MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 3684

< Previous12345678Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013385	CAC	2	6	1957204	1957209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_013385	CCG	2	6	1957275	1957280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_013385	AGG	2	6	1957356	1957361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_013385	TCC	2	6	1959852	1959857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_013385	AGC	3	9	1960173	1960181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_013385	TCT	2	6	1960235	1960240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_013385	CTC	2	6	1962997	1963002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_013385	TCC	2	6	1964280	1964285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_013385	AAG	2	6	1964420	1964425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_013385	GAA	2	6	1964559	1964564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_013385	AGG	2	6	1964589	1964594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_013385	TCT	2	6	1967593	1967598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_013385	CCT	2	6	1976115	1976120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_013385	TCC	2	6	1977226	1977231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_013385	AGG	2	6	1979038	1979043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_013385	TTA	2	6	1987692	1987697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_013385	TCC	2	6	1989618	1989623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_013385	AGC	2	6	1991028	1991033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_013385	CCT	2	6	1991769	1991774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_013385	CAC	2	6	1991828	1991833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_013385	CCG	2	6	1991897	1991902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3522	NC_013385	ATG	2	6	1991923	1991928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_013385	AAG	2	6	1991932	1991937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_013385	GCC	2	6	1992010	1992015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3525	NC_013385	AGT	2	6	1992080	1992085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_013385	GCA	2	6	1992236	1992241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_013385	GCG	3	9	1992273	1992281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_013385	AGG	2	6	1992310	1992315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_013385	TCC	2	6	1993789	1993794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_013385	GCA	2	6	1993854	1993859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_013385	GCC	2	6	1993877	1993882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_013385	CAG	2	6	1995076	1995081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_013385	ATT	2	6	1995158	1995163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_013385	AAG	2	6	1995408	1995413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_013385	CCA	2	6	1995998	1996003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_013385	GCC	2	6	1996014	1996019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_013385	GAG	2	6	1996102	1996107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_013385	AGG	2	6	1996171	1996176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_013385	TAA	2	6	1997688	1997693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_013385	AGC	2	6	1997727	1997732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_013385	GCC	2	6	1997795	1997800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_013385	CGG	2	6	1997810	1997815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_013385	GAG	2	6	1997862	1997867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_013385	AGG	2	6	1998849	1998854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_013385	ATG	2	6	1999205	1999210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_013385	AGG	2	6	1999216	1999221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_013385	CTC	2	6	2000022	2000027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_013385	GCG	2	6	2000072	2000077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_013385	GGC	2	6	2000150	2000155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_013385	CTC	2	6	2001299	2001304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3551	NC_013385	ACG	2	6	2001369	2001374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_013385	AGC	2	6	2001383	2001388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_013385	CTC	2	6	2001496	2001501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3554	NC_013385	CGC	2	6	2001506	2001511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_013385	GGC	2	6	2001580	2001585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_013385	TCA	2	6	2001668	2001673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_013385	TCA	2	6	2001681	2001686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_013385	TGA	2	6	2001853	2001858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_013385	GCT	2	6	2001903	2001908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_013385	CCT	2	6	2001937	2001942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_013385	CGT	2	6	2001998	2002003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_013385	GGC	2	6	2002004	2002009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_013385	CTC	3	9	2004384	2004392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_013385	ACA	2	6	2004443	2004448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_013385	AGG	2	6	2004458	2004463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_013385	AGG	2	6	2005414	2005419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_013385	GGA	2	6	2005614	2005619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_013385	GAA	3	9	2007261	2007269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_013385	CTC	2	6	2013454	2013459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_013385	TTC	2	6	2016408	2016413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_013385	GTG	2	6	2016600	2016605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_013385	CTC	2	6	2021474	2021479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_013385	CCT	2	6	2025986	2025991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_013385	CCT	2	6	2035105	2035110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_013385	CCT	2	6	2041956	2041961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3576	NC_013385	CTC	2	6	2042370	2042375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3577	NC_013385	CTT	2	6	2042442	2042447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_013385	TGG	2	6	2042475	2042480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_013385	CTC	2	6	2042541	2042546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3580	NC_013385	GTT	2	6	2042598	2042603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_013385	GAA	2	6	2042618	2042623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_013385	AGG	2	6	2042656	2042661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_013385	TCC	3	9	2042681	2042689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3584	NC_013385	GCA	2	6	2042771	2042776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_013385	TAA	2	6	2044903	2044908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_013385	TGG	2	6	2047220	2047225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_013385	AGG	2	6	2047432	2047437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_013385	GAT	2	6	2047467	2047472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_013385	GGA	2	6	2047510	2047515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_013385	GTT	2	6	2049796	2049801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_013385	TAC	2	6	2052534	2052539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_013385	ACT	2	6	2052571	2052576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_013385	AAG	2	6	2052671	2052676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_013385	CGG	2	6	2052767	2052772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_013385	CCT	2	6	2053277	2053282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3596	NC_013385	CCT	2	6	2055223	2055228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_013385	TCC	2	6	2059171	2059176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_013385	AAT	2	6	2059203	2059208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_013385	AGG	2	6	2060190	2060195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_013385	TCC	2	6	2063056	2063061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_013385	ACC	2	6	2064580	2064585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3602	NC_013385	CCT	2	6	2065164	2065169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_013385	CCA	2	6	2065185	2065190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_013385	TTC	2	6	2065205	2065210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_013385	AGT	2	6	2065227	2065232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_013385	GCG	2	6	2065240	2065245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_013385	AAC	2	6	2068693	2068698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_013385	CCT	2	6	2069310	2069315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_013385	CTT	2	6	2072323	2072328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_013385	ACT	2	6	2072337	2072342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_013385	CAG	3	9	2072395	2072403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_013385	TCC	2	6	2075634	2075639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_013385	AAG	2	6	2075678	2075683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_013385	GAC	2	6	2075763	2075768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_013385	GAG	2	6	2078135	2078140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_013385	AGG	2	6	2078204	2078209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_013385	CCT	2	6	2078861	2078866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3618	NC_013385	CAC	2	6	2079650	2079655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_013385	GCT	2	6	2079688	2079693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_013385	CGG	2	6	2079737	2079742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_013385	TCC	2	6	2079760	2079765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_013385	CCT	2	6	2079872	2079877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_013385	CCA	2	6	2079935	2079940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_013385	CTC	2	6	2080079	2080084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_013385	CCT	2	6	2080284	2080289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3626	NC_013385	TCT	2	6	2080321	2080326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_013385	GCT	2	6	2080343	2080348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_013385	AAG	2	6	2080369	2080374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_013385	TAC	2	6	2080491	2080496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_013385	GGT	2	6	2080598	2080603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_013385	GCC	2	6	2082004	2082009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3632	NC_013385	GCG	2	6	2082047	2082052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_013385	GCC	2	6	2082099	2082104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3634	NC_013385	TAG	2	6	2082358	2082363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_013385	AGG	2	6	2082415	2082420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3636	NC_013385	AGA	2	6	2082700	2082705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3637	NC_013385	TCC	2	6	2085125	2085130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3638	NC_013385	CAG	2	6	2088047	2088052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3639	NC_013385	ACC	2	6	2088070	2088075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3640	NC_013385	CGC	2	6	2088099	2088104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3641	NC_013385	CCT	2	6	2088123	2088128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3642	NC_013385	AAT	2	6	2088231	2088236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3643	NC_013385	GTT	2	6	2088252	2088257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3644	NC_013385	CCT	2	6	2091535	2091540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3645	NC_013385	CCT	2	6	2092314	2092319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3646	NC_013385	GCA	2	6	2092344	2092349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3647	NC_013385	AGG	2	6	2092372	2092377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3648	NC_013385	AGG	2	6	2092700	2092705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3649	NC_013385	TTC	2	6	2092763	2092768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3650	NC_013385	AGG	2	6	2093868	2093873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3651	NC_013385	TCA	2	6	2094092	2094097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3652	NC_013385	TCC	2	6	2095911	2095916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3653	NC_013385	ACC	2	6	2095933	2095938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3654	NC_013385	GCG	2	6	2095962	2095967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3655	NC_013385	AGG	2	6	2096990	2096995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3656	NC_013385	CTC	2	6	2098276	2098281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3657	NC_013385	CTC	2	6	2100261	2100266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3658	NC_013385	ACC	2	6	2100267	2100272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3659	NC_013385	CCG	2	6	2103319	2103324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3660	NC_013385	GAC	3	9	2103393	2103401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3661	NC_013385	GCT	2	6	2112029	2112034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3662	NC_013385	GGA	2	6	2114430	2114435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3663	NC_013385	TGC	2	6	2114446	2114451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3664	NC_013385	CTT	2	6	2114503	2114508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3665	NC_013385	CAT	2	6	2114744	2114749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3666	NC_013385	CTG	2	6	2115302	2115307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3667	NC_013385	AGG	2	6	2115383	2115388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3668	NC_013385	TCC	2	6	2115400	2115405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3669	NC_013385	CCT	2	6	2115721	2115726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3670	NC_013385	CTA	2	6	2115759	2115764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3671	NC_013385	CGC	2	6	2115779	2115784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3672	NC_013385	CAC	2	6	2119866	2119871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3673	NC_013385	TCC	2	6	2120378	2120383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3674	NC_013385	CCT	2	6	2120658	2120663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3675	NC_013385	GTT	2	6	2121448	2121453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3676	NC_013385	CGC	2	6	2122322	2122327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3677	NC_013385	AGG	2	6	2122396	2122401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3678	NC_013385	CTA	2	6	2123099	2123104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3679	NC_013385	ACC	2	6	2123191	2123196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3680	NC_013385	CCG	2	6	2123213	2123218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3681	NC_013385	GCC	2	6	2124387	2124392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3682	NC_013385	CAT	2	6	2126385	2126390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3683	NC_013385	TCC	2	6	2127139	2127144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3684	NC_013385	TCC	2	6	2128511	2128516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

< Previous12345678Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.