MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus vulcanius M7 chromosome

Total Repeats: 1358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013407	TTATT	2	10	1587	1596	20 %	80 %	0 %	0 %	261402133
2	NC_013407	TTTTC	2	10	1958	1967	0 %	80 %	0 %	20 %	261402133
3	NC_013407	TTTTC	2	10	3410	3419	0 %	80 %	0 %	20 %	261402135
4	NC_013407	ATAGG	2	10	4593	4602	40 %	20 %	40 %	0 %	261402135
5	NC_013407	AATAA	2	10	4645	4654	80 %	20 %	0 %	0 %	261402135
6	NC_013407	TTTGC	2	10	6478	6487	0 %	60 %	20 %	20 %	261402137
7	NC_013407	TAGTT	2	10	9040	9049	20 %	60 %	20 %	0 %	261402138
8	NC_013407	TAAAA	2	10	9440	9449	80 %	20 %	0 %	0 %	261402139
9	NC_013407	CTGAT	2	10	10514	10523	20 %	40 %	20 %	20 %	261402140
10	NC_013407	AGCAA	2	10	12506	12515	60 %	0 %	20 %	20 %	261402142
11	NC_013407	ATCTT	2	10	13121	13130	20 %	60 %	0 %	20 %	261402143
12	NC_013407	TAATT	2	10	13495	13504	40 %	60 %	0 %	0 %	261402144
13	NC_013407	CAACC	2	10	15000	15009	40 %	0 %	0 %	60 %	261402146
14	NC_013407	TCAGT	2	10	16083	16092	20 %	40 %	20 %	20 %	261402147
15	NC_013407	CTTTT	2	10	16198	16207	0 %	80 %	0 %	20 %	261402147
16	NC_013407	TTCTC	2	10	17373	17382	0 %	60 %	0 %	40 %	261402148
17	NC_013407	ATTAC	2	10	18521	18530	40 %	40 %	0 %	20 %	261402149
18	NC_013407	TTAAA	2	10	20431	20440	60 %	40 %	0 %	0 %	261402152
19	NC_013407	GTATT	2	10	21012	21021	20 %	60 %	20 %	0 %	261402152
20	NC_013407	AATCA	2	10	22137	22146	60 %	20 %	0 %	20 %	261402153
21	NC_013407	TAAAA	2	10	23054	23063	80 %	20 %	0 %	0 %	261402155
22	NC_013407	AAATA	2	10	24578	24587	80 %	20 %	0 %	0 %	261402156
23	NC_013407	ATCCT	2	10	27358	27367	20 %	40 %	0 %	40 %	261402158
24	NC_013407	CAAAA	2	10	28113	28122	80 %	0 %	0 %	20 %	261402160
25	NC_013407	ATTAA	2	10	29803	29812	60 %	40 %	0 %	0 %	261402160
26	NC_013407	AAAAT	2	10	33037	33046	80 %	20 %	0 %	0 %	261402162
27	NC_013407	AAAAT	2	10	33871	33880	80 %	20 %	0 %	0 %	261402163
28	NC_013407	CTTAT	2	10	34297	34306	20 %	60 %	0 %	20 %	261402163
29	NC_013407	TTACA	2	10	35338	35347	40 %	40 %	0 %	20 %	261402165
30	NC_013407	CTCAT	2	10	36463	36472	20 %	40 %	0 %	40 %	261402166
31	NC_013407	TTTTA	2	10	36880	36889	20 %	80 %	0 %	0 %	261402167
32	NC_013407	ACATC	2	10	37804	37813	40 %	20 %	0 %	40 %	261402167
33	NC_013407	TTTTA	2	10	40905	40914	20 %	80 %	0 %	0 %	261402170
34	NC_013407	TTATT	2	10	40919	40928	20 %	80 %	0 %	0 %	261402170
35	NC_013407	TTTCA	2	10	41304	41313	20 %	60 %	0 %	20 %	261402170
36	NC_013407	TTATT	2	10	41348	41357	20 %	80 %	0 %	0 %	261402170
37	NC_013407	TGAGA	2	10	43511	43520	40 %	20 %	40 %	0 %	261402172
38	NC_013407	TATGA	2	10	43628	43637	40 %	40 %	20 %	0 %	261402172
39	NC_013407	CTCTT	2	10	45139	45148	0 %	60 %	0 %	40 %	261402173
40	NC_013407	TTTAT	2	10	45664	45673	20 %	80 %	0 %	0 %	261402173
41	NC_013407	ACACT	2	10	47296	47305	40 %	20 %	0 %	40 %	261402175
42	NC_013407	ATGCC	2	10	47920	47929	20 %	20 %	20 %	40 %	261402175
43	NC_013407	GATAT	2	10	49381	49390	40 %	40 %	20 %	0 %	261402176
44	NC_013407	ATAGT	2	10	50321	50330	40 %	40 %	20 %	0 %	261402177
45	NC_013407	ATCCT	2	10	50814	50823	20 %	40 %	0 %	40 %	261402178
46	NC_013407	AAGAG	2	10	56535	56544	60 %	0 %	40 %	0 %	261402185
47	NC_013407	TCTAT	2	10	57846	57855	20 %	60 %	0 %	20 %	261402187
48	NC_013407	AGTTT	2	10	58462	58471	20 %	60 %	20 %	0 %	261402187
49	NC_013407	GGATT	2	10	58823	58832	20 %	40 %	40 %	0 %	261402187
50	NC_013407	TTTAA	2	10	58897	58906	40 %	60 %	0 %	0 %	261402187
51	NC_013407	TATAA	2	10	59209	59218	60 %	40 %	0 %	0 %	261402187
52	NC_013407	GCTAT	2	10	59965	59974	20 %	40 %	20 %	20 %	261402188
53	NC_013407	ATAAA	2	10	60625	60634	80 %	20 %	0 %	0 %	261402188
54	NC_013407	TTATA	2	10	61145	61154	40 %	60 %	0 %	0 %	261402188
55	NC_013407	ATAAA	2	10	63969	63978	80 %	20 %	0 %	0 %	261402190
56	NC_013407	AAGAA	2	10	64419	64428	80 %	0 %	20 %	0 %	261402191
57	NC_013407	AGTTG	2	10	64617	64626	20 %	40 %	40 %	0 %	261402191
58	NC_013407	TTTAT	2	10	65200	65209	20 %	80 %	0 %	0 %	261402192
59	NC_013407	TGGAT	2	10	65958	65967	20 %	40 %	40 %	0 %	261402193
60	NC_013407	TTTTA	2	10	69700	69709	20 %	80 %	0 %	0 %	261402197
61	NC_013407	TTAAT	2	10	69987	69996	40 %	60 %	0 %	0 %	261402197
62	NC_013407	ATTTT	2	10	70253	70262	20 %	80 %	0 %	0 %	261402197
63	NC_013407	TTTAT	2	10	70661	70670	20 %	80 %	0 %	0 %	261402197
64	NC_013407	TAAAT	2	10	71186	71195	60 %	40 %	0 %	0 %	261402198
65	NC_013407	TAATT	2	10	71240	71249	40 %	60 %	0 %	0 %	261402198
66	NC_013407	TTTGC	2	10	72266	72275	0 %	60 %	20 %	20 %	261402199
67	NC_013407	TTTGT	2	10	72756	72765	0 %	80 %	20 %	0 %	261402199
68	NC_013407	ATTTT	2	10	73068	73077	20 %	80 %	0 %	0 %	261402200
69	NC_013407	ATTTA	2	10	74145	74154	40 %	60 %	0 %	0 %	261402201
70	NC_013407	CTTTT	2	10	74532	74541	0 %	80 %	0 %	20 %	261402201
71	NC_013407	CTTTT	2	10	76190	76199	0 %	80 %	0 %	20 %	261402203
72	NC_013407	ATTTT	2	10	77046	77055	20 %	80 %	0 %	0 %	261402204
73	NC_013407	CATTT	2	10	77290	77299	20 %	60 %	0 %	20 %	261402204
74	NC_013407	AAAAT	2	10	80074	80083	80 %	20 %	0 %	0 %	261402206
75	NC_013407	CCTCT	2	10	85494	85503	0 %	40 %	0 %	60 %	261402212
76	NC_013407	CATCC	2	10	85620	85629	20 %	20 %	0 %	60 %	261402212
77	NC_013407	TCTTT	2	10	87054	87063	0 %	80 %	0 %	20 %	261402213
78	NC_013407	TTCAA	2	10	87263	87272	40 %	40 %	0 %	20 %	261402213
79	NC_013407	TTTTA	2	10	87511	87520	20 %	80 %	0 %	0 %	261402213
80	NC_013407	TAAAT	2	10	87904	87913	60 %	40 %	0 %	0 %	261402213
81	NC_013407	TATCT	2	10	88651	88660	20 %	60 %	0 %	20 %	261402213
82	NC_013407	ATTTC	2	10	88793	88802	20 %	60 %	0 %	20 %	261402213
83	NC_013407	TTTTA	2	10	88885	88894	20 %	80 %	0 %	0 %	261402213
84	NC_013407	CTTTT	2	10	89515	89524	0 %	80 %	0 %	20 %	261402213
85	NC_013407	ATTCC	2	10	90579	90588	20 %	40 %	0 %	40 %	261402213
86	NC_013407	TTTAT	2	10	91193	91202	20 %	80 %	0 %	0 %	261402213
87	NC_013407	TCTAT	2	10	91217	91226	20 %	60 %	0 %	20 %	261402213
88	NC_013407	TATCA	2	10	93705	93714	40 %	40 %	0 %	20 %	261402215
89	NC_013407	TATTT	2	10	94206	94215	20 %	80 %	0 %	0 %	261402216
90	NC_013407	TAAAT	2	10	95537	95546	60 %	40 %	0 %	0 %	261402217
91	NC_013407	TTTTA	2	10	96569	96578	20 %	80 %	0 %	0 %	261402218
92	NC_013407	CAACT	2	10	96854	96863	40 %	20 %	0 %	40 %	261402218
93	NC_013407	AAACC	2	10	98314	98323	60 %	0 %	0 %	40 %	261402220
94	NC_013407	CATTG	2	10	98851	98860	20 %	40 %	20 %	20 %	261402221
95	NC_013407	GAAAA	2	10	99749	99758	80 %	0 %	20 %	0 %	261402222
96	NC_013407	AGGGG	2	10	100281	100290	20 %	0 %	80 %	0 %	261402223
97	NC_013407	CTACA	2	10	101594	101603	40 %	20 %	0 %	40 %	261402225
98	NC_013407	GAGAG	2	10	102736	102745	40 %	0 %	60 %	0 %	261402227
99	NC_013407	AGAAC	2	10	103188	103197	60 %	0 %	20 %	20 %	261402227
100	NC_013407	ATTGG	2	10	103845	103854	20 %	40 %	40 %	0 %	261402228
101	NC_013407	GTATG	2	10	104231	104240	20 %	40 %	40 %	0 %	261402228
102	NC_013407	GAAGA	2	10	104817	104826	60 %	0 %	40 %	0 %	261402228
103	NC_013407	ATTTA	2	10	105015	105024	40 %	60 %	0 %	0 %	261402229
104	NC_013407	AAAAG	2	10	107222	107231	80 %	0 %	20 %	0 %	261402230
105	NC_013407	ATCCT	2	10	108745	108754	20 %	40 %	0 %	40 %	261402231
106	NC_013407	GAAAT	2	10	109614	109623	60 %	20 %	20 %	0 %	261402231
107	NC_013407	TATAA	2	10	109862	109871	60 %	40 %	0 %	0 %	261402231
108	NC_013407	TTGTT	2	10	112309	112318	0 %	80 %	20 %	0 %	261402234
109	NC_013407	ATTTT	2	10	113445	113454	20 %	80 %	0 %	0 %	261402235
110	NC_013407	TTTGG	2	10	114060	114069	0 %	60 %	40 %	0 %	261402235
111	NC_013407	TTCTT	2	10	118634	118643	0 %	80 %	0 %	20 %	261402237
112	NC_013407	AGGAA	2	10	119271	119280	60 %	0 %	40 %	0 %	261402238
113	NC_013407	TCTCT	2	10	119935	119944	0 %	60 %	0 %	40 %	261402239
114	NC_013407	CATAA	2	10	120315	120324	60 %	20 %	0 %	20 %	261402240
115	NC_013407	TATAA	2	10	121843	121852	60 %	40 %	0 %	0 %	261402242
116	NC_013407	CCTTC	2	10	122454	122463	0 %	40 %	0 %	60 %	261402242
117	NC_013407	GATAT	2	10	122477	122486	40 %	40 %	20 %	0 %	261402242
118	NC_013407	TAGTT	2	10	122932	122941	20 %	60 %	20 %	0 %	261402242
119	NC_013407	ATTTT	2	10	123503	123512	20 %	80 %	0 %	0 %	261402244
120	NC_013407	ATAAC	2	10	125272	125281	60 %	20 %	0 %	20 %	261402246
121	NC_013407	ATAAC	2	10	128728	128737	60 %	20 %	0 %	20 %	261402248
122	NC_013407	ATCCA	2	10	129777	129786	40 %	20 %	0 %	40 %	261402249
123	NC_013407	TTTTA	2	10	130566	130575	20 %	80 %	0 %	0 %	261402250
124	NC_013407	ATAAA	2	10	131695	131704	80 %	20 %	0 %	0 %	261402251
125	NC_013407	TAAAT	2	10	134578	134587	60 %	40 %	0 %	0 %	261402254
126	NC_013407	AAAGC	2	10	135632	135641	60 %	0 %	20 %	20 %	261402256
127	NC_013407	GAGAA	2	10	136664	136673	60 %	0 %	40 %	0 %	261402257
128	NC_013407	CTCAT	2	10	138519	138528	20 %	40 %	0 %	40 %	261402257
129	NC_013407	CTTTT	2	10	141518	141527	0 %	80 %	0 %	20 %	261402260
130	NC_013407	ATTAT	2	10	142106	142115	40 %	60 %	0 %	0 %	261402262
131	NC_013407	ATAAA	2	10	142554	142563	80 %	20 %	0 %	0 %	261402262
132	NC_013407	TCTCT	2	10	143324	143333	0 %	60 %	0 %	40 %	261402263
133	NC_013407	CAATT	2	10	146320	146329	40 %	40 %	0 %	20 %	261402266
134	NC_013407	ATTAT	2	10	146348	146357	40 %	60 %	0 %	0 %	261402266
135	NC_013407	TTCTT	2	10	146402	146411	0 %	80 %	0 %	20 %	261402266
136	NC_013407	ACAAA	2	10	148079	148088	80 %	0 %	0 %	20 %	261402269
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