MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus sp. Y412MC61 plasmid pGYMC6101

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013412	GACA	2	8	610	617	50 %	0 %	25 %	25 %	261420909
2	NC_013412	AGAA	2	8	1655	1662	75 %	0 %	25 %	0 %	261420910
3	NC_013412	CAGT	2	8	1799	1806	25 %	25 %	25 %	25 %	261420910
4	NC_013412	TCGA	2	8	3400	3407	25 %	25 %	25 %	25 %	261420911
5	NC_013412	CAGG	2	8	3714	3721	25 %	0 %	50 %	25 %	261420911
6	NC_013412	CTAT	2	8	5871	5878	25 %	50 %	0 %	25 %	261420912
7	NC_013412	TGAA	2	8	5958	5965	50 %	25 %	25 %	0 %	261420912
8	NC_013412	TATT	2	8	6084	6091	25 %	75 %	0 %	0 %	261420912
9	NC_013412	GAAT	2	8	6300	6307	50 %	25 %	25 %	0 %	261420912
10	NC_013412	ATTA	2	8	6996	7003	50 %	50 %	0 %	0 %	261420913
11	NC_013412	AATG	2	8	7433	7440	50 %	25 %	25 %	0 %	261420914
12	NC_013412	TTCG	2	8	7480	7487	0 %	50 %	25 %	25 %	261420914
13	NC_013412	CAAG	2	8	7776	7783	50 %	0 %	25 %	25 %	261420914
14	NC_013412	GTGG	2	8	7798	7805	0 %	25 %	75 %	0 %	261420914
15	NC_013412	GATG	2	8	7864	7871	25 %	25 %	50 %	0 %	261420914
16	NC_013412	GCTG	2	8	8077	8084	0 %	25 %	50 %	25 %	261420914
17	NC_013412	CAAG	2	8	8605	8612	50 %	0 %	25 %	25 %	261420914
18	NC_013412	TGGC	2	8	8813	8820	0 %	25 %	50 %	25 %	261420914
19	NC_013412	CATC	2	8	9013	9020	25 %	25 %	0 %	50 %	261420914
20	NC_013412	GAGC	2	8	9710	9717	25 %	0 %	50 %	25 %	261420915
21	NC_013412	GGCA	2	8	9834	9841	25 %	0 %	50 %	25 %	261420915
22	NC_013412	GACC	2	8	10137	10144	25 %	0 %	25 %	50 %	261420916
23	NC_013412	GAAA	2	8	10216	10223	75 %	0 %	25 %	0 %	261420916
24	NC_013412	CGGA	2	8	10243	10250	25 %	0 %	50 %	25 %	261420916
25	NC_013412	TATC	2	8	10296	10303	25 %	50 %	0 %	25 %	261420916
26	NC_013412	TTGA	2	8	10306	10313	25 %	50 %	25 %	0 %	261420916
27	NC_013412	TCCG	2	8	10631	10638	0 %	25 %	25 %	50 %	261420917
28	NC_013412	ATGG	2	8	10749	10756	25 %	25 %	50 %	0 %	261420917
29	NC_013412	TTCA	2	8	12236	12243	25 %	50 %	0 %	25 %	261420918
30	NC_013412	ATGA	2	8	12305	12312	50 %	25 %	25 %	0 %	261420918
31	NC_013412	ATGG	2	8	12384	12391	25 %	25 %	50 %	0 %	261420918
32	NC_013412	CCAT	2	8	13129	13136	25 %	25 %	0 %	50 %	261420918
33	NC_013412	TTCT	2	8	14231	14238	0 %	75 %	0 %	25 %	261420920
34	NC_013412	GGAT	2	8	15447	15454	25 %	25 %	50 %	0 %	261420921
35	NC_013412	GGTC	2	8	15895	15902	0 %	25 %	50 %	25 %	261420921
36	NC_013412	AGGA	2	8	16019	16026	50 %	0 %	50 %	0 %	261420921
37	NC_013412	CGGA	2	8	16545	16552	25 %	0 %	50 %	25 %	261420921
38	NC_013412	ATGT	2	8	17800	17807	25 %	50 %	25 %	0 %	261420923
39	NC_013412	ACAA	2	8	18485	18492	75 %	0 %	0 %	25 %	261420923
40	NC_013412	AATG	2	8	18757	18764	50 %	25 %	25 %	0 %	261420924
41	NC_013412	CTCC	2	8	19771	19778	0 %	25 %	0 %	75 %	261420925
42	NC_013412	GAAC	2	8	20242	20249	50 %	0 %	25 %	25 %	261420926
43	NC_013412	AACT	2	8	20485	20492	50 %	25 %	0 %	25 %	261420926
44	NC_013412	AATT	2	8	20830	20837	50 %	50 %	0 %	0 %	261420926
45	NC_013412	GAAA	2	8	21188	21195	75 %	0 %	25 %	0 %	261420926
46	NC_013412	GGAA	2	8	21556	21563	50 %	0 %	50 %	0 %	261420926
47	NC_013412	GAAT	2	8	22187	22194	50 %	25 %	25 %	0 %	261420927
48	NC_013412	AACC	2	8	22224	22231	50 %	0 %	0 %	50 %	261420927
49	NC_013412	AAGC	2	8	22310	22317	50 %	0 %	25 %	25 %	261420927
50	NC_013412	AGCA	2	8	22388	22395	50 %	0 %	25 %	25 %	261420927
51	NC_013412	GGAA	2	8	22674	22681	50 %	0 %	50 %	0 %	261420927
52	NC_013412	TTTC	2	8	22713	22720	0 %	75 %	0 %	25 %	261420927
53	NC_013412	ACAA	2	8	22966	22973	75 %	0 %	0 %	25 %	261420927
54	NC_013412	GAAA	2	8	23121	23128	75 %	0 %	25 %	0 %	261420928
55	NC_013412	GAAA	2	8	23862	23869	75 %	0 %	25 %	0 %	261420928
56	NC_013412	GCGT	2	8	23894	23901	0 %	25 %	50 %	25 %	261420928
57	NC_013412	TGGA	2	8	24175	24182	25 %	25 %	50 %	0 %	261420928
58	NC_013412	CAAT	2	8	24215	24222	50 %	25 %	0 %	25 %	261420928
59	NC_013412	TTGT	2	8	24883	24890	0 %	75 %	25 %	0 %	261420929
60	NC_013412	GGCT	2	8	25264	25271	0 %	25 %	50 %	25 %	261420929
61	NC_013412	TTGA	2	8	25351	25358	25 %	50 %	25 %	0 %	261420929
62	NC_013412	GGAT	2	8	25387	25394	25 %	25 %	50 %	0 %	261420929
63	NC_013412	AAAC	2	8	25751	25758	75 %	0 %	0 %	25 %	261420929
64	NC_013412	GAAA	2	8	26446	26453	75 %	0 %	25 %	0 %	261420930
65	NC_013412	TTGC	2	8	26633	26640	0 %	50 %	25 %	25 %	261420930
66	NC_013412	GCTT	2	8	26655	26662	0 %	50 %	25 %	25 %	261420930
67	NC_013412	ATTC	2	8	27742	27749	25 %	50 %	0 %	25 %	261420931
68	NC_013412	AGGG	2	8	28266	28273	25 %	0 %	75 %	0 %	261420931
69	NC_013412	GGCC	2	8	28802	28809	0 %	0 %	50 %	50 %	261420932
70	NC_013412	ACAA	2	8	29182	29189	75 %	0 %	0 %	25 %	261420932
71	NC_013412	TTCA	2	8	30442	30449	25 %	50 %	0 %	25 %	261420933
72	NC_013412	CATC	2	8	30525	30532	25 %	25 %	0 %	50 %	261420933
73	NC_013412	TCTT	2	8	30788	30795	0 %	75 %	0 %	25 %	261420933
74	NC_013412	GGAA	2	8	32028	32035	50 %	0 %	50 %	0 %	261420934
75	NC_013412	TGTT	2	8	32105	32112	0 %	75 %	25 %	0 %	261420934
76	NC_013412	TTTA	2	8	32135	32142	25 %	75 %	0 %	0 %	261420934
77	NC_013412	GCAG	2	8	32278	32285	25 %	0 %	50 %	25 %	261420934
78	NC_013412	CGAA	2	8	32292	32299	50 %	0 %	25 %	25 %	261420934
79	NC_013412	TTGT	2	8	32503	32510	0 %	75 %	25 %	0 %	261420935
80	NC_013412	GCGA	2	8	34195	34202	25 %	0 %	50 %	25 %	261420939
81	NC_013412	AACC	2	8	34647	34654	50 %	0 %	0 %	50 %	261420940
82	NC_013412	AAAG	2	8	34793	34800	75 %	0 %	25 %	0 %	261420940
83	NC_013412	GCGT	2	8	35931	35938	0 %	25 %	50 %	25 %	261420941
84	NC_013412	ATGA	2	8	36194	36201	50 %	25 %	25 %	0 %	261420941
85	NC_013412	GAAG	2	8	36659	36666	50 %	0 %	50 %	0 %	261420942
86	NC_013412	GGCC	2	8	37309	37316	0 %	0 %	50 %	50 %	261420943
87	NC_013412	GCAA	2	8	38331	38338	50 %	0 %	25 %	25 %	261420943
88	NC_013412	AGCT	2	8	38470	38477	25 %	25 %	25 %	25 %	261420943
89	NC_013412	GATA	2	8	39123	39130	50 %	25 %	25 %	0 %	261420943
90	NC_013412	AGGG	2	8	40794	40801	25 %	0 %	75 %	0 %	261420945
91	NC_013412	AAAG	2	8	40814	40821	75 %	0 %	25 %	0 %	261420945
92	NC_013412	AGAA	2	8	40880	40887	75 %	0 %	25 %	0 %	261420945
93	NC_013412	GCTT	2	8	40943	40950	0 %	50 %	25 %	25 %	261420945
94	NC_013412	GATA	2	8	40970	40977	50 %	25 %	25 %	0 %	261420945
95	NC_013412	CAAT	2	8	41321	41328	50 %	25 %	0 %	25 %	261420946
96	NC_013412	ATGG	2	8	41336	41343	25 %	25 %	50 %	0 %	261420946
97	NC_013412	TAAT	2	8	41700	41707	50 %	50 %	0 %	0 %	261420946
98	NC_013412	ATTG	2	8	42541	42548	25 %	50 %	25 %	0 %	261420946
99	NC_013412	ACAG	2	8	42802	42809	50 %	0 %	25 %	25 %	261420946
100	NC_013412	GATG	2	8	43329	43336	25 %	25 %	50 %	0 %	261420947
101	NC_013412	TTGG	2	8	43588	43595	0 %	50 %	50 %	0 %	261420947
102	NC_013412	AGCA	2	8	43644	43651	50 %	0 %	25 %	25 %	261420947
103	NC_013412	TGAA	2	8	43727	43734	50 %	25 %	25 %	0 %	261420947
104	NC_013412	CTTC	2	8	43935	43942	0 %	50 %	0 %	50 %	261420947

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.