MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_2

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013370	CTTGAG	2	12	240	251	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260871127
2	NC_013370	AATGAA	2	12	526	537	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	260871128
3	NC_013370	GAACGC	2	12	7991	8002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260871137
4	NC_013370	GCCCGC	2	12	9266	9277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260871137
5	NC_013370	ACGGTC	2	12	14507	14518	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260871139
6	NC_013370	TATTGA	2	12	24164	24175	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	260871149
7	NC_013370	TTTAAC	2	12	24637	24648	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	260871150
8	NC_013370	GGCTAA	2	12	25178	25189	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260871151
9	NC_013370	TCCGGA	2	12	27114	27125	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260871156
10	NC_013370	TTCTGC	2	12	27133	27144	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	260871156
11	NC_013370	GCGCTG	2	12	27874	27885	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260871157
12	NC_013370	TCGCTG	2	12	29647	29658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260871157
13	NC_013370	CCCCCT	2	12	43443	43454	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	260871172
14	NC_013370	CTTCAG	2	12	53850	53861	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260871184
15	NC_013370	TATCCA	2	12	54197	54208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260871184
16	NC_013370	GTCGGC	2	12	55395	55406	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260871186
17	NC_013370	AGAACA	2	12	55735	55746	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	260871187
18	NC_013370	GGTTGT	2	12	56430	56441	0 %	50 %	50 %	0 %	260871188
19	NC_013370	GCAGAA	2	12	76110	76121	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	260871212
20	NC_013370	TAGCCA	2	12	86853	86864	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260871231
21	NC_013370	GATGGC	2	12	92888	92899	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260871239

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.