MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 plasmid pADEG01

Total Repeats: 15

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013386	GCGGTC	2	12	1050	1061	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260893986
2	NC_013386	CAGGGT	2	12	1343	1354	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260893986
3	NC_013386	CATCGA	2	12	1570	1581	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260893986
4	NC_013386	GCCCAC	2	12	1886	1897	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260893986
5	NC_013386	TGACAG	2	12	2425	2436	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260893986
6	NC_013386	CGTGAC	2	12	2630	2641	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260893986
7	NC_013386	CGCAGG	2	12	7410	7421	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893989
8	NC_013386	GGCAGG	2	12	7752	7763	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	260893989
9	NC_013386	TGGCGG	2	12	10815	10826	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260893993
10	NC_013386	TCTTCC	2	12	15099	15110	0 %	50 %	0 %	50 %	260893997
11	NC_013386	CCTCAC	2	12	17514	17525	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	260893999
12	NC_013386	TTTCCT	2	12	21965	21976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260894005
13	NC_013386	AACCCC	2	12	22229	22240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260894005
14	NC_013386	TCCTTC	2	12	23031	23042	0 %	50 %	0 %	50 %	260894006
15	NC_013386	CCGCAG	2	12	23075	23086	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260894006

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.