040	438049	60 %	20 %	0 %	20 %	261867188
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