MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Geobacillus sp. Y412MC61 chromosome

Total Repeats: 55863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013411	TGG	2	6	18	23	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013411	CTT	2	6	38	43	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013411	ATC	2	6	92	97	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013411	CAA	2	6	211	216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417501
5	NC_013411	GAA	2	6	336	341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261417501
6	NC_013411	GAT	2	6	375	380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261417501
7	NC_013411	GAA	2	6	381	386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261417501
8	NC_013411	GGC	2	6	579	584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417501
9	NC_013411	TTA	2	6	694	699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261417501
10	NC_013411	GAC	2	6	723	728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417501
11	NC_013411	CAA	2	6	734	739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417501
12	NC_013411	GAT	2	6	768	773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261417501
13	NC_013411	AAG	2	6	805	810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261417501
14	NC_013411	GAG	2	6	840	845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261417501
15	NC_013411	CCG	2	6	876	881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261417501
16	NC_013411	TCA	2	6	934	939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417501
17	NC_013411	CGC	2	6	949	954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261417501
18	NC_013411	TCC	2	6	979	984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261417501
19	NC_013411	CGT	2	6	1091	1096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417501
20	NC_013411	TCG	2	6	1104	1109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417501
21	NC_013411	TCA	2	6	1111	1116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417501
22	NC_013411	GCA	2	6	1140	1145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417501
23	NC_013411	CAT	2	6	1160	1165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417501
24	NC_013411	GTT	2	6	1212	1217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261417501
25	NC_013411	AAC	2	6	1475	1480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417501
26	NC_013411	TAC	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013411	CGA	2	6	1615	1620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013411	GGA	2	6	1634	1639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013411	TGA	2	6	1697	1702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261417502
30	NC_013411	ACG	2	6	1720	1725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417502
31	NC_013411	AAG	2	6	1829	1834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261417502
32	NC_013411	CAA	2	6	1918	1923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417502
33	NC_013411	ATC	2	6	1960	1965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417502
34	NC_013411	CGA	2	6	2007	2012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417502
35	NC_013411	GAA	3	9	2035	2043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261417502
36	NC_013411	CGT	2	6	2247	2252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417502
37	NC_013411	ACC	2	6	2303	2308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261417502
38	NC_013411	GCT	2	6	2376	2381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417502
39	NC_013411	AAC	2	6	2506	2511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417502
40	NC_013411	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417502
41	NC_013411	GGA	2	6	2536	2541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261417502
42	NC_013411	TTC	2	6	2553	2558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261417502
43	NC_013411	AGC	2	6	2588	2593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417502
44	NC_013411	CCT	2	6	2793	2798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_013411	GCC	2	6	2832	2837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_013411	GCT	2	6	2845	2850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013411	AAC	2	6	2986	2991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417503
48	NC_013411	TCG	3	9	3181	3189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417503
49	NC_013411	ATG	2	6	3329	3334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261417504
50	NC_013411	GTC	2	6	3551	3556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417504
51	NC_013411	GCG	2	6	3604	3609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417504
52	NC_013411	GCT	2	6	3679	3684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417504
53	NC_013411	CAA	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417504
54	NC_013411	ATG	2	6	3710	3715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261417504
55	NC_013411	AGC	2	6	3762	3767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417504
56	NC_013411	GGC	2	6	3778	3783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417504
57	NC_013411	GCG	2	6	3796	3801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417504
58	NC_013411	GCT	2	6	3817	3822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417504
59	NC_013411	TAG	2	6	3933	3938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261417504
60	NC_013411	CGC	2	6	3958	3963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261417504
61	NC_013411	AAC	2	6	3991	3996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417504
62	NC_013411	CAA	2	6	4073	4078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417504
63	NC_013411	GAT	2	6	4160	4165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261417504
64	NC_013411	TGA	2	6	4180	4185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261417504
65	NC_013411	CCT	2	6	4201	4206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261417504
66	NC_013411	CAA	3	9	4242	4250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417504
67	NC_013411	AAG	2	6	4281	4286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261417504
68	NC_013411	CTT	2	6	4326	4331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261417504
69	NC_013411	AAC	2	6	4390	4395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417505
70	NC_013411	TCG	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417505
71	NC_013411	ACA	2	6	4528	4533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417505
72	NC_013411	CGA	2	6	4538	4543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417505
73	NC_013411	ACA	2	6	4591	4596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417505
74	NC_013411	CCG	2	6	4660	4665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261417505
75	NC_013411	CGG	2	6	4730	4735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417505
76	NC_013411	GTC	2	6	4758	4763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417505
77	NC_013411	ACG	2	6	4887	4892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417505
78	NC_013411	GAC	2	6	4928	4933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417505
79	NC_013411	GGC	2	6	5055	5060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417505
80	NC_013411	TGC	2	6	5101	5106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417505
81	NC_013411	ACG	2	6	5173	5178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417505
82	NC_013411	CAA	2	6	5207	5212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417505
83	NC_013411	GGC	2	6	5229	5234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417505
84	NC_013411	AGC	2	6	5293	5298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417505
85	NC_013411	ACG	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417505
86	NC_013411	CGA	2	6	5491	5496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417505
87	NC_013411	TCG	2	6	5509	5514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417505
88	NC_013411	ATG	2	6	5523	5528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261417505
89	NC_013411	GCG	2	6	5529	5534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417505
90	NC_013411	GGC	2	6	5546	5551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417505
91	NC_013411	CGT	2	6	5660	5665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417505
92	NC_013411	ATT	2	6	5805	5810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261417505
93	NC_013411	TCA	3	9	5872	5880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417505
94	NC_013411	CTT	2	6	5919	5924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261417505
95	NC_013411	GCC	2	6	5987	5992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261417505
96	NC_013411	CGA	2	6	6088	6093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417505
97	NC_013411	ACG	2	6	6144	6149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417505
98	NC_013411	TGC	2	6	6172	6177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417505
99	NC_013411	GAA	2	6	6264	6269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261417505
100	NC_013411	GCC	2	6	6323	6328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_013411	CTC	2	6	6329	6334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_013411	GCG	2	6	6375	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013411	GGA	2	6	6423	6428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013411	AAC	2	6	6466	6471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417506
105	NC_013411	TTC	2	6	6509	6514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261417506
106	NC_013411	CGC	2	6	6591	6596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261417506
107	NC_013411	TCG	2	6	6661	6666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417506
108	NC_013411	ATC	2	6	6685	6690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417506
109	NC_013411	GCC	2	6	6702	6707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261417506
110	NC_013411	GCA	2	6	6804	6809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417506
111	NC_013411	CAA	2	6	6869	6874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417506
112	NC_013411	TGC	2	6	6928	6933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417506
113	NC_013411	CGA	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417506
114	NC_013411	CCG	2	6	7002	7007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261417506
115	NC_013411	TTG	2	6	7035	7040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261417506
116	NC_013411	AGC	3	9	7201	7209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417506
117	NC_013411	CGA	2	6	7331	7336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417506
118	NC_013411	GCG	2	6	7373	7378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417506
119	NC_013411	ATT	2	6	7510	7515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261417506
120	NC_013411	CCG	2	6	7538	7543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261417506
121	NC_013411	CCG	2	6	7643	7648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261417506
122	NC_013411	GGC	2	6	7664	7669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417506
123	NC_013411	CGA	2	6	7829	7834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417506
124	NC_013411	GCG	2	6	7898	7903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417506
125	NC_013411	GTC	2	6	7968	7973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417506
126	NC_013411	CGG	2	6	8039	8044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417506
127	NC_013411	CGG	2	6	8068	8073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417506
128	NC_013411	ATC	2	6	8208	8213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417506
129	NC_013411	CAA	2	6	8357	8362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261417506
130	NC_013411	ATC	2	6	8439	8444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417506
131	NC_013411	TGA	2	6	8534	8539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261417506
132	NC_013411	AGT	2	6	8549	8554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261417506
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134	NC_013411	CAT	2	6	8577	8582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417506
135	NC_013411	GTC	2	6	8592	8597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417506
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139	NC_013411	GAA	2	6	8889	8894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261417506
140	NC_013411	AGA	3	9	8910	8918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013411	CGT	2	6	8963	8968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013411	GCT	2	6	9266	9271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417507
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152	NC_013411	CGC	2	6	9928	9933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261417507
153	NC_013411	GTC	2	6	9971	9976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261417507
154	NC_013411	ATC	2	6	10049	10054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417507
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157	NC_013411	TTA	2	6	10238	10243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013411	TCA	2	6	10255	10260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_013411	GGC	2	6	10546	10551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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163	NC_013411	GGC	2	6	10720	10725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_013411	CGA	2	6	10794	10799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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263	NC_013411	CAT	2	6	18177	18182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417509
264	NC_013411	ATT	2	6	18241	18246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261417509
265	NC_013411	ATC	2	6	18364	18369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417509
266	NC_013411	CGG	2	6	18375	18380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417509
267	NC_013411	GCC	2	6	18497	18502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261417509
268	NC_013411	GCA	2	6	18551	18556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417509
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270	NC_013411	AAG	2	6	18791	18796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261417509
271	NC_013411	ACT	2	6	18803	18808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417509
272	NC_013411	TCC	2	6	18860	18865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_013411	AGG	2	6	18910	18915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
274	NC_013411	GAG	3	9	18926	18934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261417510
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280	NC_013411	ATG	2	6	19377	19382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261417510
281	NC_013411	ATC	2	6	19549	19554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261417510
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285	NC_013411	GAC	2	6	20109	20114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261417510
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291	NC_013411	CGG	2	6	20558	20563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417511
292	NC_013411	CGC	2	6	20571	20576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261417511
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295	NC_013411	TGA	2	6	20742	20747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261417511
296	NC_013411	GCG	2	6	20815	20820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261417511
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342	NC_013411	CCG	2	6	23661	23666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
343	NC_013411	CGG	2	6	23672	23677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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