MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus vulcanius M7 plasmid pMETVU01

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013408	TCC	2	6	908	913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403860
2	NC_013408	AGA	2	6	942	947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403860
3	NC_013408	GAA	2	6	1006	1011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403860
4	NC_013408	GCG	2	6	1073	1078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261403860
5	NC_013408	TTA	2	6	1368	1373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403861
6	NC_013408	ATT	2	6	1403	1408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403861
7	NC_013408	CGG	2	6	1686	1691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261403862
8	NC_013408	CTA	2	6	1862	1867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403863
9	NC_013408	ATA	2	6	1922	1927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403863
10	NC_013408	GGA	2	6	2442	2447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403864
11	NC_013408	TCT	2	6	2462	2467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261403864
12	NC_013408	TGA	2	6	2478	2483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403864
13	NC_013408	CTA	2	6	2518	2523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403864
14	NC_013408	AGG	2	6	2524	2529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403864
15	NC_013408	ACC	2	6	2672	2677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261403865
16	NC_013408	TCT	2	6	2752	2757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261403865
17	NC_013408	TTA	2	6	2830	2835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403865
18	NC_013408	ACC	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261403866
19	NC_013408	ACT	2	6	3342	3347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403866
20	NC_013408	AGT	2	6	3459	3464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403866
21	NC_013408	AGA	2	6	3651	3656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403866
22	NC_013408	CTC	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403866
23	NC_013408	GGA	2	6	3749	3754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403866
24	NC_013408	TTA	2	6	3755	3760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403866
25	NC_013408	GGA	2	6	5329	5334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403867
26	NC_013408	CTC	2	6	5349	5354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403867
27	NC_013408	GGA	2	6	5404	5409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403867
28	NC_013408	TAG	2	6	5558	5563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403868
29	NC_013408	AGG	2	6	5632	5637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403868
30	NC_013408	AAT	2	6	5670	5675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403868
31	NC_013408	TGA	2	6	5894	5899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403869
32	NC_013408	AGG	3	9	5917	5925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
33	NC_013408	AAG	2	6	5976	5981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403869
34	NC_013408	GAG	3	9	5985	5993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
35	NC_013408	TAA	2	6	6020	6025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403869
36	NC_013408	ACC	2	6	6031	6036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261403869
37	NC_013408	CTC	2	6	6045	6050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403869
38	NC_013408	CAT	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403869
39	NC_013408	GAG	2	6	6297	6302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
40	NC_013408	GAG	2	6	6357	6362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
41	NC_013408	GAG	2	6	6381	6386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
42	NC_013408	TTA	2	6	6400	6405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403869
43	NC_013408	CCG	2	6	6426	6431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261403869
44	NC_013408	AAG	2	6	6474	6479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403869
45	NC_013408	TAC	2	6	6528	6533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403869
46	NC_013408	GGA	2	6	6553	6558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
47	NC_013408	AAG	2	6	6576	6581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403869
48	NC_013408	CTT	2	6	6585	6590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261403869
49	NC_013408	AAG	2	6	6666	6671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403869
50	NC_013408	GAG	2	6	6678	6683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
51	NC_013408	AGG	2	6	6712	6717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
52	NC_013408	CCA	2	6	6727	6732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261403869
53	NC_013408	GAG	2	6	6786	6791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
54	NC_013408	ATA	2	6	6856	6861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403869
55	NC_013408	CTC	2	6	6892	6897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403869
56	NC_013408	GGA	2	6	6965	6970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
57	NC_013408	CTA	2	6	6993	6998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403869
58	NC_013408	GAG	2	6	7047	7052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
59	NC_013408	GAG	2	6	7062	7067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
60	NC_013408	ACC	2	6	7215	7220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261403869
61	NC_013408	AAT	2	6	7262	7267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403869
62	NC_013408	CGA	2	6	7310	7315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403869
63	NC_013408	GGA	2	6	7358	7363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
64	NC_013408	GGA	2	6	7400	7405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
65	NC_013408	GAG	2	6	7416	7421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
66	NC_013408	GGA	2	6	7433	7438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
67	NC_013408	CTA	2	6	7492	7497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403869
68	NC_013408	CGG	2	6	7570	7575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261403869
69	NC_013408	ATT	2	6	7708	7713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403870
70	NC_013408	ATT	2	6	7762	7767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403870
71	NC_013408	TAC	2	6	7948	7953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403870
72	NC_013408	CTT	2	6	7981	7986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261403870
73	NC_013408	GGA	2	6	8043	8048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403870
74	NC_013408	TAT	2	6	8170	8175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403870
75	NC_013408	CCA	2	6	8177	8182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261403870
76	NC_013408	TCC	2	6	8241	8246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403870
77	NC_013408	GAG	2	6	8254	8259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403870
78	NC_013408	TGA	2	6	8388	8393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403870
79	NC_013408	GGT	2	6	8544	8549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261403870
80	NC_013408	GTA	2	6	8834	8839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403870
81	NC_013408	AAG	2	6	8905	8910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403870
82	NC_013408	GAG	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403870
83	NC_013408	CTA	2	6	8949	8954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403870
84	NC_013408	GGT	2	6	9198	9203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261403870
85	NC_013408	GAG	2	6	9328	9333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403870
86	NC_013408	AAG	2	6	9345	9350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403870
87	NC_013408	CTA	2	6	9394	9399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403870
88	NC_013408	AAG	2	6	9517	9522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403871
89	NC_013408	TAA	2	6	9527	9532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403871
90	NC_013408	AGG	2	6	9578	9583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403871
91	NC_013408	AGA	2	6	9603	9608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403871
92	NC_013408	AGG	2	6	9614	9619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403871
93	NC_013408	AGA	2	6	9629	9634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403871
94	NC_013408	CTC	2	6	9790	9795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403871
95	NC_013408	GAG	2	6	9802	9807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403871
96	NC_013408	TAA	2	6	9851	9856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403871
97	NC_013408	TGA	2	6	9921	9926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403871
98	NC_013408	CTC	2	6	10165	10170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403872
99	NC_013408	ATA	2	6	10180	10185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403872
100	NC_013408	AGT	2	6	10283	10288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403872
101	NC_013408	CAC	2	6	10305	10310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261403872
102	NC_013408	TAG	2	6	10330	10335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403872
103	NC_013408	AAG	2	6	10519	10524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403872

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.