MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 5289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013416	CCGC	2	8	699	706	0 %	0 %	25 %	75 %	261866724
2	NC_013416	AAGC	2	8	1330	1337	50 %	0 %	25 %	25 %	261866724
3	NC_013416	CTTG	2	8	1440	1447	0 %	50 %	25 %	25 %	261866724
4	NC_013416	AGTA	2	8	2054	2061	50 %	25 %	25 %	0 %	261866725
5	NC_013416	ATAA	2	8	3551	3558	75 %	25 %	0 %	0 %	261866725
6	NC_013416	CAAT	2	8	3790	3797	50 %	25 %	0 %	25 %	261866726
7	NC_013416	ACGC	2	8	4440	4447	25 %	0 %	25 %	50 %	261866727
8	NC_013416	GTTG	2	8	4508	4515	0 %	50 %	50 %	0 %	261866727
9	NC_013416	AACT	2	8	4821	4828	50 %	25 %	0 %	25 %	261866728
10	NC_013416	TTTC	2	8	4865	4872	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013416	TGGT	2	8	4958	4965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013416	TTAA	2	8	5001	5008	50 %	50 %	0 %	0 %	261866729
13	NC_013416	TTAA	2	8	5389	5396	50 %	50 %	0 %	0 %	261866729
14	NC_013416	CCAT	2	8	5623	5630	25 %	25 %	0 %	50 %	261866729
15	NC_013416	GTTT	2	8	5803	5810	0 %	75 %	25 %	0 %	261866729
16	NC_013416	AGCA	2	8	5863	5870	50 %	0 %	25 %	25 %	261866729
17	NC_013416	GGAA	2	8	6926	6933	50 %	0 %	50 %	0 %	261866730
18	NC_013416	TCAT	2	8	7645	7652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013416	AAAT	2	8	7924	7931	75 %	25 %	0 %	0 %	261866732
20	NC_013416	TTGC	2	8	7949	7956	0 %	50 %	25 %	25 %	261866732
21	NC_013416	GGCG	2	8	8048	8055	0 %	0 %	75 %	25 %	261866732
22	NC_013416	GGGC	2	8	8332	8339	0 %	0 %	75 %	25 %	261866732
23	NC_013416	AATT	2	8	8544	8551	50 %	50 %	0 %	0 %	261866732
24	NC_013416	CGGT	2	8	9083	9090	0 %	25 %	50 %	25 %	261866733
25	NC_013416	CTGC	2	8	9602	9609	0 %	25 %	25 %	50 %	261866735
26	NC_013416	GGTG	2	8	9885	9892	0 %	25 %	75 %	0 %	261866735
27	NC_013416	CGAC	2	8	9919	9926	25 %	0 %	25 %	50 %	261866735
28	NC_013416	ACGA	2	8	9990	9997	50 %	0 %	25 %	25 %	261866735
29	NC_013416	TAAT	2	8	10219	10226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013416	ATTG	2	8	11918	11925	25 %	50 %	25 %	0 %	261866739
31	NC_013416	CAAA	2	8	12130	12137	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013416	GCCT	2	8	12871	12878	0 %	25 %	25 %	50 %	261866740
33	NC_013416	CCAC	2	8	13152	13159	25 %	0 %	0 %	75 %	261866740
34	NC_013416	TAAT	2	8	13407	13414	50 %	50 %	0 %	0 %	261866740
35	NC_013416	TAAA	2	8	13437	13444	75 %	25 %	0 %	0 %	261866740
36	NC_013416	TAAA	2	8	13470	13477	75 %	25 %	0 %	0 %	261866741
37	NC_013416	CGGT	2	8	13487	13494	0 %	25 %	50 %	25 %	261866741
38	NC_013416	AACC	2	8	13556	13563	50 %	0 %	0 %	50 %	261866742
39	NC_013416	GTCC	2	8	13890	13897	0 %	25 %	25 %	50 %	261866742
40	NC_013416	ATCC	2	8	13930	13937	25 %	25 %	0 %	50 %	261866742
41	NC_013416	TAAA	2	8	14113	14120	75 %	25 %	0 %	0 %	261866743
42	NC_013416	TTTG	2	8	14221	14228	0 %	75 %	25 %	0 %	261866743
43	NC_013416	CTGG	2	8	14528	14535	0 %	25 %	50 %	25 %	261866743
44	NC_013416	AATT	2	8	14930	14937	50 %	50 %	0 %	0 %	261866744
45	NC_013416	ATTT	2	8	15088	15095	25 %	75 %	0 %	0 %	261866744
46	NC_013416	GCGG	2	8	15271	15278	0 %	0 %	75 %	25 %	261866744
47	NC_013416	CGGG	2	8	15455	15462	0 %	0 %	75 %	25 %	261866744
48	NC_013416	TTCA	2	8	15572	15579	25 %	50 %	0 %	25 %	261866744
49	NC_013416	CCGC	2	8	15909	15916	0 %	0 %	25 %	75 %	261866745
50	NC_013416	ACCG	2	8	16066	16073	25 %	0 %	25 %	50 %	261866745
51	NC_013416	TCGG	2	8	16304	16311	0 %	25 %	50 %	25 %	261866745
52	NC_013416	AAGA	2	8	17492	17499	75 %	0 %	25 %	0 %	261866746
53	NC_013416	AAAT	2	8	18555	18562	75 %	25 %	0 %	0 %	261866748
54	NC_013416	TTAA	2	8	18804	18811	50 %	50 %	0 %	0 %	261866748
55	NC_013416	CATT	2	8	18905	18912	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013416	ATAA	2	8	18933	18940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013416	ACAA	2	8	19043	19050	75 %	0 %	0 %	25 %	261866749
58	NC_013416	TAAA	2	8	19308	19315	75 %	25 %	0 %	0 %	261866749
59	NC_013416	GTTA	2	8	19393	19400	25 %	50 %	25 %	0 %	261866749
60	NC_013416	AATG	2	8	20031	20038	50 %	25 %	25 %	0 %	261866750
61	NC_013416	TGAA	2	8	20111	20118	50 %	25 %	25 %	0 %	261866750
62	NC_013416	TTAT	2	8	20322	20329	25 %	75 %	0 %	0 %	261866750
63	NC_013416	GCAA	2	8	20421	20428	50 %	0 %	25 %	25 %	261866750
64	NC_013416	AAGC	2	8	20506	20513	50 %	0 %	25 %	25 %	261866750
65	NC_013416	ATTT	2	8	20764	20771	25 %	75 %	0 %	0 %	261866750
66	NC_013416	CAAA	2	8	21069	21076	75 %	0 %	0 %	25 %	261866750
67	NC_013416	TACT	2	8	21476	21483	25 %	50 %	0 %	25 %	261866751
68	NC_013416	TGAA	2	8	21793	21800	50 %	25 %	25 %	0 %	261866751
69	NC_013416	TTTA	2	8	21994	22001	25 %	75 %	0 %	0 %	261866752
70	NC_013416	TGTT	2	8	22341	22348	0 %	75 %	25 %	0 %	261866752
71	NC_013416	GGTT	2	8	22577	22584	0 %	50 %	50 %	0 %	261866752
72	NC_013416	ATTA	2	8	23417	23424	50 %	50 %	0 %	0 %	261866753
73	NC_013416	GCTG	2	8	23516	23523	0 %	25 %	50 %	25 %	261866753
74	NC_013416	ATTA	2	8	23855	23862	50 %	50 %	0 %	0 %	261866753
75	NC_013416	TTTA	2	8	24033	24040	25 %	75 %	0 %	0 %	261866753
76	NC_013416	CAAT	2	8	24154	24161	50 %	25 %	0 %	25 %	261866754
77	NC_013416	ATAC	2	8	24259	24266	50 %	25 %	0 %	25 %	261866754
78	NC_013416	ATCA	2	8	24463	24470	50 %	25 %	0 %	25 %	261866754
79	NC_013416	AGAA	3	12	24617	24628	75 %	0 %	25 %	0 %	261866754
80	NC_013416	TTTA	2	8	24638	24645	25 %	75 %	0 %	0 %	261866754
81	NC_013416	TGGA	2	8	25129	25136	25 %	25 %	50 %	0 %	261866754
82	NC_013416	TTTC	2	8	27245	27252	0 %	75 %	0 %	25 %	261866756
83	NC_013416	TTCT	2	8	27322	27329	0 %	75 %	0 %	25 %	261866756
84	NC_013416	TTAG	2	8	27439	27446	25 %	50 %	25 %	0 %	261866756
85	NC_013416	TTAT	2	8	27565	27572	25 %	75 %	0 %	0 %	261866756
86	NC_013416	TTTC	2	8	28084	28091	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013416	TTAC	2	8	28131	28138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013416	ACGT	2	8	28568	28575	25 %	25 %	25 %	25 %	261866757
89	NC_013416	GAAA	2	8	28611	28618	75 %	0 %	25 %	0 %	261866757
90	NC_013416	ATAA	2	8	29209	29216	75 %	25 %	0 %	0 %	261866758
91	NC_013416	GCCA	2	8	29628	29635	25 %	0 %	25 %	50 %	261866758
92	NC_013416	CCGC	2	8	30088	30095	0 %	0 %	25 %	75 %	261866758
93	NC_013416	AATC	2	8	30391	30398	50 %	25 %	0 %	25 %	261866758
94	NC_013416	ACGC	2	8	30460	30467	25 %	0 %	25 %	50 %	261866758
95	NC_013416	CGCC	2	8	31570	31577	0 %	0 %	25 %	75 %	261866758
96	NC_013416	AAAT	2	8	32384	32391	75 %	25 %	0 %	0 %	261866759
97	NC_013416	TGTT	2	8	32522	32529	0 %	75 %	25 %	0 %	261866759
98	NC_013416	AATC	2	8	33012	33019	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013416	CAAC	2	8	33499	33506	50 %	0 %	0 %	50 %	261866760
100	NC_013416	GGTT	2	8	33809	33816	0 %	50 %	50 %	0 %	261866760
101	NC_013416	ACCA	2	8	33871	33878	50 %	0 %	0 %	50 %	261866761
102	NC_013416	TTGC	2	8	34752	34759	0 %	50 %	25 %	25 %	261866761
103	NC_013416	CGCA	2	8	34818	34825	25 %	0 %	25 %	50 %	261866761
104	NC_013416	GGCA	2	8	35390	35397	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013416	ATAA	2	8	36161	36168	75 %	25 %	0 %	0 %	261866764
106	NC_013416	TTCA	2	8	36293	36300	25 %	50 %	0 %	25 %	261866764
107	NC_013416	TATT	2	8	36996	37003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013416	TTAT	2	8	37693	37700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013416	GGCG	2	8	38591	38598	0 %	0 %	75 %	25 %	261866767
110	NC_013416	CGCC	2	8	39026	39033	0 %	0 %	25 %	75 %	261866767
111	NC_013416	GGCG	2	8	39730	39737	0 %	0 %	75 %	25 %	261866768
112	NC_013416	TTGG	2	8	39796	39803	0 %	50 %	50 %	0 %	261866768
113	NC_013416	CGCT	2	8	40077	40084	0 %	25 %	25 %	50 %	261866768
114	NC_013416	ATTT	2	8	40209	40216	25 %	75 %	0 %	0 %	261866769
115	NC_013416	CGGT	2	8	41101	41108	0 %	25 %	50 %	25 %	261866769
116	NC_013416	TTCA	2	8	42786	42793	25 %	50 %	0 %	25 %	261866773
117	NC_013416	GGTT	2	8	42839	42846	0 %	50 %	50 %	0 %	261866773
118	NC_013416	TGAT	2	8	43428	43435	25 %	50 %	25 %	0 %	261866774
119	NC_013416	GCTG	2	8	44462	44469	0 %	25 %	50 %	25 %	261866776
120	NC_013416	AAAC	2	8	44625	44632	75 %	0 %	0 %	25 %	261866776
121	NC_013416	TATT	2	8	44780	44787	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013416	ATTT	2	8	45285	45292	25 %	75 %	0 %	0 %	261866777
123	NC_013416	ACCA	2	8	45372	45379	50 %	0 %	0 %	50 %	261866777
124	NC_013416	CAAA	2	8	45587	45594	75 %	0 %	0 %	25 %	261866778
125	NC_013416	GTAT	2	8	45603	45610	25 %	50 %	25 %	0 %	261866778
126	NC_013416	ATGA	2	8	45799	45806	50 %	25 %	25 %	0 %	261866778
127	NC_013416	CGGT	2	8	46348	46355	0 %	25 %	50 %	25 %	261866779
128	NC_013416	TTCA	2	8	46475	46482	25 %	50 %	0 %	25 %	261866779
129	NC_013416	GGCA	2	8	46529	46536	25 %	0 %	50 %	25 %	261866779
130	NC_013416	AATC	2	8	46660	46667	50 %	25 %	0 %	25 %	261866779
131	NC_013416	CGTG	2	8	46887	46894	0 %	25 %	50 %	25 %	261866780
132	NC_013416	TGGT	2	8	47581	47588	0 %	50 %	50 %	0 %	261866781
133	NC_013416	ACAA	2	8	47784	47791	75 %	0 %	0 %	25 %	261866782
134	NC_013416	GGCA	2	8	48196	48203	25 %	0 %	50 %	25 %	261866782
135	NC_013416	TTTA	2	8	48282	48289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013416	ATTG	2	8	48298	48305	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013416	TAAC	2	8	48315	48322	50 %	25 %	0 %	25 %	261866783
138	NC_013416	AAGA	2	8	48635	48642	75 %	0 %	25 %	0 %	261866783
139	NC_013416	AGCA	2	8	48932	48939	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013416	TATT	2	8	49025	49032	25 %	75 %	0 %	0 %	261866784
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142	NC_013416	TTGA	2	8	50243	50250	25 %	50 %	25 %	0 %	261866784
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