MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus vulcanius M7 chromosome

Total Repeats: 318

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013407	TTTAAG	2	12	447	458	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013407	CAAAAT	2	12	16573	16584	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013407	AAGATT	2	12	26759	26770	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013407	ATAAAA	2	12	30330	30341	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013407	TAAAAA	2	12	34550	34561	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013407	TTTTAT	2	12	34616	34627	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013407	AAATTA	2	12	39304	39315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013407	TTAATT	2	12	39343	39354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013407	AAATTA	2	12	44270	44281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013407	CATTAT	2	12	46077	46088	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013407	TTATAT	2	12	66468	66479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013407	TTTTAA	2	12	86090	86101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013407	AAATAA	2	12	128420	128431	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013407	TAAAAA	2	12	138949	138960	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013407	TAGAAA	2	12	143594	143605	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013407	AAATAA	2	12	159938	159949	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013407	AGTAAA	2	12	167890	167901	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013407	ACAAAT	2	12	169712	169723	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013407	TTTTTG	2	12	172811	172822	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013407	AAATAT	2	12	172926	172937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013407	TATAAA	2	12	176310	176321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013407	TAAAAT	2	12	178688	178699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013407	TAATTT	2	12	181151	181162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013407	TTAATA	2	12	181213	181224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013407	TAATTT	2	12	183792	183803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013407	TAAAAT	2	12	185090	185101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013407	ATTTTA	2	12	188351	188362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013407	ATTTTA	2	12	189264	189275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013407	ATTTTA	2	12	199108	199119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013407	ATTAAA	2	12	203124	203135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013407	TAAAAA	2	12	209855	209866	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013407	GTTTTA	2	12	218225	218236	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013407	GTTTTT	2	12	225899	225910	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013407	AAATAT	2	12	226164	226175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013407	AAATTA	2	12	230523	230534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013407	TTAAAA	2	12	238148	238159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013407	TAAAAA	2	12	246895	246906	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013407	AAAACT	2	12	257588	257599	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013407	TTTATT	2	12	263628	263639	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013407	TAAAAA	2	12	269971	269982	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013407	TAAAAA	2	12	270089	270100	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013407	AGAAAA	2	12	274099	274110	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013407	CTTTTT	2	12	278589	278600	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_013407	TTAATA	2	12	282081	282092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013407	TATCTA	2	12	284294	284305	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013407	TTTATT	2	12	293048	293059	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013407	AAATAT	2	12	293351	293362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013407	TAAAAT	2	12	294481	294492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013407	ATATTT	2	12	300321	300332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013407	ATTGTT	2	12	315299	315310	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013407	TTCTTT	2	12	316445	316456	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_013407	ATTGTT	2	12	318992	319003	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013407	TTAAAA	2	12	321480	321491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013407	CTATTT	2	12	328033	328044	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013407	TTATAT	2	12	332321	332332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013407	AAAAAT	2	12	341471	341482	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013407	ATAAAA	2	12	342369	342380	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013407	TAAAAA	2	12	343843	343854	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013407	TTGGTA	2	12	351324	351335	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013407	AACATT	2	12	351452	351463	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013407	AATTAA	2	12	358052	358063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013407	ATTTTT	2	12	369434	369445	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013407	TGGTTT	2	12	370804	370815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013407	AAAATG	2	12	373266	373277	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013407	TACTTT	2	12	376287	376298	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013407	AATTAT	2	12	384371	384382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013407	TGAAAT	2	12	386937	386948	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013407	TGAATA	2	12	419610	419621	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013407	TTTTTA	2	12	427101	427112	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013407	TAAAAA	2	12	434707	434718	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013407	AACAAA	2	12	451435	451446	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013407	TAAAGT	2	12	454605	454616	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013407	TAAAAA	2	12	456288	456299	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013407	ATTTTA	2	12	466108	466119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013407	AGAATA	2	12	466329	466340	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013407	TAAGAT	2	12	478020	478031	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013407	ACTTTA	2	12	483718	483729	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_013407	AAAATT	2	12	492363	492374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013407	ATTGTT	2	12	496235	496246	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013407	TTTATT	2	12	496297	496308	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013407	TTTATT	2	12	496337	496348	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013407	TAAAAA	2	12	498196	498207	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013407	ATATTA	2	12	501144	501155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013407	ATTTTT	2	12	503919	503930	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013407	TTATCC	2	12	507584	507595	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013407	TACTTT	2	12	513025	513036	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_013407	TTTTTG	2	12	526898	526909	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013407	TAACCA	2	12	527039	527050	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013407	TAAATT	2	12	545538	545549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013407	TAAAAA	2	12	546150	546161	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013407	CCAAAT	2	12	549500	549511	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013407	AAAATA	2	12	561857	561868	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013407	TTCTAT	2	12	567058	567069	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013407	TAAAAA	2	12	567146	567157	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013407	CATTTT	2	12	570607	570618	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_013407	TGAAAA	2	12	574769	574780	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013407	AAATAT	2	12	590152	590163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013407	ATAAAA	2	12	602434	602445	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013407	ATATAA	2	12	604050	604061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013407	AATTTT	2	12	606518	606529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013407	AAATTA	2	12	606681	606692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013407	TGAATA	2	12	620170	620181	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013407	AAATAA	2	12	621351	621362	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013407	GTAAGG	2	12	624128	624139	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013407	TAAATT	2	12	633510	633521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013407	TAAATT	2	12	633918	633929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013407	AAAATA	3	18	634045	634062	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013407	TAAATC	2	12	636790	636801	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_013407	TATAAA	2	12	636850	636861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013407	ATTTTC	2	12	639895	639906	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_013407	TTTTAA	2	12	646860	646871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013407	ATTTTA	2	12	646884	646895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013407	TATTCT	2	12	660959	660970	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_013407	TTTTTA	2	12	662197	662208	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013407	ATTTTT	2	12	668609	668620	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013407	AGTTTT	2	12	679642	679653	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013407	TTAGTA	2	12	681552	681563	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013407	ATCTAT	2	12	686100	686111	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_013407	TATTTT	2	12	687297	687308	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013407	TAAAAA	2	12	690347	690358	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013407	TGAATT	2	12	690892	690903	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013407	TTTAAT	2	12	691802	691813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013407	TTAATT	2	12	695653	695664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013407	TATTTT	2	12	695737	695748	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013407	AATTTT	2	12	702222	702233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013407	ATTTTA	2	12	706034	706045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013407	AAATAA	2	12	722702	722713	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013407	CTAAAA	2	12	729381	729392	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_013407	AGTGAA	2	12	741489	741500	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013407	AAATAT	2	12	743081	743092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013407	ATCTTA	2	12	745847	745858	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_013407	TAAAAT	2	12	751500	751511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013407	TTTTAT	2	12	756530	756541	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.