MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ammonifex degensii KC4 plasmid pADEG01

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013386	ACCGT	2	10	954	963	20 %	20 %	20 %	40 %	260893986
2	NC_013386	GGACG	2	10	1616	1625	20 %	0 %	60 %	20 %	260893986
3	NC_013386	AAGCA	2	10	6804	6813	60 %	0 %	20 %	20 %	260893988
4	NC_013386	CGAAG	2	10	9526	9535	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013386	GGAAG	2	10	9690	9699	40 %	0 %	60 %	0 %	260893993
6	NC_013386	ACGCG	2	10	10518	10527	20 %	0 %	40 %	40 %	260893993
7	NC_013386	GGAAG	2	10	11532	11541	40 %	0 %	60 %	0 %	260893994
8	NC_013386	GGCCA	2	10	11593	11602	20 %	0 %	40 %	40 %	260893994
9	NC_013386	GCTTT	2	10	12921	12930	0 %	60 %	20 %	20 %	260893995
10	NC_013386	GGGAA	2	10	17386	17395	40 %	0 %	60 %	0 %	260893999
11	NC_013386	CCTCG	2	10	17539	17548	0 %	20 %	20 %	60 %	260894000
12	NC_013386	ACCGC	2	10	18626	18635	20 %	0 %	20 %	60 %	260894001
13	NC_013386	CTTCC	2	10	19608	19617	0 %	40 %	0 %	60 %	260894002
14	NC_013386	CTTCC	2	10	20018	20027	0 %	40 %	0 %	60 %	260894004
15	NC_013386	CCCAA	2	10	21646	21655	40 %	0 %	0 %	60 %	260894005
16	NC_013386	GCCAG	2	10	22420	22429	20 %	0 %	40 %	40 %	260894005
17	NC_013386	CAAAA	2	10	24488	24497	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013386	GTCCT	2	10	24714	24723	0 %	40 %	20 %	40 %	260894009
19	NC_013386	ACCGT	2	10	26544	26553	20 %	20 %	20 %	40 %	260894011
20	NC_013386	GCCCT	2	10	27066	27075	0 %	20 %	20 %	60 %	260894012
21	NC_013386	ACATT	2	10	27678	27687	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.