MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Ammonifex degensii KC4 plasmid pADEG01

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013386	CG	3	6	1899	1904	0 %	0 %	50 %	50 %	260893986
2	NC_013386	GC	3	6	3437	3442	0 %	0 %	50 %	50 %	260893986
3	NC_013386	CT	3	6	4360	4365	0 %	50 %	0 %	50 %	260893987
4	NC_013386	CT	3	6	4525	4530	0 %	50 %	0 %	50 %	260893987
5	NC_013386	GA	3	6	4596	4601	50 %	0 %	50 %	0 %	260893987
6	NC_013386	TG	3	6	4798	4803	0 %	50 %	50 %	0 %	260893987
7	NC_013386	CG	3	6	5087	5092	0 %	0 %	50 %	50 %	260893987
8	NC_013386	AG	3	6	5452	5457	50 %	0 %	50 %	0 %	260893987
9	NC_013386	GC	3	6	5958	5963	0 %	0 %	50 %	50 %	260893987
10	NC_013386	GA	3	6	6274	6279	50 %	0 %	50 %	0 %	260893988
11	NC_013386	GC	3	6	7208	7213	0 %	0 %	50 %	50 %	260893989
12	NC_013386	GA	3	6	7592	7597	50 %	0 %	50 %	0 %	260893989
13	NC_013386	CG	3	6	8600	8605	0 %	0 %	50 %	50 %	260893991
14	NC_013386	GC	3	6	9545	9550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013386	TC	3	6	9818	9823	0 %	50 %	0 %	50 %	260893993
16	NC_013386	CT	3	6	11542	11547	0 %	50 %	0 %	50 %	260893994
17	NC_013386	TC	3	6	11981	11986	0 %	50 %	0 %	50 %	260893994
18	NC_013386	CT	3	6	12439	12444	0 %	50 %	0 %	50 %	260893994
19	NC_013386	GC	3	6	13560	13565	0 %	0 %	50 %	50 %	260893996
20	NC_013386	CA	3	6	14890	14895	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013386	AT	3	6	15018	15023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013386	CT	3	6	15263	15268	0 %	50 %	0 %	50 %	260893997
23	NC_013386	GC	3	6	16205	16210	0 %	0 %	50 %	50 %	260893998
24	NC_013386	GA	3	6	16841	16846	50 %	0 %	50 %	0 %	260893998
25	NC_013386	TC	3	6	17533	17538	0 %	50 %	0 %	50 %	260894000
26	NC_013386	GC	3	6	17653	17658	0 %	0 %	50 %	50 %	260894000
27	NC_013386	CA	3	6	17970	17975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013386	CG	3	6	18165	18170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013386	GA	3	6	18615	18620	50 %	0 %	50 %	0 %	260894001
30	NC_013386	GC	3	6	19319	19324	0 %	0 %	50 %	50 %	260894002
31	NC_013386	CG	3	6	19373	19378	0 %	0 %	50 %	50 %	260894002
32	NC_013386	GC	3	6	19798	19803	0 %	0 %	50 %	50 %	260894003
33	NC_013386	AC	3	6	20810	20815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013386	CT	3	6	20993	20998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013386	CT	3	6	21071	21076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013386	CT	3	6	21485	21490	0 %	50 %	0 %	50 %	260894005
37	NC_013386	CT	4	8	21818	21825	0 %	50 %	0 %	50 %	260894005
38	NC_013386	GA	3	6	22546	22551	50 %	0 %	50 %	0 %	260894005
39	NC_013386	GA	3	6	22648	22653	50 %	0 %	50 %	0 %	260894005
40	NC_013386	CT	3	6	22897	22902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013386	CG	4	8	23438	23445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013386	CG	3	6	23593	23598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013386	TC	3	6	23905	23910	0 %	50 %	0 %	50 %	260894007
44	NC_013386	CT	3	6	23953	23958	0 %	50 %	0 %	50 %	260894007
45	NC_013386	TG	3	6	24180	24185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013386	GA	3	6	25304	25309	50 %	0 %	50 %	0 %	260894009
47	NC_013386	GA	3	6	25316	25321	50 %	0 %	50 %	0 %	260894009
48	NC_013386	TC	4	8	25938	25945	0 %	50 %	0 %	50 %	260894010
49	NC_013386	CT	3	6	26949	26954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.