MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Geobacillus sp. Y412MC61 plasmid pGYMC6101

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013412	GACA	2	8	610	617	50 %	0 %	25 %	25 %	261420909
2	NC_013412	AGAA	2	8	1655	1662	75 %	0 %	25 %	0 %	261420910
3	NC_013412	CAGT	2	8	1799	1806	25 %	25 %	25 %	25 %	261420910
4	NC_013412	TTTG	2	8	2620	2627	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013412	TCGA	2	8	3400	3407	25 %	25 %	25 %	25 %	261420911
6	NC_013412	CAGG	2	8	3714	3721	25 %	0 %	50 %	25 %	261420911
7	NC_013412	TGGT	2	8	4354	4361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013412	ATTT	2	8	4495	4502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013412	TAGA	2	8	5002	5009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013412	CTAT	2	8	5871	5878	25 %	50 %	0 %	25 %	261420912
11	NC_013412	TGAA	2	8	5958	5965	50 %	25 %	25 %	0 %	261420912
12	NC_013412	TATT	2	8	6084	6091	25 %	75 %	0 %	0 %	261420912
13	NC_013412	GAAT	2	8	6300	6307	50 %	25 %	25 %	0 %	261420912
14	NC_013412	ATTA	2	8	6996	7003	50 %	50 %	0 %	0 %	261420913
15	NC_013412	AATG	2	8	7433	7440	50 %	25 %	25 %	0 %	261420914
16	NC_013412	TTCG	2	8	7480	7487	0 %	50 %	25 %	25 %	261420914
17	NC_013412	CAAG	2	8	7776	7783	50 %	0 %	25 %	25 %	261420914
18	NC_013412	GTGG	2	8	7798	7805	0 %	25 %	75 %	0 %	261420914
19	NC_013412	GATG	2	8	7864	7871	25 %	25 %	50 %	0 %	261420914
20	NC_013412	GCTG	2	8	8077	8084	0 %	25 %	50 %	25 %	261420914
21	NC_013412	CAAG	2	8	8605	8612	50 %	0 %	25 %	25 %	261420914
22	NC_013412	TGGC	2	8	8813	8820	0 %	25 %	50 %	25 %	261420914
23	NC_013412	CATC	2	8	9013	9020	25 %	25 %	0 %	50 %	261420914
24	NC_013412	TTTG	2	8	9094	9101	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013412	GTAT	2	8	9157	9164	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013412	AATA	2	8	9231	9238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013412	GGTG	2	8	9274	9281	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013412	GAGC	2	8	9710	9717	25 %	0 %	50 %	25 %	261420915
29	NC_013412	GGCA	2	8	9834	9841	25 %	0 %	50 %	25 %	261420915
30	NC_013412	GACC	2	8	10137	10144	25 %	0 %	25 %	50 %	261420916
31	NC_013412	GAAA	2	8	10216	10223	75 %	0 %	25 %	0 %	261420916
32	NC_013412	CGGA	2	8	10243	10250	25 %	0 %	50 %	25 %	261420916
33	NC_013412	TATC	2	8	10296	10303	25 %	50 %	0 %	25 %	261420916
34	NC_013412	TTGA	2	8	10306	10313	25 %	50 %	25 %	0 %	261420916
35	NC_013412	TCCG	2	8	10631	10638	0 %	25 %	25 %	50 %	261420917
36	NC_013412	ATGG	2	8	10749	10756	25 %	25 %	50 %	0 %	261420917
37	NC_013412	TTCA	2	8	12236	12243	25 %	50 %	0 %	25 %	261420918
38	NC_013412	ATGA	2	8	12305	12312	50 %	25 %	25 %	0 %	261420918
39	NC_013412	ATGG	2	8	12384	12391	25 %	25 %	50 %	0 %	261420918
40	NC_013412	CCAT	2	8	13129	13136	25 %	25 %	0 %	50 %	261420918
41	NC_013412	TTCT	2	8	14231	14238	0 %	75 %	0 %	25 %	261420920
42	NC_013412	AATA	2	8	14538	14545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013412	CCGG	2	8	14706	14713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013412	CTGC	2	8	14775	14782	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013412	AAAT	2	8	15138	15145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013412	AGGG	2	8	15346	15353	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013412	GGAT	2	8	15447	15454	25 %	25 %	50 %	0 %	261420921
48	NC_013412	GGTC	2	8	15895	15902	0 %	25 %	50 %	25 %	261420921
49	NC_013412	AGGA	2	8	16019	16026	50 %	0 %	50 %	0 %	261420921
50	NC_013412	CGGA	2	8	16545	16552	25 %	0 %	50 %	25 %	261420921
51	NC_013412	TGCT	2	8	16726	16733	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013412	GATT	2	8	16895	16902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013412	TGGT	2	8	16978	16985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013412	ATTT	3	12	17374	17385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013412	GTTT	2	8	17637	17644	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013412	ATGT	2	8	17800	17807	25 %	50 %	25 %	0 %	261420923
57	NC_013412	ACAA	2	8	18485	18492	75 %	0 %	0 %	25 %	261420923
58	NC_013412	AATG	2	8	18757	18764	50 %	25 %	25 %	0 %	261420924
59	NC_013412	CTGT	2	8	18860	18867	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013412	TCAA	2	8	18969	18976	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013412	CTCC	2	8	19771	19778	0 %	25 %	0 %	75 %	261420925
62	NC_013412	TCCC	2	8	19896	19903	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_013412	GAAC	2	8	20242	20249	50 %	0 %	25 %	25 %	261420926
64	NC_013412	AACT	2	8	20485	20492	50 %	25 %	0 %	25 %	261420926
65	NC_013412	AATT	2	8	20830	20837	50 %	50 %	0 %	0 %	261420926
66	NC_013412	GAAA	2	8	21188	21195	75 %	0 %	25 %	0 %	261420926
67	NC_013412	GGAA	2	8	21556	21563	50 %	0 %	50 %	0 %	261420926
68	NC_013412	GAAT	2	8	22187	22194	50 %	25 %	25 %	0 %	261420927
69	NC_013412	AACC	2	8	22224	22231	50 %	0 %	0 %	50 %	261420927
70	NC_013412	AAGC	2	8	22310	22317	50 %	0 %	25 %	25 %	261420927
71	NC_013412	AGCA	2	8	22388	22395	50 %	0 %	25 %	25 %	261420927
72	NC_013412	GGAA	2	8	22674	22681	50 %	0 %	50 %	0 %	261420927
73	NC_013412	TTTC	2	8	22713	22720	0 %	75 %	0 %	25 %	261420927
74	NC_013412	ACAA	2	8	22966	22973	75 %	0 %	0 %	25 %	261420927
75	NC_013412	GAAA	2	8	23121	23128	75 %	0 %	25 %	0 %	261420928
76	NC_013412	GAAA	2	8	23862	23869	75 %	0 %	25 %	0 %	261420928
77	NC_013412	GCGT	2	8	23894	23901	0 %	25 %	50 %	25 %	261420928
78	NC_013412	TGGA	2	8	24175	24182	25 %	25 %	50 %	0 %	261420928
79	NC_013412	CAAT	2	8	24215	24222	50 %	25 %	0 %	25 %	261420928
80	NC_013412	TCAG	2	8	24406	24413	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013412	TTGT	2	8	24883	24890	0 %	75 %	25 %	0 %	261420929
82	NC_013412	GGCT	2	8	25264	25271	0 %	25 %	50 %	25 %	261420929
83	NC_013412	TTGA	2	8	25351	25358	25 %	50 %	25 %	0 %	261420929
84	NC_013412	GGAT	2	8	25387	25394	25 %	25 %	50 %	0 %	261420929
85	NC_013412	AAAC	2	8	25751	25758	75 %	0 %	0 %	25 %	261420929
86	NC_013412	GAAA	2	8	26446	26453	75 %	0 %	25 %	0 %	261420930
87	NC_013412	TTGC	2	8	26633	26640	0 %	50 %	25 %	25 %	261420930
88	NC_013412	GCTT	2	8	26655	26662	0 %	50 %	25 %	25 %	261420930
89	NC_013412	ATTC	2	8	27742	27749	25 %	50 %	0 %	25 %	261420931
90	NC_013412	AGGG	2	8	28266	28273	25 %	0 %	75 %	0 %	261420931
91	NC_013412	GCGA	2	8	28508	28515	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013412	GGCC	2	8	28802	28809	0 %	0 %	50 %	50 %	261420932
93	NC_013412	ACAA	2	8	29182	29189	75 %	0 %	0 %	25 %	261420932
94	NC_013412	TAAA	2	8	30037	30044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013412	CCGG	2	8	30165	30172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013412	TTCA	2	8	30442	30449	25 %	50 %	0 %	25 %	261420933
97	NC_013412	CATC	2	8	30525	30532	25 %	25 %	0 %	50 %	261420933
98	NC_013412	TCTT	2	8	30788	30795	0 %	75 %	0 %	25 %	261420933
99	NC_013412	TTTA	2	8	31478	31485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013412	CTCC	2	8	31705	31712	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_013412	ACAT	2	8	31790	31797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013412	GGAA	2	8	32028	32035	50 %	0 %	50 %	0 %	261420934
103	NC_013412	TGTT	2	8	32105	32112	0 %	75 %	25 %	0 %	261420934
104	NC_013412	TTTA	2	8	32135	32142	25 %	75 %	0 %	0 %	261420934
105	NC_013412	GCAG	2	8	32278	32285	25 %	0 %	50 %	25 %	261420934
106	NC_013412	CGAA	2	8	32292	32299	50 %	0 %	25 %	25 %	261420934
107	NC_013412	TTGT	2	8	32503	32510	0 %	75 %	25 %	0 %	261420935
108	NC_013412	CTTC	2	8	33036	33043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013412	TCCC	2	8	33612	33619	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_013412	GATA	2	8	33824	33831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013412	GCGA	2	8	34195	34202	25 %	0 %	50 %	25 %	261420939
112	NC_013412	AACC	2	8	34647	34654	50 %	0 %	0 %	50 %	261420940
113	NC_013412	AAAG	2	8	34793	34800	75 %	0 %	25 %	0 %	261420940
114	NC_013412	GCGT	2	8	35931	35938	0 %	25 %	50 %	25 %	261420941
115	NC_013412	ATGA	2	8	36194	36201	50 %	25 %	25 %	0 %	261420941
116	NC_013412	TAAT	2	8	36555	36562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013412	GAAG	2	8	36659	36666	50 %	0 %	50 %	0 %	261420942
118	NC_013412	GGCC	2	8	37309	37316	0 %	0 %	50 %	50 %	261420943
119	NC_013412	GCAA	2	8	38331	38338	50 %	0 %	25 %	25 %	261420943
120	NC_013412	AGCT	2	8	38470	38477	25 %	25 %	25 %	25 %	261420943
121	NC_013412	GATA	2	8	39123	39130	50 %	25 %	25 %	0 %	261420943
122	NC_013412	TGTT	2	8	39239	39246	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013412	AGGG	2	8	40794	40801	25 %	0 %	75 %	0 %	261420945
124	NC_013412	AAAG	2	8	40814	40821	75 %	0 %	25 %	0 %	261420945
125	NC_013412	AGAA	2	8	40880	40887	75 %	0 %	25 %	0 %	261420945
126	NC_013412	GCTT	2	8	40943	40950	0 %	50 %	25 %	25 %	261420945
127	NC_013412	GATA	2	8	40970	40977	50 %	25 %	25 %	0 %	261420945
128	NC_013412	CAAT	2	8	41321	41328	50 %	25 %	0 %	25 %	261420946
129	NC_013412	ATGG	2	8	41336	41343	25 %	25 %	50 %	0 %	261420946
130	NC_013412	TAAT	2	8	41700	41707	50 %	50 %	0 %	0 %	261420946
131	NC_013412	ATTG	2	8	42541	42548	25 %	50 %	25 %	0 %	261420946
132	NC_013412	ACAG	2	8	42802	42809	50 %	0 %	25 %	25 %	261420946
133	NC_013412	GATG	2	8	43329	43336	25 %	25 %	50 %	0 %	261420947
134	NC_013412	TTGG	2	8	43588	43595	0 %	50 %	50 %	0 %	261420947
135	NC_013412	AGCA	2	8	43644	43651	50 %	0 %	25 %	25 %	261420947
136	NC_013412	TGAA	2	8	43727	43734	50 %	25 %	25 %	0 %	261420947
137	NC_013412	CTTC	2	8	43935	43942	0 %	50 %	0 %	50 %	261420947

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.