MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacillus sp. Y412MC61 chromosome

Total Repeats: 607

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013411	TAAAA	2	10	2935	2944	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013411	AGGAG	2	10	11178	11187	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013411	TCGTG	2	10	11593	11602	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013411	TGTTT	2	10	12353	12362	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013411	GGGAG	2	10	13457	13466	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013411	TAAAA	2	10	20340	20349	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013411	AGCAA	2	10	21310	21319	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013411	AGGAG	2	10	30417	30426	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013411	TCGTG	2	10	30832	30841	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013411	TGTTT	2	10	31592	31601	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013411	GGGAG	2	10	32599	32608	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013411	ATAGA	2	10	38016	38025	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013411	TGGGG	2	10	39885	39894	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013411	TCTCC	2	10	42321	42330	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_013411	GCTTG	2	10	50227	50236	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013411	TATGA	2	10	76297	76306	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013411	TATAA	2	10	88499	88508	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013411	AACGA	2	10	90012	90021	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013411	GCGGT	2	10	90795	90804	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013411	AGGAG	2	10	90984	90993	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013411	TCGTG	2	10	91399	91408	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013411	GGGAG	2	10	93041	93050	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013411	TCTTT	2	10	95794	95803	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013411	GGAGC	2	10	106539	106548	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013411	GTTTT	2	10	112370	112379	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013411	TCAAC	2	10	115866	115875	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_013411	AGCGA	2	10	136234	136243	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013411	TTTCA	2	10	143388	143397	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013411	AACGA	2	10	153195	153204	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013411	AGGAG	2	10	154049	154058	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013411	TCGTG	2	10	154464	154473	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013411	GGGAG	2	10	156129	156138	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013411	GGGGC	2	10	160178	160187	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013411	ATTCA	2	10	168622	168631	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013411	TAAAA	2	10	172831	172840	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013411	TGTTT	2	10	173284	173293	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013411	AAAAC	2	10	185835	185844	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013411	TACCA	2	10	197958	197967	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_013411	CACTT	2	10	207609	207618	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_013411	CTTCG	2	10	224942	224951	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_013411	GCCAT	2	10	225003	225012	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_013411	TTGTT	2	10	226047	226056	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013411	ACGCC	2	10	229984	229993	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_013411	AGTTT	2	10	232967	232976	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013411	ATATG	2	10	248948	248957	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013411	GGTGT	2	10	261008	261017	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013411	CCGCC	2	10	266757	266766	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
48	NC_013411	TGAAA	2	10	274259	274268	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013411	ACTCA	2	10	307780	307789	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_013411	TCTCC	2	10	312363	312372	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
51	NC_013411	AGCGG	2	10	317846	317855	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_013411	TTACA	2	10	320755	320764	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013411	ATGGT	2	10	321020	321029	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013411	GTTCT	2	10	327036	327045	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_013411	TTCGC	2	10	331367	331376	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_013411	CCCGA	2	10	333760	333769	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
57	NC_013411	GTTCG	2	10	333940	333949	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_013411	GTATG	2	10	336660	336669	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013411	CGATC	2	10	338501	338510	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_013411	CTATT	2	10	338847	338856	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_013411	ACAAA	2	10	340800	340809	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013411	ACGGA	2	10	345009	345018	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013411	CAAGA	2	10	345121	345130	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013411	ACGGC	2	10	347998	348007	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_013411	AATTA	2	10	349253	349262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013411	TATTT	2	10	358421	358430	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013411	GCTAT	2	10	363398	363407	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013411	TAAAA	2	10	372589	372598	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013411	GCCCA	2	10	380506	380515	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_013411	ACGCG	2	10	397656	397665	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_013411	TTCGC	2	10	403301	403310	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_013411	GCGGT	2	10	404145	404154	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_013411	AGGAT	2	10	421900	421909	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013411	GAAAT	2	10	428757	428766	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013411	AAAAG	2	10	443339	443348	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013411	GGTAT	2	10	457966	457975	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013411	ATAAA	2	10	463971	463980	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013411	CGGCG	2	10	470371	470380	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
79	NC_013411	ATGGT	2	10	490760	490769	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013411	CGAGG	2	10	493470	493479	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_013411	GTAGC	2	10	518494	518503	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013411	TCATT	2	10	530199	530208	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_013411	AAATA	2	10	537102	537111	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013411	TAAAA	2	10	543203	543212	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013411	AACGA	2	10	543416	543425	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_013411	AGGAG	2	10	544159	544168	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013411	TCGTG	2	10	544574	544583	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_013411	GGGAG	2	10	545965	545974	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013411	GTAGT	2	10	549337	549346	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013411	ATCGA	2	10	549870	549879	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_013411	GAAAA	2	10	550797	550806	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013411	GGTGA	2	10	550829	550838	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013411	CGATT	2	10	561973	561982	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_013411	GATTT	2	10	562056	562065	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013411	TATAA	2	10	564340	564349	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013411	TAAAA	2	10	584173	584182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013411	GAAAC	2	10	592031	592040	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_013411	GCGCC	2	10	596317	596326	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
99	NC_013411	ATCGG	2	10	599548	599557	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_013411	CGAGA	2	10	600063	600072	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_013411	GCTTG	2	10	621971	621980	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_013411	TAACC	2	10	624042	624051	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_013411	GGACT	2	10	627577	627586	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_013411	TTGGC	2	10	627713	627722	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_013411	AATGG	2	10	627960	627969	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013411	TACCA	2	10	634049	634058	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_013411	GAAAT	2	10	645039	645048	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013411	CAAAG	2	10	645375	645384	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_013411	GATAA	2	10	647219	647228	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013411	CGTTT	2	10	649380	649389	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_013411	GAGAC	2	10	649598	649607	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_013411	TCGAG	2	10	675953	675962	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_013411	GAAAT	2	10	681809	681818	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013411	AGAAC	2	10	687750	687759	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_013411	GTTCG	2	10	694208	694217	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_013411	TCTCC	2	10	696633	696642	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
117	NC_013411	TAAAA	2	10	704718	704727	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013411	TGGCT	2	10	710358	710367	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_013411	AGAAC	2	10	717508	717517	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_013411	TTCCG	2	10	718813	718822	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_013411	CGAGA	2	10	733726	733735	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_013411	TGTAT	2	10	743149	743158	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013411	AGGAG	2	10	751665	751674	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013411	AGTAA	2	10	755181	755190	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013411	AAACA	2	10	790836	790845	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_013411	AACGC	2	10	792073	792082	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_013411	CATGG	2	10	792125	792134	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_013411	CGGAA	2	10	799758	799767	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_013411	TCTCC	2	10	809880	809889	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
130	NC_013411	CAAAA	2	10	814920	814929	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_013411	CGTAC	2	10	814999	815008	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_013411	ATGAT	2	10	816291	816300	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013411	TAAAA	2	10	821983	821992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013411	TATTG	2	10	827665	827674	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013411	GAAAG	2	10	830323	830332	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013411	CGTTG	2	10	839078	839087	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_013411	GGCAA	2	10	839146	839155	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_013411	TATAA	2	10	857967	857976	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013411	GGGAG	2	10	879895	879904	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013411	TAAAA	2	10	899495	899504	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013411	CAAAA	2	10	900499	900508	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_013411	TTTCG	2	10	901332	901341	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_013411	AAGCG	2	10	942606	942615	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_013411	GTTTT	2	10	946409	946418	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013411	GGAGA	2	10	946498	946507	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013411	GAAAG	2	10	954369	954378	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013411	GAAGT	2	10	971763	971772	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013411	GCGAA	2	10	973311	973320	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_013411	TAAAA	2	10	981232	981241	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013411	GGTCA	2	10	981438	981447	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_013411	AACGA	2	10	1138883	1138892	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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268	NC_013411	TTATA	2	10	1638602	1638611	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_013411	TGTAT	2	10	1645554	1645563	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_013411	AAAGA	3	15	1659886	1659900	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_013411	GGGGA	2	10	1673523	1673532	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
275	NC_013411	CTTCG	2	10	1676578	1676587	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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277	NC_013411	ATGAT	2	10	1692042	1692051	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_013411	TTGTT	2	10	1710959	1710968	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
281	NC_013411	AAGCG	2	10	1714609	1714618	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
282	NC_013411	ATGAT	2	10	1715462	1715471	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
283	NC_013411	GAAAA	2	10	1723168	1723177	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
284	NC_013411	CGTTC	2	10	1733187	1733196	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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286	NC_013411	CTTGT	2	10	1736554	1736563	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
287	NC_013411	ATGCC	2	10	1736918	1736927	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
288	NC_013411	TTCTG	2	10	1747172	1747181	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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291	NC_013411	CTTGA	2	10	1787269	1787278	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
292	NC_013411	GGCCG	2	10	1807036	1807045	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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295	NC_013411	GCTTC	2	10	1813462	1813471	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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402	NC_013411	GACTG	2	10	2537112	2537121	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
403	NC_013411	GGCAT	2	10	2538741	2538750	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
404	NC_013411	GAAAG	2	10	2538764	2538773	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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407	NC_013411	GGCGC	2	10	2551800	2551809	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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410	NC_013411	AAACA	2	10	2559079	2559088	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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412	NC_013411	GCGAA	2	10	2568255	2568264	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
413	NC_013411	ATAGA	2	10	2568531	2568540	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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419	NC_013411	TTGTA	2	10	2587180	2587189	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
420	NC_013411	ATGGT	2	10	2588935	2588944	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
421	NC_013411	ATAAA	2	10	2601783	2601792	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_013411	CCTCG	2	10	2603019	2603028	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
423	NC_013411	ATCAA	2	10	2603207	2603216	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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453	NC_013411	ACAAA	2	10	2767280	2767289	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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465	NC_013411	GACCG	2	10	2856793	2856802	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
466	NC_013411	AAATA	2	10	2874796	2874805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_013411	TCTAT	2	10	2908380	2908389	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
475	NC_013411	TAATA	2	10	2910048	2910057	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_013411	CAAAA	2	10	2911251	2911260	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
477	NC_013411	TTGAT	2	10	2935935	2935944	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
478	NC_013411	GTTAC	2	10	2938629	2938638	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
479	NC_013411	CTTGT	2	10	2948074	2948083	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
480	NC_013411	GCTTC	2	10	2952274	2952283	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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482	NC_013411	ATAAA	2	10	2962726	2962735	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_013411	TAACA	2	10	2979005	2979014	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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487	NC_013411	ATGGT	2	10	2994548	2994557	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
488	NC_013411	GGAAA	2	10	3001628	3001637	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
489	NC_013411	GCGGG	2	10	3002878	3002887	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
490	NC_013411	GCACA	2	10	3003699	3003708	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
491	NC_013411	TCCCC	2	10	3012589	3012598	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
492	NC_013411	GACAT	2	10	3016590	3016599	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
493	NC_013411	CTTCA	2	10	3021998	3022007	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
494	NC_013411	ACCAA	2	10	3022444	3022453	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
495	NC_013411	GGAAA	2	10	3024743	3024752	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
496	NC_013411	AGGCG	2	10	3025031	3025040	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
497	NC_013411	CCCTC	2	10	3026971	3026980	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
498	NC_013411	GGCTT	2	10	3029448	3029457	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_013411	GGAGA	2	10	3036815	3036824	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding

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