MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacillus sp. Y412MC61 plasmid pGYMC6101

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013412	TAC	2	6	19	24	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013412	AAT	2	6	47	52	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013412	TCT	2	6	157	162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013412	CTA	2	6	184	189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013412	CAT	2	6	2339	2344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013412	GAA	2	6	2348	2353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013412	CTT	2	6	2435	2440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013412	TGG	2	6	2451	2456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013412	CTA	2	6	2664	2669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013412	TTG	2	6	2688	2693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013412	GGT	2	6	2706	2711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013412	CTG	2	6	2766	2771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013412	TTC	2	6	2816	2821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013412	CCT	2	6	2827	2832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_013412	TGT	2	6	2839	2844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013412	GCT	2	6	3041	3046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013412	TAC	2	6	3076	3081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013412	AAT	2	6	3106	3111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013412	CCT	2	6	4342	4347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_013412	AAC	2	6	4478	4483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013412	TGG	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013412	AAT	2	6	4563	4568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013412	TAA	2	6	4623	4628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013412	CAG	2	6	4629	4634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013412	ATT	2	6	4643	4648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013412	GTT	2	6	4684	4689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013412	GTT	2	6	4890	4895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013412	TGT	2	6	4917	4922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013412	TCA	2	6	4960	4965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013412	TCG	2	6	4992	4997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013412	ATA	2	6	5018	5023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013412	AGG	2	6	5047	5052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013412	TTG	2	6	9127	9132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013412	ATT	2	6	9189	9194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013412	AGA	2	6	9250	9255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013412	GAA	2	6	9267	9272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013412	TCG	2	6	11708	11713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013412	TCC	2	6	13829	13834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_013412	CAT	2	6	13848	13853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013412	TTG	2	6	13919	13924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013412	TAC	2	6	14395	14400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013412	ATC	2	6	14463	14468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013412	GCT	2	6	14514	14519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013412	GAA	2	6	14521	14526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013412	TGA	2	6	14548	14553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013412	TAA	3	9	14554	14562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013412	TTC	2	6	14615	14620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013412	GCC	2	6	14683	14688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_013412	GAA	2	6	14744	14749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013412	CCG	2	6	14820	14825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_013412	ATT	2	6	14844	14849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013412	TGA	2	6	15126	15131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013412	GGA	2	6	15146	15151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013412	GTT	2	6	15332	15337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013412	TCG	2	6	16697	16702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013412	TAT	2	6	16709	16714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013412	GTT	2	6	16767	16772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013412	CAT	2	6	16779	16784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013412	TGG	2	6	16790	16795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013412	TTA	2	6	16942	16947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013412	GAT	2	6	16986	16991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013412	ATT	2	6	16995	17000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013412	CAA	2	6	17029	17034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013412	CTC	2	6	17152	17157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_013412	ATG	2	6	17244	17249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013412	ATA	2	6	17274	17279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013412	TCT	2	6	17679	17684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013412	GGT	2	6	18557	18562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013412	TCT	2	6	18876	18881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013412	TCC	2	6	18883	18888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_013412	GAC	2	6	18903	18908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013412	ATG	2	6	18911	18916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013412	GGC	2	6	18924	18929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013412	ATG	2	6	18941	18946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013412	GAG	2	6	18947	18952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013412	CTG	2	6	19018	19023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013412	TGT	2	6	19030	19035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013412	AGA	2	6	19084	19089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013412	CTT	2	6	19279	19284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013412	TAG	2	6	19321	19326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013412	GAC	2	6	19382	19387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013412	ATC	2	6	19434	19439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013412	TCC	2	6	19873	19878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_013412	CTG	2	6	19985	19990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013412	ACT	2	6	20048	20053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013412	TCT	2	6	20134	20139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013412	TAT	2	6	20166	20171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013412	ACA	2	6	20176	20181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013412	TAT	2	6	20218	20223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013412	ATT	2	6	21761	21766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013412	AGG	2	6	21860	21865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013412	CAA	2	6	24414	24419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013412	AGG	2	6	24443	24448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013412	GAA	2	6	28538	28543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013412	CTC	2	6	28640	28645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_013412	ACA	2	6	28707	28712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013412	ACC	2	6	29684	29689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_013412	CTT	2	6	30071	30076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013412	CTT	2	6	30128	30133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013412	TCT	2	6	30152	30157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013412	GGC	2	6	30190	30195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013412	TCC	2	6	31385	31390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_013412	CTA	2	6	31393	31398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013412	AAC	2	6	31562	31567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013412	AAC	2	6	31626	31631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013412	CAA	2	6	31763	31768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013412	TAA	2	6	31806	31811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013412	GAA	2	6	31825	31830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013412	CCT	2	6	31846	31851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_013412	AGC	2	6	33013	33018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013412	TCC	3	9	34053	34061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_013412	CCT	2	6	34293	34298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_013412	CAT	2	6	34312	34317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013412	AAT	2	6	35067	35072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013412	CCT	2	6	36303	36308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_013412	TTA	2	6	37201	37206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013412	AGG	2	6	37219	37224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013412	GAT	2	6	39209	39214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013412	GTG	2	6	39384	39389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013412	CAC	2	6	40375	40380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_013412	ATT	2	6	41191	41196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.