MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 plasmid pADEG01

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013386	AAG	2	6	9	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013386	CCA	2	6	3545	3550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_013386	TCC	2	6	5980	5985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_013386	GTT	2	6	6028	6033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013386	GGT	2	6	6090	6095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013386	CCG	3	9	9121	9129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_013386	TCG	2	6	9130	9135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013386	GTC	2	6	9141	9146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013386	CGT	2	6	9149	9154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013386	TGT	2	6	9185	9190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013386	CTC	2	6	9490	9495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_013386	CGG	2	6	9517	9522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013386	GCC	2	6	9560	9565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_013386	GCC	2	6	9574	9579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_013386	GAG	2	6	9593	9598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013386	GAG	2	6	9606	9611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013386	TCC	2	6	9647	9652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_013386	CCG	2	6	12565	12570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_013386	GCC	2	6	12586	12591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_013386	GCG	2	6	12629	12634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013386	GCC	2	6	12681	12686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_013386	CGG	2	6	12756	12761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013386	GAA	2	6	12855	12860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013386	GCC	2	6	13267	13272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_013386	CAC	2	6	14183	14188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_013386	AGG	2	6	14269	14274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013386	CGC	2	6	14416	14421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_013386	AAC	2	6	14498	14503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013386	TGC	2	6	14541	14546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013386	ACC	2	6	14556	14561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_013386	TTC	2	6	14606	14611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013386	GGC	2	6	14653	14658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013386	CGC	2	6	14811	14816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_013386	GCG	2	6	14823	14828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013386	CAG	2	6	15075	15080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013386	CAG	2	6	15355	15360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013386	AAG	2	6	15378	15383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013386	TCA	3	9	15446	15454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013386	CGG	2	6	15520	15525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013386	CCA	2	6	15532	15537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_013386	CGG	2	6	16932	16937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013386	GGT	2	6	16964	16969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013386	CCG	2	6	17020	17025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_013386	AAC	2	6	17909	17914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013386	CGG	2	6	17939	17944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013386	GCG	2	6	17964	17969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013386	CGG	2	6	18142	18147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013386	CAG	2	6	20609	20614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013386	GGT	2	6	20781	20786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013386	AGA	2	6	20868	20873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013386	TTC	2	6	20913	20918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013386	CTA	3	9	20929	20937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013386	GGC	2	6	20961	20966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013386	CGT	2	6	21010	21015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013386	GGC	2	6	21016	21021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013386	CCG	2	6	21034	21039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_013386	TAG	2	6	21125	21130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013386	TCA	2	6	21337	21342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013386	CGG	2	6	22739	22744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013386	GGT	2	6	22771	22776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013386	CCG	2	6	22827	22832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_013386	CGG	2	6	23301	23306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013386	GAC	2	6	23354	23359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013386	ACC	2	6	23395	23400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_013386	ATC	2	6	23423	23428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013386	AGC	2	6	23450	23455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013386	TCC	2	6	23553	23558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_013386	GCA	2	6	24477	24482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013386	CGG	2	6	24547	24552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013386	AGA	2	6	24610	24615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013386	TTC	2	6	26936	26941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013386	CGG	2	6	27799	27804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.