MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 1058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013385	TGGAGC	2	12	901963	901974	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260892778
502	NC_013385	GGCCAG	2	12	903945	903956	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260892782
503	NC_013385	AACGCC	2	12	904861	904872	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	260892783
504	NC_013385	ACCTGC	2	12	904982	904993	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260892783
505	NC_013385	CCTGAC	2	12	906399	906410	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260892783
506	NC_013385	CGATTA	2	12	910197	910208	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	260892787
507	NC_013385	CCGGCG	2	12	911708	911719	0 %	0 %	50 %	50 %	260892787
508	NC_013385	TCTTTA	2	12	912922	912933	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	260892789
509	NC_013385	GAAAAA	2	12	931788	931799	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	260892802
510	NC_013385	GAAGAT	2	12	933923	933934	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	260892803
511	NC_013385	GGTGGA	2	12	942020	942031	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	260892810
512	NC_013385	TGGCGG	2	12	942127	942138	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260892810
513	NC_013385	CTGGCG	2	12	943275	943286	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260892812
514	NC_013385	GGGGGA	2	12	945671	945682	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	260892814
515	NC_013385	ACCTGG	2	12	945712	945723	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260892815
516	NC_013385	GTGGCG	2	12	949928	949939	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260892820
517	NC_013385	CGGTGG	2	12	950970	950981	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260892820
518	NC_013385	GGGGAC	2	12	951224	951235	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	260892821
519	NC_013385	CAGGAC	2	12	957670	957681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892830
520	NC_013385	GGAGCG	2	12	959101	959112	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	260892831
521	NC_013385	CAGGAA	2	12	960338	960349	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	260892835
522	NC_013385	CGCCAG	2	12	961191	961202	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260892835
523	NC_013385	GAGGTT	2	12	961497	961508	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	260892835
524	NC_013385	CCTTCT	2	12	962996	963007	0 %	50 %	0 %	50 %	260892838
525	NC_013385	CACGGC	2	12	963934	963945	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260892839
526	NC_013385	TCCTGC	2	12	965210	965221	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260892840
527	NC_013385	CTGGCG	2	12	966911	966922	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260892842
528	NC_013385	GTTCCT	2	12	967763	967774	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	260892842
529	NC_013385	GGAGGG	2	12	972727	972738	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	260892848
530	NC_013385	TGCTGG	2	12	974600	974611	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	260892850
531	NC_013385	CTCCTT	2	12	977772	977783	0 %	50 %	0 %	50 %	260892853
532	NC_013385	CCTGCT	2	12	980948	980959	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260892856
533	NC_013385	TACGGC	2	12	981662	981673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260892857
534	NC_013385	CCTTTA	2	12	986250	986261	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	260892860
535	NC_013385	CTTTAC	2	12	986946	986957	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	260892861
536	NC_013385	CCTCAT	2	12	990076	990087	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	260892863
537	NC_013385	CAAAGC	2	12	991315	991326	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	260892864
538	NC_013385	ACTCGG	2	12	1000995	1001006	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260892870
539	NC_013385	AGGTGC	2	12	1002488	1002499	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260892872
540	NC_013385	GGAGAG	2	12	1002892	1002903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892873
541	NC_013385	CGGGTG	2	12	1003013	1003024	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260892873
542	NC_013385	TGGGAA	2	12	1004840	1004851	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	260892875
543	NC_013385	AGGCGG	2	12	1004888	1004899	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	260892875
544	NC_013385	TAAAAG	2	12	1007017	1007028	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	260892879
545	NC_013385	GTCCAG	2	12	1008621	1008632	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260892880
546	NC_013385	GCGGGC	2	12	1010475	1010486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892881
547	NC_013385	AGGAAA	2	12	1020176	1020187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892890
548	NC_013385	GTGGCA	2	12	1023164	1023175	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260892892
549	NC_013385	CGGCGA	2	12	1023427	1023438	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260892892
550	NC_013385	GCCTCT	2	12	1023768	1023779	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260892892
551	NC_013385	GGAAAG	2	12	1027076	1027087	50 %	0 %	50 %	0 %	260892896
552	NC_013385	GCTGGT	2	12	1027304	1027315	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	260892897
553	NC_013385	AGTGGT	2	12	1028515	1028526	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	260892898
554	NC_013385	ACATAG	2	12	1029350	1029361	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	260892899
555	NC_013385	GAGGGA	2	12	1031491	1031502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892901
556	NC_013385	GTTAAA	2	12	1031952	1031963	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	260892903
557	NC_013385	AGGTGG	2	12	1036027	1036038	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	260892906
558	NC_013385	GGCCTG	2	12	1036844	1036855	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260892908
559	NC_013385	GGTTGC	2	12	1038463	1038474	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	260892910
560	NC_013385	TTGGCC	2	12	1038693	1038704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892910
561	NC_013385	AGAAGG	2	12	1042183	1042194	50 %	0 %	50 %	0 %	260892911
562	NC_013385	TACCGT	2	12	1047189	1047200	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260892914
563	NC_013385	GGCAAG	2	12	1047777	1047788	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260892915
564	NC_013385	GGTTTT	2	12	1049543	1049554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260892916
565	NC_013385	TAGTGG	2	12	1055868	1055879	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	260892926
566	NC_013385	TCGATT	2	12	1056315	1056326	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	260892926
567	NC_013385	GCGAAG	2	12	1062466	1062477	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260892933
568	NC_013385	CGTTTT	2	12	1065371	1065382	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	260892935
569	NC_013385	AAAAGA	2	12	1067378	1067389	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	260892937
570	NC_013385	GATGTA	2	12	1071219	1071230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260892942
571	NC_013385	TACAGC	2	12	1072481	1072492	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260892943
572	NC_013385	TCGGAC	2	12	1076299	1076310	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260892945
573	NC_013385	CTATGC	2	12	1077462	1077473	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260892946
574	NC_013385	GAATAG	2	12	1084513	1084524	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	260892953
575	NC_013385	TTCCGC	2	12	1086004	1086015	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260892954
576	NC_013385	CCTTGG	2	12	1088143	1088154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892956
577	NC_013385	TGGCCT	2	12	1088188	1088199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892956
578	NC_013385	TCTTCC	2	12	1088397	1088408	0 %	50 %	0 %	50 %	260892956
579	NC_013385	GAAGGC	2	12	1088874	1088885	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260892957
580	NC_013385	TTTACC	2	12	1089841	1089852	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	260892957
581	NC_013385	TCTTCC	2	12	1090894	1090905	0 %	50 %	0 %	50 %	260892958
582	NC_013385	TTGGCC	2	12	1091698	1091709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892958
583	NC_013385	ATGGCT	2	12	1096938	1096949	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260892962
584	NC_013385	CTCTTT	2	12	1099296	1099307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892964
585	NC_013385	GCCCAG	2	12	1099317	1099328	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260892964
586	NC_013385	GCGGTG	2	12	1101687	1101698	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260892966
587	NC_013385	TCTGCC	2	12	1103923	1103934	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260892970
588	NC_013385	CCAGCC	2	12	1104042	1104053	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260892970
589	NC_013385	GGCCCT	2	12	1105569	1105580	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260892971
590	NC_013385	CGGGGA	2	12	1107731	1107742	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	260892973
591	NC_013385	TCCCGA	2	12	1114729	1114740	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260892979
592	NC_013385	CTGGCT	2	12	1123332	1123343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892987
593	NC_013385	GAGCAT	2	12	1124846	1124857	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260892989
594	NC_013385	CAGGAA	2	12	1125858	1125869	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	260892990
595	NC_013385	CGCCAG	2	12	1126711	1126722	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260892990
596	NC_013385	GTCGGC	2	12	1129797	1129808	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260892992
597	NC_013385	CGAAGC	2	12	1131300	1131311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892993
598	NC_013385	ACTACC	2	12	1133771	1133782	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	260892996
599	NC_013385	CCGGTG	2	12	1140001	1140012	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260892999
600	NC_013385	TATACA	2	12	1144656	1144667	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	260893002
601	NC_013385	GCCGGT	2	12	1150073	1150084	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260893007
602	NC_013385	CGGAGC	2	12	1150748	1150759	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893007
603	NC_013385	GAAAGA	2	12	1154044	1154055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260893009
604	NC_013385	GGCCCA	2	12	1154621	1154632	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260893010
605	NC_013385	TCAATC	2	12	1155981	1155992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260893010
606	NC_013385	TGCCGA	2	12	1156750	1156761	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260893012
607	NC_013385	GAGGTA	2	12	1156790	1156801	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	260893012
608	NC_013385	AGGTCA	2	12	1157004	1157015	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260893012
609	NC_013385	GTGATG	2	12	1161056	1161067	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	260893015
610	NC_013385	CAACTA	2	12	1163805	1163816	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	260893017
611	NC_013385	TCCTGC	2	12	1165360	1165371	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260893019
612	NC_013385	GCCATG	2	12	1165571	1165582	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260893020
613	NC_013385	CCTTCT	2	12	1166549	1166560	0 %	50 %	0 %	50 %	260893020
614	NC_013385	GGGGTG	2	12	1167413	1167424	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	260893021
615	NC_013385	CAAAGG	2	12	1167510	1167521	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	260893021
616	NC_013385	GCGCCT	2	12	1167726	1167737	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260893021
617	NC_013385	AAAGCC	2	12	1168199	1168210	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	260893022
618	NC_013385	TACCAC	2	12	1175870	1175881	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	260893029
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620	NC_013385	GCCTCT	2	12	1179976	1179987	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260893033
621	NC_013385	TTCGCC	2	12	1180074	1180085	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260893033
622	NC_013385	CCTTTT	2	12	1185638	1185649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893038
623	NC_013385	TTTCCC	2	12	1185992	1186003	0 %	50 %	0 %	50 %	260893039
624	NC_013385	GGCGCA	2	12	1186247	1186258	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260893039
625	NC_013385	CCAGCT	2	12	1186349	1186360	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260893039
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631	NC_013385	TCCGCA	2	12	1197086	1197097	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260893045
632	NC_013385	CCTTCT	2	12	1202504	1202515	0 %	50 %	0 %	50 %	260893052
633	NC_013385	TGGACT	2	12	1203797	1203808	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260893054
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643	NC_013385	ATTTTT	2	12	1214196	1214207	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	260893061
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649	NC_013385	CACGGT	2	12	1237506	1237517	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260893089
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703	NC_013385	GTCGAG	2	12	1363002	1363013	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260893212
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715	NC_013385	ACCGCC	2	12	1376649	1376660	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260893228
716	NC_013385	ACCGGA	2	12	1377077	1377088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260893228
717	NC_013385	GCAGTA	2	12	1378498	1378509	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260893229
718	NC_013385	TCCGCC	2	12	1378928	1378939	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	260893230
719	NC_013385	TCCACC	2	12	1378940	1378951	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	260893230
720	NC_013385	GGCTGT	2	12	1381436	1381447	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	260893232
721	NC_013385	CCTTGG	2	12	1384226	1384237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260893235
722	NC_013385	CACCCG	2	12	1385723	1385734	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260893237
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724	NC_013385	GTCCCC	2	12	1387366	1387377	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	260893239
725	NC_013385	CCCGCG	2	12	1392788	1392799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260893246
726	NC_013385	GTCCAG	2	12	1402643	1402654	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260893255
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743	NC_013385	CCACGA	2	12	1441318	1441329	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	260893289
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833	NC_013385	TTTCCT	2	12	1638110	1638121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260893494
834	NC_013385	GAAGTT	2	12	1638403	1638414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260893495
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836	NC_013385	GGTCCA	2	12	1639398	1639409	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260893496
837	NC_013385	GGAAAG	2	12	1642162	1642173	50 %	0 %	50 %	0 %	260893500
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933	NC_013385	GCGCAC	2	12	1889814	1889825	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260893721
934	NC_013385	ACCTTG	2	12	1889941	1889952	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260893721
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937	NC_013385	TCCTGT	2	12	1912425	1912436	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	260893740
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939	NC_013385	GGGAGG	2	12	1915969	1915980	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	260893743
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941	NC_013385	CTCGAC	2	12	1925877	1925888	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260893751
942	NC_013385	GTAACC	2	12	1927930	1927941	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260893753
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944	NC_013385	GGCCTC	2	12	1934548	1934559	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260893759
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946	NC_013385	CCTTCT	2	12	1938668	1938679	0 %	50 %	0 %	50 %	260893766
947	NC_013385	ACCGCT	2	12	1941956	1941967	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260893770
948	NC_013385	TCCTCG	2	12	1945005	1945016	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260893773
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976	NC_013385	CTCGAT	2	12	1986467	1986478	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260893813
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