MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus vulcanius M7 chromosome

Total Repeats: 3747

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013407	ATC	2	6	305	310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013407	TTA	2	6	529	534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013407	CTG	2	6	579	584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013407	TAA	2	6	601	606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013407	ATT	2	6	651	656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013407	TAC	2	6	707	712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013407	TCA	2	6	732	737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013407	ATA	2	6	2041	2046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013407	TCA	2	6	6493	6498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013407	CCA	2	6	9089	9094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_013407	TAA	2	6	9185	9190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013407	ATT	2	6	10918	10923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013407	TAT	2	6	14218	14223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013407	TAA	2	6	14283	14288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013407	TAA	3	9	15442	15450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013407	ATT	2	6	16470	16475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013407	ACA	2	6	16476	16481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013407	ATT	2	6	16504	16509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013407	TTA	2	6	19322	19327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013407	TCT	2	6	22016	22021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013407	TTC	2	6	22028	22033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013407	CTT	2	6	23422	23427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013407	TAA	2	6	23442	23447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013407	AAC	2	6	23455	23460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013407	ATC	2	6	23524	23529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013407	TAA	2	6	23572	23577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013407	ATT	2	6	23683	23688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013407	CCT	2	6	23825	23830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_013407	TAA	2	6	23920	23925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013407	AAT	2	6	23940	23945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013407	TAT	2	6	23946	23951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013407	GAG	2	6	24007	24012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013407	TCA	2	6	24044	24049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013407	TTC	2	6	24131	24136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013407	TAA	2	6	25355	25360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013407	ATT	2	6	26645	26650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013407	TAT	2	6	26714	26719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013407	TAA	2	6	26828	26833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013407	ATT	2	6	26866	26871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013407	TCT	2	6	26894	26899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013407	GTA	2	6	27551	27556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013407	ATT	2	6	27977	27982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013407	AAC	2	6	27990	27995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013407	AAC	2	6	27999	28004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013407	AAC	2	6	28007	28012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013407	TAA	2	6	30138	30143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013407	ATA	2	6	30178	30183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013407	CAT	2	6	30209	30214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013407	AAT	2	6	30305	30310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013407	GGT	2	6	30374	30379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013407	ATT	2	6	34595	34600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013407	TTC	2	6	36871	36876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013407	ATA	2	6	39051	39056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013407	TAT	2	6	39065	39070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013407	TAT	2	6	39082	39087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013407	TAA	2	6	39185	39190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013407	ATT	2	6	39221	39226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013407	AAG	2	6	39266	39271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013407	TAA	2	6	39298	39303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013407	ATA	2	6	39520	39525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013407	AAT	2	6	39554	39559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013407	CAA	2	6	40398	40403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013407	ATA	2	6	40413	40418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013407	TAG	2	6	40465	40470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013407	AAT	2	6	40475	40480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013407	TAA	2	6	40523	40528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013407	CTT	2	6	40579	40584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013407	AGA	2	6	40770	40775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013407	TAA	2	6	44324	44329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013407	TAA	2	6	44331	44336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013407	TTG	2	6	44428	44433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013407	AAC	2	6	44539	44544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013407	AAT	2	6	46110	46115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013407	GTT	2	6	46130	46135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013407	GTT	2	6	46203	46208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013407	ATA	2	6	46212	46217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013407	AAT	2	6	46265	46270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013407	TTA	2	6	46282	46287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013407	CTA	2	6	46441	46446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013407	TTC	2	6	46447	46452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013407	TAA	2	6	46536	46541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013407	AGT	2	6	46620	46625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013407	AAT	2	6	46676	46681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013407	TAA	2	6	46686	46691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013407	TCT	3	9	46699	46707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013407	CAT	2	6	46982	46987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013407	TAA	2	6	48354	48359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013407	TCT	2	6	48424	48429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013407	AAC	2	6	48522	48527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013407	GAT	2	6	48592	48597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013407	TTC	2	6	48601	48606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013407	TAC	2	6	48661	48666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013407	ATT	2	6	48728	48733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013407	GTA	2	6	48946	48951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013407	ATT	2	6	49116	49121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013407	GGT	2	6	49321	49326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013407	AGG	2	6	50151	50156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013407	ATT	2	6	50507	50512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013407	TAT	2	6	50553	50558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013407	ATA	2	6	52112	52117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013407	ATT	2	6	52162	52167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013407	TAA	2	6	52277	52282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013407	TTA	2	6	52674	52679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013407	TAA	2	6	52690	52695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013407	CTT	2	6	52697	52702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013407	TCT	2	6	53061	53066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013407	CAA	2	6	53070	53075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013407	ATT	2	6	53113	53118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013407	ATT	2	6	53232	53237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013407	TAT	2	6	53245	53250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013407	ATT	2	6	53291	53296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013407	TTA	2	6	53317	53322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013407	AAT	2	6	53337	53342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013407	TAA	2	6	53402	53407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013407	GGA	2	6	53453	53458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013407	TAT	2	6	54386	54391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013407	AAT	2	6	54423	54428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013407	ATT	2	6	56656	56661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013407	ATA	2	6	56709	56714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013407	AAT	2	6	56761	56766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013407	TTG	2	6	56769	56774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013407	GAA	3	9	57373	57381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013407	TCT	2	6	57385	57390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013407	GTT	2	6	57421	57426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013407	CAA	2	6	57434	57439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013407	ATG	2	6	57500	57505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013407	GAA	2	6	57617	57622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013407	CAT	2	6	66490	66495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013407	AAT	2	6	66532	66537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013407	AGA	2	6	71897	71902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013407	AAT	2	6	72870	72875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013407	AAC	2	6	76700	76705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013407	TTA	2	6	76799	76804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013407	TAA	2	6	76835	76840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013407	TTA	2	6	78725	78730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013407	CAA	2	6	79102	79107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013407	TGT	2	6	79186	79191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013407	ATA	2	6	79241	79246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013407	TTA	2	6	79317	79322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013407	TAG	2	6	79329	79334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013407	TAA	2	6	79377	79382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013407	TAA	2	6	79394	79399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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414	NC_013407	ATT	2	6	218916	218921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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