MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus vulcanius M7 chromosome

Total Repeats: 564

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013407	ATTAA	2	10	200	209	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013407	TAAAA	2	10	1028	1037	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013407	TATAT	2	10	2116	2125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013407	CAAAA	2	10	15476	15485	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013407	AAAAT	2	10	20420	20429	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013407	CTTAT	2	10	23540	23549	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013407	CGAAG	2	10	23868	23877	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013407	ATAAC	2	10	39639	39648	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013407	TATAT	2	10	40452	40461	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013407	ATAAA	2	10	44529	44538	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013407	TATCT	2	10	46193	46202	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013407	ATTAA	2	10	46666	46675	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013407	TTTGA	2	10	46861	46870	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013407	TTCTT	2	10	48442	48451	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013407	TAATT	2	10	50573	50582	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013407	TTTAA	2	10	50583	50592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013407	ATAAA	2	10	52223	52232	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013407	TTTAC	2	10	53138	53147	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013407	TTCTT	2	10	53278	53287	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013407	TATTT	2	10	57623	57632	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013407	TCATT	2	10	72856	72865	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013407	TATTT	2	10	76767	76776	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013407	ATAAA	2	10	79092	79101	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013407	AATTA	2	10	79230	79239	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013407	TTATT	2	10	79247	79256	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013407	ATTTA	2	10	79400	79409	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013407	TATTT	2	10	91489	91498	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013407	AAAAT	2	10	95008	95017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013407	ATAAA	2	10	96518	96527	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013407	AGGTA	2	10	97288	97297	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013407	AGATG	2	10	97298	97307	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013407	CCTAA	2	10	97970	97979	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_013407	TCTCT	2	10	117462	117471	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_013407	TTATT	2	10	128159	128168	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013407	GTGTT	2	10	131079	131088	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013407	TTAAA	2	10	132720	132729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013407	TTTAA	2	10	136382	136391	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013407	ATAAA	2	10	138961	138970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013407	TTTTA	2	10	144647	144656	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013407	TAAAA	2	10	147866	147875	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013407	AAAAT	2	10	159324	159333	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013407	AAAAT	2	10	159606	159615	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013407	GTTGG	2	10	161507	161516	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013407	TATAC	2	10	165466	165475	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_013407	TGATA	2	10	169774	169783	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013407	TTTAG	2	10	172652	172661	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013407	TTGTT	2	10	172861	172870	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013407	TTAAA	2	10	175256	175265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013407	AATTA	2	10	178508	178517	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013407	AATTT	2	10	180814	180823	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013407	TTATA	2	10	181237	181246	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013407	ATTAA	2	10	186049	186058	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013407	ATTTA	2	10	189327	189336	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013407	TTTTA	2	10	189883	189892	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013407	ATTTT	2	10	192553	192562	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013407	ATATT	2	10	194459	194468	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013407	ATAAA	2	10	194470	194479	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013407	TATTT	2	10	194543	194552	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013407	TTTAT	2	10	195712	195721	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013407	ATTAT	2	10	196388	196397	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013407	TATAT	2	10	206825	206834	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013407	TTAAT	2	10	207525	207534	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013407	GTTTA	2	10	214276	214285	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013407	GTTCT	2	10	223604	223613	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013407	TTGTT	2	10	226099	226108	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013407	AATTA	2	10	226344	226353	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013407	TTTTA	2	10	229602	229611	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013407	TAAAA	2	10	230682	230691	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013407	TTTAT	2	10	236592	236601	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013407	TTTAA	2	10	238096	238105	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013407	TGATA	2	10	238110	238119	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013407	AATTT	2	10	238234	238243	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013407	AAATT	2	10	243359	243368	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013407	ATAAA	2	10	249747	249756	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013407	TTAAA	2	10	261330	261339	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013407	TAATA	2	10	263586	263595	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013407	ATTTT	2	10	264384	264393	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013407	ATTAT	2	10	268526	268535	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013407	TTTAA	2	10	268548	268557	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013407	TAAAT	2	10	268744	268753	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013407	AGATC	2	10	270018	270027	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013407	AATTA	2	10	270159	270168	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013407	CTTAA	2	10	280319	280328	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_013407	ATTTG	2	10	280372	280381	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013407	TTAAT	2	10	282032	282041	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013407	CATAA	2	10	282135	282144	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_013407	TGTTA	2	10	283519	283528	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013407	CTTAA	2	10	283600	283609	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013407	ATAAG	2	10	290345	290354	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013407	ATTTT	2	10	292997	293006	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013407	TTGTT	2	10	293286	293295	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013407	AAAGG	2	10	293307	293316	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013407	AAACT	2	10	294669	294678	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_013407	TTTTA	2	10	299676	299685	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013407	TTAGC	2	10	300011	300020	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_013407	CCTTT	2	10	300368	300377	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_013407	AACAA	2	10	300389	300398	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_013407	TTAAT	2	10	312604	312613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013407	ATAAA	2	10	325181	325190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013407	ATTTT	2	10	328060	328069	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013407	ATTTT	2	10	334660	334669	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013407	GATAA	2	10	351652	351661	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013407	ATTAT	2	10	352257	352266	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013407	TTATT	2	10	356387	356396	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013407	TTAAT	2	10	356409	356418	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013407	ACACC	2	10	372203	372212	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_013407	TAATG	2	10	373207	373216	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013407	TTTGT	2	10	376575	376584	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013407	ATCTA	2	10	378352	378361	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_013407	ATTTA	2	10	379216	379225	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013407	TGTAT	2	10	384151	384160	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013407	AAGAG	2	10	385999	386008	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013407	TAATT	2	10	386915	386924	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013407	AATTA	2	10	391117	391126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013407	TTTAA	2	10	391181	391190	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013407	TAGAA	2	10	391236	391245	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013407	ATAAA	2	10	391851	391860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013407	ATTTT	2	10	393642	393651	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013407	ATTTA	2	10	397912	397921	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013407	AGTAA	2	10	410615	410624	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013407	ATAAG	2	10	416628	416637	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013407	TATCT	2	10	420370	420379	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_013407	ATAAA	2	10	420488	420497	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013407	ATTAA	2	10	422149	422158	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013407	AATTA	2	10	422775	422784	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013407	TTATA	2	10	426134	426143	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013407	TAATA	2	10	429258	429267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013407	AAATT	2	10	432463	432472	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013407	ATAAA	2	10	436529	436538	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013407	TTTAA	2	10	440785	440794	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013407	TTTTG	2	10	443251	443260	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013407	TTTAA	2	10	450381	450390	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013407	AACAA	2	10	451389	451398	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_013407	ATTTT	2	10	453838	453847	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013407	TAATG	2	10	454560	454569	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013407	TAATT	2	10	462833	462842	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013407	GAATA	2	10	470780	470789	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013407	ATTTT	2	10	472397	472406	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013407	TAACT	2	10	472986	472995	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_013407	TAATT	2	10	473026	473035	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013407	ATATA	2	10	474135	474144	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013407	AAATT	2	10	474288	474297	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013407	AATAA	2	10	492208	492217	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013407	AGAAC	2	10	492334	492343	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_013407	TTTTA	2	10	496536	496545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013407	TGTTT	2	10	498144	498153	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013407	ATATT	2	10	498267	498276	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_013407	ATTAT	2	10	503956	503965	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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