MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 455

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013385	AG	3	6	16942	16947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013385	GA	3	6	17748	17753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013385	TC	3	6	17766	17771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013385	CG	3	6	17796	17801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013385	AG	3	6	17879	17884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013385	GA	3	6	17885	17890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013385	AG	3	6	18199	18204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013385	TG	3	6	23927	23932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013385	AG	3	6	36148	36153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013385	AG	3	6	36845	36850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013385	GA	3	6	40487	40492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013385	AG	3	6	40540	40545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013385	AG	3	6	54471	54476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013385	TA	3	6	66773	66778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013385	AC	3	6	66800	66805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013385	AG	3	6	75654	75659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013385	AT	3	6	92887	92892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013385	TC	3	6	96423	96428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013385	TC	3	6	96446	96451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013385	TC	3	6	96903	96908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013385	GA	3	6	97066	97071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013385	TA	3	6	99837	99842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013385	CT	3	6	100316	100321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013385	GT	3	6	100381	100386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013385	GA	3	6	103067	103072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013385	TC	3	6	115702	115707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013385	CG	3	6	115717	115722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013385	GC	3	6	119335	119340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013385	TC	4	8	120324	120331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013385	GA	3	6	133590	133595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013385	AG	3	6	185666	185671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013385	AG	3	6	186391	186396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013385	GA	3	6	186776	186781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013385	GA	3	6	195964	195969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013385	AG	3	6	205442	205447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013385	CG	3	6	205618	205623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013385	GC	3	6	205636	205641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013385	AG	3	6	216818	216823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013385	GA	3	6	217141	217146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013385	AG	3	6	217295	217300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013385	AG	3	6	218127	218132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013385	TG	3	6	218363	218368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013385	AT	3	6	234018	234023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013385	AG	3	6	234094	234099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013385	GA	3	6	235060	235065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013385	GC	3	6	264472	264477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013385	GA	3	6	265000	265005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013385	CG	3	6	266782	266787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013385	CT	3	6	269780	269785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013385	AG	3	6	270624	270629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013385	TC	3	6	270790	270795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013385	TC	3	6	271105	271110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013385	TC	3	6	271745	271750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013385	CG	3	6	272064	272069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013385	GA	3	6	272273	272278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013385	AG	3	6	282711	282716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013385	GA	3	6	283034	283039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013385	AG	3	6	283188	283193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013385	CA	3	6	290355	290360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013385	GT	3	6	290403	290408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013385	GA	3	6	318960	318965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013385	TC	3	6	326562	326567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013385	AG	3	6	327431	327436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013385	TC	3	6	348516	348521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013385	GA	3	6	348753	348758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013385	CT	3	6	355515	355520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013385	TC	3	6	362372	362377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013385	TC	3	6	367247	367252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013385	CA	4	8	368005	368012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013385	CT	3	6	371406	371411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013385	CG	3	6	371570	371575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013385	GC	3	6	371660	371665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013385	TC	3	6	372746	372751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013385	TC	3	6	391832	391837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013385	CG	3	6	416325	416330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013385	AG	4	8	420894	420901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013385	CT	3	6	424923	424928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013385	TC	3	6	425311	425316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013385	CT	3	6	425317	425322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013385	CG	3	6	425400	425405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013385	GA	3	6	425430	425435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013385	TC	3	6	425448	425453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013385	TC	3	6	430622	430627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013385	TC	3	6	430751	430756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013385	AG	3	6	434993	434998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013385	GC	3	6	447258	447263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013385	TC	3	6	448284	448289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013385	TA	3	6	448347	448352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013385	TC	3	6	458439	458444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_013385	GA	3	6	461894	461899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013385	CT	3	6	470365	470370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013385	AG	3	6	486544	486549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013385	TA	3	6	495104	495109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013385	AG	3	6	497015	497020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013385	AG	3	6	500056	500061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013385	CT	3	6	503081	503086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013385	TC	3	6	503091	503096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013385	GA	3	6	503478	503483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013385	CG	3	6	503871	503876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013385	GA	3	6	505309	505314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013385	CA	3	6	519087	519092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013385	AG	3	6	523519	523524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013385	AG	3	6	523530	523535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013385	AG	3	6	525376	525381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013385	AG	4	8	525505	525512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013385	TC	3	6	529827	529832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013385	GA	3	6	534912	534917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013385	AG	3	6	537225	537230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013385	TC	3	6	542286	542291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013385	GA	3	6	620101	620106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013385	AT	3	6	624858	624863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013385	GA	3	6	637150	637155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013385	CG	3	6	638025	638030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013385	AC	3	6	640421	640426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_013385	CT	3	6	645829	645834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013385	CG	3	6	661908	661913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013385	TC	3	6	663534	663539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013385	TC	3	6	663744	663749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013385	AC	3	6	675329	675334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013385	AC	3	6	675498	675503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013385	GA	3	6	675716	675721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013385	GC	3	6	677509	677514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013385	GA	3	6	677700	677705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013385	GC	3	6	677714	677719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013385	AG	3	6	677824	677829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013385	CG	3	6	678391	678396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013385	AC	3	6	679057	679062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013385	AT	3	6	690775	690780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013385	GT	3	6	694679	694684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013385	TC	3	6	694896	694901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013385	GC	3	6	695299	695304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013385	CT	3	6	695936	695941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013385	TC	3	6	695944	695949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013385	CG	3	6	701871	701876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013385	TC	3	6	709626	709631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013385	GC	4	8	719294	719301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_013385	GC	3	6	719343	719348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013385	CG	3	6	724089	724094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013385	CT	3	6	724102	724107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013385	AT	3	6	724150	724155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013385	CG	3	6	724870	724875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013385	CG	3	6	725781	725786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_013385	CT	3	6	725794	725799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013385	AG	3	6	726510	726515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013385	GA	3	6	728769	728774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013385	CG	4	8	735371	735378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_013385	AC	3	6	736532	736537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_013385	CG	3	6	746921	746926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_013385	CT	3	6	746933	746938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013385	CG	3	6	748120	748125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_013385	GA	3	6	750025	750030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013385	CG	3	6	750564	750569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_013385	GC	3	6	757321	757326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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452	NC_013385	GA	3	6	2115530	2115535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
453	NC_013385	TC	3	6	2115615	2115620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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455	NC_013385	TC	3	6	2122337	2122342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.