MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 1573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013416	AGTAG	2	10	679221	679230	40 %	20 %	40 %	0 %	261867449
502	NC_013416	TAACA	2	10	679784	679793	60 %	20 %	0 %	20 %	261867450
503	NC_013416	ACAAT	2	10	680278	680287	60 %	20 %	0 %	20 %	261867450
504	NC_013416	AAACA	2	10	680902	680911	80 %	0 %	0 %	20 %	261867451
505	NC_013416	ACTTC	2	10	682462	682471	20 %	40 %	0 %	40 %	261867452
506	NC_013416	TAAAG	2	10	683292	683301	60 %	20 %	20 %	0 %	261867453
507	NC_013416	AACAC	2	10	683356	683365	60 %	0 %	0 %	40 %	261867453
508	NC_013416	TACTA	2	10	683380	683389	40 %	40 %	0 %	20 %	261867453
509	NC_013416	CAATG	2	10	684124	684133	40 %	20 %	20 %	20 %	261867454
510	NC_013416	GTTCG	2	10	684738	684747	0 %	40 %	40 %	20 %	261867455
511	NC_013416	TCTTT	2	10	685397	685406	0 %	80 %	0 %	20 %	261867455
512	NC_013416	AAAGT	2	10	686390	686399	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
513	NC_013416	CTATT	2	10	687134	687143	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
514	NC_013416	AAAAT	2	10	687444	687453	80 %	20 %	0 %	0 %	261867459
515	NC_013416	GGCTT	2	10	688408	688417	0 %	40 %	40 %	20 %	261867460
516	NC_013416	AATCG	2	10	690382	690391	40 %	20 %	20 %	20 %	261867462
517	NC_013416	ATGTT	2	10	690608	690617	20 %	60 %	20 %	0 %	261867462
518	NC_013416	TTTCC	2	10	690751	690760	0 %	60 %	0 %	40 %	261867462
519	NC_013416	TTTGC	2	10	691061	691070	0 %	60 %	20 %	20 %	261867462
520	NC_013416	GTGCG	2	10	691727	691736	0 %	20 %	60 %	20 %	261867464
521	NC_013416	GCGCG	2	10	692079	692088	0 %	0 %	60 %	40 %	261867464
522	NC_013416	ATCAA	2	10	695143	695152	60 %	20 %	0 %	20 %	261867465
523	NC_013416	TTAAC	2	10	695919	695928	40 %	40 %	0 %	20 %	261867466
524	NC_013416	TGGGT	2	10	697209	697218	0 %	40 %	60 %	0 %	261867467
525	NC_013416	TATTT	2	10	699269	699278	20 %	80 %	0 %	0 %	261867470
526	NC_013416	CGGTG	2	10	699499	699508	0 %	20 %	60 %	20 %	261867470
527	NC_013416	CGGTG	2	10	705523	705532	0 %	20 %	60 %	20 %	261867475
528	NC_013416	AACAG	2	10	706732	706741	60 %	0 %	20 %	20 %	261867476
529	NC_013416	GTCCG	2	10	711617	711626	0 %	20 %	40 %	40 %	261867480
530	NC_013416	TGCGT	2	10	713985	713994	0 %	40 %	40 %	20 %	261867482
531	NC_013416	TGATG	2	10	714660	714669	20 %	40 %	40 %	0 %	261867482
532	NC_013416	AAATT	2	10	714883	714892	60 %	40 %	0 %	0 %	261867483
533	NC_013416	AAAAC	2	10	715455	715464	80 %	0 %	0 %	20 %	261867483
534	NC_013416	GGCTT	2	10	716169	716178	0 %	40 %	40 %	20 %	261867484
535	NC_013416	TTATT	2	10	719351	719360	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_013416	CATGC	2	10	720108	720117	20 %	20 %	20 %	40 %	261867487
537	NC_013416	TGAAT	2	10	722611	722620	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
538	NC_013416	AATTT	2	10	723887	723896	40 %	60 %	0 %	0 %	261867491
539	NC_013416	ATTCA	2	10	726531	726540	40 %	40 %	0 %	20 %	261867494
540	NC_013416	AATTG	2	10	726593	726602	40 %	40 %	20 %	0 %	261867494
541	NC_013416	AAAAG	2	10	726833	726842	80 %	0 %	20 %	0 %	261867495
542	NC_013416	TTGCA	2	10	727308	727317	20 %	40 %	20 %	20 %	261867496
543	NC_013416	GATTA	2	10	727989	727998	40 %	40 %	20 %	0 %	261867496
544	NC_013416	CATTT	2	10	728231	728240	20 %	60 %	0 %	20 %	261867497
545	NC_013416	GTCAT	2	10	728940	728949	20 %	40 %	20 %	20 %	261867499
546	NC_013416	TTCAA	2	10	729522	729531	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
547	NC_013416	TTTAA	2	10	729585	729594	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_013416	AACGA	2	10	730343	730352	60 %	0 %	20 %	20 %	261867500
549	NC_013416	TTGAT	2	10	730638	730647	20 %	60 %	20 %	0 %	261867500
550	NC_013416	ATTTG	2	10	734086	734095	20 %	60 %	20 %	0 %	261867502
551	NC_013416	GGAAT	2	10	735016	735025	40 %	20 %	40 %	0 %	261867504
552	NC_013416	GCATA	2	10	735494	735503	40 %	20 %	20 %	20 %	261867505
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554	NC_013416	TAGTG	2	10	736732	736741	20 %	40 %	40 %	0 %	261867506
555	NC_013416	TGTGG	2	10	739535	739544	0 %	40 %	60 %	0 %	261867509
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557	NC_013416	CATTA	2	10	746995	747004	40 %	40 %	0 %	20 %	261867516
558	NC_013416	GCACA	2	10	748614	748623	40 %	0 %	20 %	40 %	261867519
559	NC_013416	ATCTA	2	10	748847	748856	40 %	40 %	0 %	20 %	261867520
560	NC_013416	CGCAC	2	10	750699	750708	20 %	0 %	20 %	60 %	261867522
561	NC_013416	TGCCG	2	10	751391	751400	0 %	20 %	40 %	40 %	261867524
562	NC_013416	ATTAA	2	10	756404	756413	60 %	40 %	0 %	0 %	261867530
563	NC_013416	AAATT	2	10	756504	756513	60 %	40 %	0 %	0 %	261867530
564	NC_013416	GTATT	2	10	758542	758551	20 %	60 %	20 %	0 %	261867532
565	NC_013416	ACCAA	2	10	759226	759235	60 %	0 %	0 %	40 %	261867532
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569	NC_013416	CTGAC	2	10	763946	763955	20 %	20 %	20 %	40 %	261867536
570	NC_013416	ACGCC	2	10	764577	764586	20 %	0 %	20 %	60 %	261867536
571	NC_013416	AAAGG	2	10	765106	765115	60 %	0 %	40 %	0 %	261867536
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573	NC_013416	TTAAG	2	10	769756	769765	40 %	40 %	20 %	0 %	261867540
574	NC_013416	TTCCT	2	10	769880	769889	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
575	NC_013416	GAATT	2	10	770328	770337	40 %	40 %	20 %	0 %	261867541
576	NC_013416	AAAAT	2	10	771196	771205	80 %	20 %	0 %	0 %	261867541
577	NC_013416	ATGGT	2	10	773909	773918	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
578	NC_013416	ACGGC	2	10	775235	775244	20 %	0 %	40 %	40 %	261867545
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582	NC_013416	CCGCA	2	10	781685	781694	20 %	0 %	20 %	60 %	261867549
583	NC_013416	CAATT	2	10	784041	784050	40 %	40 %	0 %	20 %	261867551
584	NC_013416	TTCCG	2	10	786778	786787	0 %	40 %	20 %	40 %	261867555
585	NC_013416	CTTAT	2	10	787608	787617	20 %	60 %	0 %	20 %	261867556
586	NC_013416	CAACT	2	10	788210	788219	40 %	20 %	0 %	40 %	261867556
587	NC_013416	TCGGT	2	10	788637	788646	0 %	40 %	40 %	20 %	261867556
588	NC_013416	TTTTG	2	10	789172	789181	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
589	NC_013416	TTAAT	2	10	791453	791462	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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592	NC_013416	GTTAA	2	10	793927	793936	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
593	NC_013416	TGCCT	2	10	794072	794081	0 %	40 %	20 %	40 %	261867564
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595	NC_013416	TGCGC	2	10	797235	797244	0 %	20 %	40 %	40 %	261867567
596	NC_013416	TGCGG	2	10	798591	798600	0 %	20 %	60 %	20 %	261867567
597	NC_013416	CCATT	2	10	798880	798889	20 %	40 %	0 %	40 %	261867568
598	NC_013416	CAAAT	2	10	799150	799159	60 %	20 %	0 %	20 %	261867568
599	NC_013416	TTCCT	2	10	800037	800046	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
600	NC_013416	GATTT	2	10	803655	803664	20 %	60 %	20 %	0 %	261867575
601	NC_013416	TGCAA	2	10	804445	804454	40 %	20 %	20 %	20 %	261867575
602	NC_013416	CTTTT	2	10	805730	805739	0 %	80 %	0 %	20 %	261867575
603	NC_013416	TGCCA	2	10	806131	806140	20 %	20 %	20 %	40 %	261867576
604	NC_013416	TGTAA	2	10	807515	807524	40 %	40 %	20 %	0 %	261867577
605	NC_013416	GCAAA	3	15	807582	807596	60 %	0 %	20 %	20 %	261867577
606	NC_013416	GTAAT	2	10	807759	807768	40 %	40 %	20 %	0 %	261867577
607	NC_013416	AAAGA	2	10	807993	808002	80 %	0 %	20 %	0 %	261867577
608	NC_013416	AATAG	2	10	808820	808829	60 %	20 %	20 %	0 %	261867577
609	NC_013416	AACCA	2	10	808969	808978	60 %	0 %	0 %	40 %	261867577
610	NC_013416	ATTCA	2	10	809267	809276	40 %	40 %	0 %	20 %	261867578
611	NC_013416	CCATA	2	10	809961	809970	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
612	NC_013416	ACCTT	2	10	813125	813134	20 %	40 %	0 %	40 %	261867582
613	NC_013416	GGCGT	2	10	814504	814513	0 %	20 %	60 %	20 %	261867583
614	NC_013416	TGCGG	2	10	814551	814560	0 %	20 %	60 %	20 %	261867583
615	NC_013416	AAATC	2	10	815064	815073	60 %	20 %	0 %	20 %	261867583
616	NC_013416	AAATG	2	10	816989	816998	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
617	NC_013416	TCATC	2	10	817162	817171	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
618	NC_013416	CAAAA	2	10	817267	817276	80 %	0 %	0 %	20 %	261867585
619	NC_013416	GTCAG	2	10	817877	817886	20 %	20 %	40 %	20 %	261867585
620	NC_013416	TCCGG	2	10	818667	818676	0 %	20 %	40 %	40 %	261867587
621	NC_013416	ACCCG	2	10	823260	823269	20 %	0 %	20 %	60 %	261867590
622	NC_013416	GCACC	2	10	823717	823726	20 %	0 %	20 %	60 %	261867590
623	NC_013416	GGGCA	2	10	824990	824999	20 %	0 %	60 %	20 %	261867592
624	NC_013416	TACCA	2	10	826977	826986	40 %	20 %	0 %	40 %	261867594
625	NC_013416	GGAGC	2	10	828257	828266	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
626	NC_013416	TTTTA	2	10	830118	830127	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_013416	TATCT	2	10	833456	833465	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
628	NC_013416	GTGCG	2	10	835621	835630	0 %	20 %	60 %	20 %	261867606
629	NC_013416	CGGCA	2	10	836818	836827	20 %	0 %	40 %	40 %	261867607
630	NC_013416	TGAGG	2	10	837955	837964	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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