MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus vulcanius M7 plasmid pMETVU01

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013408	ATGT	2	8	73	80	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013408	CATA	2	8	181	188	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013408	ACCT	2	8	502	509	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013408	AAGG	2	8	546	553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013408	TAAT	2	8	599	606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013408	TCAG	2	8	1256	1263	25 %	25 %	25 %	25 %	261403861
7	NC_013408	TACA	2	8	2208	2215	50 %	25 %	0 %	25 %	261403864
8	NC_013408	AGAA	2	8	2246	2253	75 %	0 %	25 %	0 %	261403864
9	NC_013408	ACCA	2	8	2362	2369	50 %	0 %	0 %	50 %	261403864
10	NC_013408	ATGA	2	8	2540	2547	50 %	25 %	25 %	0 %	261403864
11	NC_013408	CCCA	2	8	2591	2598	25 %	0 %	0 %	75 %	261403865
12	NC_013408	CCCA	2	8	2687	2694	25 %	0 %	0 %	75 %	261403865
13	NC_013408	CATA	2	8	3050	3057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013408	AAGA	2	8	4117	4124	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013408	ACCC	2	8	4210	4217	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_013408	ATTT	2	8	4328	4335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013408	TTTA	2	8	5119	5126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013408	CGGA	2	8	5467	5474	25 %	0 %	50 %	25 %	261403867
19	NC_013408	TAGC	2	8	6796	6803	25 %	25 %	25 %	25 %	261403869
20	NC_013408	TGAG	2	8	7655	7662	25 %	25 %	50 %	0 %	261403869
21	NC_013408	TTAG	2	8	7753	7760	25 %	50 %	25 %	0 %	261403870
22	NC_013408	CCTT	2	8	7824	7831	0 %	50 %	0 %	50 %	261403870
23	NC_013408	AGGA	2	8	8623	8630	50 %	0 %	50 %	0 %	261403870
24	NC_013408	CGGA	2	8	8647	8654	25 %	0 %	50 %	25 %	261403870
25	NC_013408	TTAA	2	8	9166	9173	50 %	50 %	0 %	0 %	261403870
26	NC_013408	GAAA	2	8	9183	9190	75 %	0 %	25 %	0 %	261403870
27	NC_013408	AGAA	2	8	9379	9386	75 %	0 %	25 %	0 %	261403870
28	NC_013408	TATC	2	8	10449	10456	25 %	50 %	0 %	25 %	261403872
29	NC_013408	TCTT	2	8	10457	10464	0 %	75 %	0 %	25 %	261403872

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.