MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Ammonifex degensii KC4 plasmid pADEG01

Total Repeats: 422

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013386	AAG	2	6	9	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013386	CTG	3	9	98	106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893986
3	NC_013386	CTG	2	6	143	148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893986
4	NC_013386	GAA	2	6	209	214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893986
5	NC_013386	ACC	2	6	267	272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893986
6	NC_013386	ACC	2	6	300	305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893986
7	NC_013386	TGA	2	6	316	321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893986
8	NC_013386	CGT	2	6	340	345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893986
9	NC_013386	TGT	2	6	355	360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260893986
10	NC_013386	GGC	3	9	428	436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893986
11	NC_013386	TCA	3	9	579	587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893986
12	NC_013386	TGC	3	9	730	738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893986
13	NC_013386	GAT	3	9	749	757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893986
14	NC_013386	GGA	2	6	864	869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893986
15	NC_013386	CTT	2	6	938	943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893986
16	NC_013386	GAT	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893986
17	NC_013386	GCG	2	6	1036	1041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893986
18	NC_013386	GAA	2	6	1044	1049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893986
19	NC_013386	CAC	2	6	1085	1090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893986
20	NC_013386	GCC	2	6	1112	1117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893986
21	NC_013386	GCC	2	6	1149	1154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893986
22	NC_013386	TGC	2	6	1210	1215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893986
23	NC_013386	ATG	2	6	1437	1442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893986
24	NC_013386	GTG	2	6	1518	1523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893986
25	NC_013386	GAC	2	6	1532	1537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893986
26	NC_013386	TTG	2	6	1674	1679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260893986
27	NC_013386	CCG	2	6	1717	1722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893986
28	NC_013386	GCC	2	6	1775	1780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893986
29	NC_013386	TCC	2	6	1806	1811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893986
30	NC_013386	TGA	2	6	1819	1824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893986
31	NC_013386	CGC	2	6	1837	1842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893986
32	NC_013386	CAG	2	6	2038	2043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893986
33	NC_013386	AGC	2	6	2177	2182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893986
34	NC_013386	GCT	2	6	2189	2194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893986
35	NC_013386	ACT	2	6	2387	2392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893986
36	NC_013386	TTG	3	9	2490	2498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260893986
37	NC_013386	CGA	2	6	2542	2547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893986
38	NC_013386	CGG	2	6	2695	2700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893986
39	NC_013386	TGG	3	9	2704	2712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893986
40	NC_013386	GTA	3	9	2757	2765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893986
41	NC_013386	CCG	2	6	2787	2792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893986
42	NC_013386	AGC	2	6	3125	3130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893986
43	NC_013386	AGT	2	6	3145	3150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893986
44	NC_013386	TGA	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893986
45	NC_013386	TCT	2	6	3325	3330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893986
46	NC_013386	GCC	2	6	3357	3362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893986
47	NC_013386	GCC	2	6	3393	3398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893986
48	NC_013386	CAG	2	6	3413	3418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893986
49	NC_013386	CCA	2	6	3545	3550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_013386	CTC	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893987
51	NC_013386	CTG	2	6	3871	3876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893987
52	NC_013386	TCC	2	6	3881	3886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893987
53	NC_013386	CAG	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893987
54	NC_013386	ACC	2	6	3970	3975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893987
55	NC_013386	CGG	2	6	3978	3983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893987
56	NC_013386	CGG	2	6	3993	3998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893987
57	NC_013386	TCC	2	6	4024	4029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893987
58	NC_013386	GGT	2	6	4083	4088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893987
59	NC_013386	TTC	2	6	4102	4107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893987
60	NC_013386	CTT	2	6	4140	4145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893987
61	NC_013386	TCC	2	6	4160	4165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893987
62	NC_013386	TCA	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893987
63	NC_013386	CTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893987
64	NC_013386	GAG	2	6	4428	4433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893987
65	NC_013386	CGG	2	6	4455	4460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893987
66	NC_013386	GTC	2	6	4488	4493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893987
67	NC_013386	GCG	2	6	4552	4557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893987
68	NC_013386	GAG	3	9	4573	4581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893987
69	NC_013386	CTC	2	6	4626	4631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893987
70	NC_013386	AGG	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893987
71	NC_013386	CTT	2	6	4910	4915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893987
72	NC_013386	CCA	2	6	4964	4969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893987
73	NC_013386	GTC	2	6	5070	5075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893987
74	NC_013386	TCC	2	6	5102	5107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893987
75	NC_013386	CGG	2	6	5147	5152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893987
76	NC_013386	TTG	2	6	5158	5163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260893987
77	NC_013386	GCC	2	6	5182	5187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893987
78	NC_013386	CAT	2	6	5276	5281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893987
79	NC_013386	CAC	4	12	5307	5318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893987
80	NC_013386	GCC	2	6	5392	5397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893987
81	NC_013386	GAT	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893987
82	NC_013386	TCA	2	6	5560	5565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893987
83	NC_013386	TGC	2	6	5688	5693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893987
84	NC_013386	GAC	2	6	5805	5810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893987
85	NC_013386	GCC	2	6	5878	5883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893987
86	NC_013386	GCC	2	6	5914	5919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893987
87	NC_013386	CAG	2	6	5934	5939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893987
88	NC_013386	TCC	2	6	5980	5985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_013386	GTT	2	6	6028	6033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013386	GGT	2	6	6090	6095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013386	TAA	2	6	6230	6235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260893988
92	NC_013386	CGC	2	6	6239	6244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893988
93	NC_013386	CCG	2	6	6332	6337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893988
94	NC_013386	ACC	2	6	6367	6372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893988
95	NC_013386	GCT	2	6	6398	6403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893988
96	NC_013386	CTG	2	6	6513	6518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893988
97	NC_013386	ACC	3	9	6622	6630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893988
98	NC_013386	GGA	2	6	6721	6726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893988
99	NC_013386	ACC	2	6	6751	6756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893988
100	NC_013386	CCG	2	6	6779	6784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893988
101	NC_013386	GCA	2	6	6851	6856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893988
102	NC_013386	CCA	2	6	6947	6952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893989
103	NC_013386	CTT	2	6	6981	6986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893989
104	NC_013386	CTC	2	6	7011	7016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893989
105	NC_013386	GCT	2	6	7055	7060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893989
106	NC_013386	GCT	2	6	7074	7079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893989
107	NC_013386	CCG	2	6	7177	7182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893989
108	NC_013386	GAA	2	6	7540	7545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893989
109	NC_013386	CCA	2	6	7562	7567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893989
110	NC_013386	CGG	2	6	7569	7574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260893989
111	NC_013386	GGA	2	6	7588	7593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893989
112	NC_013386	GAA	2	6	7608	7613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893989
113	NC_013386	CGC	2	6	7647	7652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893989
114	NC_013386	CCT	2	6	7694	7699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893989
115	NC_013386	AGA	2	6	7795	7800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893989
116	NC_013386	AGG	2	6	7814	7819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893989
117	NC_013386	GCT	2	6	8111	8116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893990
118	NC_013386	TGC	2	6	8119	8124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893990
119	NC_013386	ACC	2	6	8173	8178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260893990
120	NC_013386	GAG	2	6	8232	8237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893990
121	NC_013386	CGA	2	6	8374	8379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893991
122	NC_013386	TGC	2	6	8466	8471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893991
123	NC_013386	ACT	2	6	8502	8507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893991
124	NC_013386	AAG	2	6	8561	8566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893991
125	NC_013386	TGG	2	6	8589	8594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260893991
126	NC_013386	CCG	2	6	8643	8648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893991
127	NC_013386	CCT	2	6	8716	8721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893991
128	NC_013386	GAC	2	6	8759	8764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893991
129	NC_013386	CCT	2	6	8791	8796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260893991
130	NC_013386	GAA	2	6	8849	8854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893991
131	NC_013386	AGC	2	6	8985	8990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893992
132	NC_013386	AGA	2	6	9005	9010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893992
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262	NC_013386	GGT	2	6	16964	16969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
263	NC_013386	CCG	2	6	17020	17025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
264	NC_013386	TCG	2	6	17164	17169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893999
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268	NC_013386	GAG	2	6	17361	17366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260893999
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284	NC_013386	AAC	2	6	17909	17914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_013386	CGG	2	6	17939	17944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_013386	GCG	2	6	17964	17969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_013386	CGG	2	6	18142	18147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_013386	ATC	2	6	18351	18356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260894001
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292	NC_013386	GCG	2	6	18757	18762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260894001
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380	NC_013386	GGA	2	6	24638	24643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260894009
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386	NC_013386	CGT	2	6	25036	25041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260894009
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389	NC_013386	TCG	2	6	25225	25230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260894009
390	NC_013386	GCG	2	6	25290	25295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260894009
391	NC_013386	GAA	2	6	25422	25427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260894009
392	NC_013386	AAG	2	6	25434	25439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260894009
393	NC_013386	CGA	2	6	25512	25517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260894010
394	NC_013386	GAA	2	6	25705	25710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260894010
395	NC_013386	CAG	2	6	25779	25784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260894010
396	NC_013386	ACC	2	6	25799	25804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260894010
397	NC_013386	GCT	2	6	25878	25883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260894010
398	NC_013386	GAC	2	6	25951	25956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260894010
399	NC_013386	GTG	2	6	26133	26138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260894011
400	NC_013386	CTT	2	6	26306	26311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260894011
401	NC_013386	CCT	2	6	26331	26336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260894011
402	NC_013386	GAG	2	6	26338	26343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260894011
403	NC_013386	GCC	2	6	26411	26416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260894011
404	NC_013386	CTT	2	6	26630	26635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260894011
405	NC_013386	GAA	2	6	26687	26692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260894011
406	NC_013386	CGG	2	6	26757	26762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260894011
407	NC_013386	CCA	2	6	26825	26830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260894011
408	NC_013386	GAC	2	6	26846	26851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260894011
409	NC_013386	CGG	2	6	26889	26894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260894011
410	NC_013386	TTC	2	6	26936	26941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
411	NC_013386	CTC	2	6	26987	26992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260894012
412	NC_013386	ACC	2	6	27054	27059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260894012
413	NC_013386	GTC	2	6	27098	27103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260894012
414	NC_013386	CAC	2	6	27119	27124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260894012
415	NC_013386	TCT	2	6	27130	27135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260894012
416	NC_013386	CAC	2	6	27152	27157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260894012
417	NC_013386	TCC	2	6	27177	27182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260894012
418	NC_013386	CGG	2	6	27241	27246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260894012
419	NC_013386	CTT	2	6	27327	27332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260894012
420	NC_013386	AAG	2	6	27339	27344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260894012
421	NC_013386	GAT	2	6	27565	27570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260894013
422	NC_013386	CGG	2	6	27799	27804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.