MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_2

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013370	CAAT	2	8	187	194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013370	ACGC	2	8	335	342	25 %	0 %	25 %	50 %	260871127
3	NC_013370	GATA	2	8	636	643	50 %	25 %	25 %	0 %	260871128
4	NC_013370	GTTC	2	8	1272	1279	0 %	50 %	25 %	25 %	260871129
5	NC_013370	GATT	2	8	1648	1655	25 %	50 %	25 %	0 %	260871129
6	NC_013370	CTGT	2	8	1961	1968	0 %	50 %	25 %	25 %	260871130
7	NC_013370	CAAT	2	8	2289	2296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013370	CAGC	2	8	2855	2862	25 %	0 %	25 %	50 %	260871131
9	NC_013370	GAGC	2	8	3696	3703	25 %	0 %	50 %	25 %	260871132
10	NC_013370	TCAG	2	8	4258	4265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013370	GGAT	2	8	4286	4293	25 %	25 %	50 %	0 %	260871134
12	NC_013370	CAGC	2	8	5901	5908	25 %	0 %	25 %	50 %	260871137
13	NC_013370	TCAG	2	8	6838	6845	25 %	25 %	25 %	25 %	260871137
14	NC_013370	ACTC	2	8	7340	7347	25 %	25 %	0 %	50 %	260871137
15	NC_013370	TTTA	2	8	7386	7393	25 %	75 %	0 %	0 %	260871137
16	NC_013370	TTCT	2	8	7758	7765	0 %	75 %	0 %	25 %	260871137
17	NC_013370	CTGG	2	8	8053	8060	0 %	25 %	50 %	25 %	260871137
18	NC_013370	GCCC	2	8	8189	8196	0 %	0 %	25 %	75 %	260871137
19	NC_013370	TATC	2	8	8618	8625	25 %	50 %	0 %	25 %	260871137
20	NC_013370	ATCG	2	8	9222	9229	25 %	25 %	25 %	25 %	260871137
21	NC_013370	CCAT	2	8	9811	9818	25 %	25 %	0 %	50 %	260871137
22	NC_013370	TGGC	2	8	10068	10075	0 %	25 %	50 %	25 %	260871137
23	NC_013370	ACTG	2	8	10465	10472	25 %	25 %	25 %	25 %	260871137
24	NC_013370	CTGG	2	8	10786	10793	0 %	25 %	50 %	25 %	260871137
25	NC_013370	CTGC	2	8	11057	11064	0 %	25 %	25 %	50 %	260871137
26	NC_013370	GGCT	2	8	11197	11204	0 %	25 %	50 %	25 %	260871137
27	NC_013370	TGAT	2	8	11240	11247	25 %	50 %	25 %	0 %	260871137
28	NC_013370	TTCC	2	8	11376	11383	0 %	50 %	0 %	50 %	260871137
29	NC_013370	CGGT	2	8	11471	11478	0 %	25 %	50 %	25 %	260871137
30	NC_013370	GAAT	2	8	12045	12052	50 %	25 %	25 %	0 %	260871137
31	NC_013370	CCAG	2	8	12337	12344	25 %	0 %	25 %	50 %	260871137
32	NC_013370	ATAG	2	8	12550	12557	50 %	25 %	25 %	0 %	260871137
33	NC_013370	GCTG	2	8	12737	12744	0 %	25 %	50 %	25 %	260871138
34	NC_013370	TGGC	2	8	12835	12842	0 %	25 %	50 %	25 %	260871138
35	NC_013370	ACGC	2	8	12975	12982	25 %	0 %	25 %	50 %	260871138
36	NC_013370	CGCT	2	8	13515	13522	0 %	25 %	25 %	50 %	260871138
37	NC_013370	TTCA	2	8	13950	13957	25 %	50 %	0 %	25 %	260871138
38	NC_013370	GAAC	2	8	14228	14235	50 %	0 %	25 %	25 %	260871138
39	NC_013370	GTAT	2	8	14424	14431	25 %	50 %	25 %	0 %	260871139
40	NC_013370	GGCG	2	8	14740	14747	0 %	0 %	75 %	25 %	260871139
41	NC_013370	TCAA	2	8	15343	15350	50 %	25 %	0 %	25 %	260871139
42	NC_013370	TTTC	2	8	15470	15477	0 %	75 %	0 %	25 %	260871140
43	NC_013370	TGGA	2	8	15800	15807	25 %	25 %	50 %	0 %	260871142
44	NC_013370	TGGT	2	8	16118	16125	0 %	50 %	50 %	0 %	260871142
45	NC_013370	GACT	2	8	16273	16280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013370	GAAT	2	8	16492	16499	50 %	25 %	25 %	0 %	260871143
47	NC_013370	GAGT	2	8	16585	16592	25 %	25 %	50 %	0 %	260871143
48	NC_013370	AACC	2	8	16769	16776	50 %	0 %	0 %	50 %	260871143
49	NC_013370	AACC	2	8	17020	17027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013370	TTCC	2	8	17616	17623	0 %	50 %	0 %	50 %	260871144
51	NC_013370	TTTA	2	8	17882	17889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013370	CAAA	3	12	18327	18338	75 %	0 %	0 %	25 %	260871145
53	NC_013370	GATG	2	8	18553	18560	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013370	CAAT	2	8	18570	18577	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013370	CCAG	2	8	18690	18697	25 %	0 %	25 %	50 %	260871146
56	NC_013370	TTAC	2	8	19082	19089	25 %	50 %	0 %	25 %	260871147
57	NC_013370	CTTC	2	8	20106	20113	0 %	50 %	0 %	50 %	260871147
58	NC_013370	ATCA	2	8	21463	21470	50 %	25 %	0 %	25 %	260871147
59	NC_013370	GTCC	2	8	21527	21534	0 %	25 %	25 %	50 %	260871147
60	NC_013370	ATGT	2	8	21971	21978	25 %	50 %	25 %	0 %	260871148
61	NC_013370	ACTC	2	8	22787	22794	25 %	25 %	0 %	50 %	260871149
62	NC_013370	TTGA	2	8	24304	24311	25 %	50 %	25 %	0 %	260871150
63	NC_013370	CATC	2	8	25461	25468	25 %	25 %	0 %	50 %	260871152
64	NC_013370	TTAA	2	8	25832	25839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013370	CAAT	2	8	25955	25962	50 %	25 %	0 %	25 %	260871154
66	NC_013370	TAAA	2	8	26806	26813	75 %	25 %	0 %	0 %	260871155
67	NC_013370	CAGT	2	8	27000	27007	25 %	25 %	25 %	25 %	260871156
68	NC_013370	AAAT	2	8	27234	27241	75 %	25 %	0 %	0 %	260871156
69	NC_013370	AGCC	2	8	27336	27343	25 %	0 %	25 %	50 %	260871156
70	NC_013370	GCAG	2	8	27377	27384	25 %	0 %	50 %	25 %	260871156
71	NC_013370	CGAC	2	8	29029	29036	25 %	0 %	25 %	50 %	260871157
72	NC_013370	AGTC	2	8	29045	29052	25 %	25 %	25 %	25 %	260871157
73	NC_013370	ATTT	2	8	29087	29094	25 %	75 %	0 %	0 %	260871157
74	NC_013370	TGCC	2	8	29147	29154	0 %	25 %	25 %	50 %	260871157
75	NC_013370	ACCA	2	8	29244	29251	50 %	0 %	0 %	50 %	260871157
76	NC_013370	TACT	2	8	29719	29726	25 %	50 %	0 %	25 %	260871157
77	NC_013370	ATCA	2	8	29844	29851	50 %	25 %	0 %	25 %	260871157
78	NC_013370	ACAA	2	8	29895	29902	75 %	0 %	0 %	25 %	260871157
79	NC_013370	TCCA	2	8	30141	30148	25 %	25 %	0 %	50 %	260871157
80	NC_013370	GTAA	2	8	30309	30316	50 %	25 %	25 %	0 %	260871157
81	NC_013370	TCAT	2	8	30337	30344	25 %	50 %	0 %	25 %	260871157
82	NC_013370	AAAG	2	8	31894	31901	75 %	0 %	25 %	0 %	260871160
83	NC_013370	TCCG	2	8	31980	31987	0 %	25 %	25 %	50 %	260871160
84	NC_013370	AAAT	2	8	32124	32131	75 %	25 %	0 %	0 %	260871160
85	NC_013370	CAAC	2	8	32757	32764	50 %	0 %	0 %	50 %	260871160
86	NC_013370	CAGC	2	8	32967	32974	25 %	0 %	25 %	50 %	260871160
87	NC_013370	GAAT	2	8	33067	33074	50 %	25 %	25 %	0 %	260871160
88	NC_013370	ATCA	2	8	33490	33497	50 %	25 %	0 %	25 %	260871161
89	NC_013370	TCAT	2	8	33510	33517	25 %	50 %	0 %	25 %	260871162
90	NC_013370	GCAA	2	8	33633	33640	50 %	0 %	25 %	25 %	260871162
91	NC_013370	GGTT	2	8	33773	33780	0 %	50 %	50 %	0 %	260871162
92	NC_013370	GCTT	2	8	34410	34417	0 %	50 %	25 %	25 %	260871162
93	NC_013370	CCGT	2	8	36034	36041	0 %	25 %	25 %	50 %	260871162
94	NC_013370	AGCC	2	8	37202	37209	25 %	0 %	25 %	50 %	260871163
95	NC_013370	CAGC	2	8	37696	37703	25 %	0 %	25 %	50 %	260871163
96	NC_013370	GGTA	2	8	38268	38275	25 %	25 %	50 %	0 %	260871164
97	NC_013370	GATA	2	8	38618	38625	50 %	25 %	25 %	0 %	260871165
98	NC_013370	GCAA	2	8	38876	38883	50 %	0 %	25 %	25 %	260871165
99	NC_013370	TAAT	2	8	39627	39634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013370	GTTG	2	8	40075	40082	0 %	50 %	50 %	0 %	260871167
101	NC_013370	TGAC	2	8	40172	40179	25 %	25 %	25 %	25 %	260871167
102	NC_013370	ATAA	2	8	40265	40272	75 %	25 %	0 %	0 %	260871167
103	NC_013370	TATT	2	8	40377	40384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013370	AACT	2	8	40876	40883	50 %	25 %	0 %	25 %	260871169
105	NC_013370	ACAA	2	8	41465	41472	75 %	0 %	0 %	25 %	260871170
106	NC_013370	CGAC	2	8	42241	42248	25 %	0 %	25 %	50 %	260871171
107	NC_013370	AGCG	2	8	42284	42291	25 %	0 %	50 %	25 %	260871171
108	NC_013370	TTCG	2	8	42392	42399	0 %	50 %	25 %	25 %	260871171
109	NC_013370	GATG	2	8	42611	42618	25 %	25 %	50 %	0 %	260871171
110	NC_013370	TTTC	2	8	42847	42854	0 %	75 %	0 %	25 %	260871171
111	NC_013370	TTCA	2	8	43133	43140	25 %	50 %	0 %	25 %	260871172
112	NC_013370	TTTA	2	8	43402	43409	25 %	75 %	0 %	0 %	260871172
113	NC_013370	CAAA	2	8	45365	45372	75 %	0 %	0 %	25 %	260871176
114	NC_013370	TCAG	2	8	45888	45895	25 %	25 %	25 %	25 %	260871177
115	NC_013370	CTTA	2	8	46531	46538	25 %	50 %	0 %	25 %	260871178
116	NC_013370	AGAC	2	8	47084	47091	50 %	0 %	25 %	25 %	260871178
117	NC_013370	ATCA	2	8	47246	47253	50 %	25 %	0 %	25 %	260871178
118	NC_013370	CGCA	2	8	47360	47367	25 %	0 %	25 %	50 %	260871178
119	NC_013370	GGCT	2	8	48566	48573	0 %	25 %	50 %	25 %	260871179
120	NC_013370	GTCG	2	8	48755	48762	0 %	25 %	50 %	25 %	260871179
121	NC_013370	CAGG	2	8	49453	49460	25 %	0 %	50 %	25 %	260871179
122	NC_013370	GAGG	2	8	51295	51302	25 %	0 %	75 %	0 %	260871181
123	NC_013370	ATCA	2	8	51611	51618	50 %	25 %	0 %	25 %	260871181
124	NC_013370	TTTC	2	8	51622	51629	0 %	75 %	0 %	25 %	260871181
125	NC_013370	TCAG	2	8	52260	52267	25 %	25 %	25 %	25 %	260871181
126	NC_013370	GCTG	2	8	52309	52316	0 %	25 %	50 %	25 %	260871181
127	NC_013370	TCCC	2	8	52990	52997	0 %	25 %	0 %	75 %	260871183
128	NC_013370	ATCG	2	8	54095	54102	25 %	25 %	25 %	25 %	260871184
129	NC_013370	CCCA	2	8	54175	54182	25 %	0 %	0 %	75 %	260871184
130	NC_013370	CGTT	2	8	54284	54291	0 %	50 %	25 %	25 %	260871184
131	NC_013370	GGAA	2	8	54803	54810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013370	GCTT	2	8	55678	55685	0 %	50 %	25 %	25 %	260871187
133	NC_013370	GCTG	2	8	55908	55915	0 %	25 %	50 %	25 %	260871188
134	NC_013370	CCAA	2	8	56334	56341	50 %	0 %	0 %	50 %	260871188
135	NC_013370	TTTG	2	8	57081	57088	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013370	GGCA	2	8	57803	57810	25 %	0 %	50 %	25 %	260871191
137	NC_013370	AGTC	2	8	58586	58593	25 %	25 %	25 %	25 %	260871192
138	NC_013370	CTAA	2	8	58827	58834	50 %	25 %	0 %	25 %	260871192
139	NC_013370	GCTT	2	8	59246	59253	0 %	50 %	25 %	25 %	260871192
140	NC_013370	GGAA	2	8	60034	60041	50 %	0 %	50 %	0 %	260871192
141	NC_013370	AGAA	2	8	60460	60467	75 %	0 %	25 %	0 %	260871192
142	NC_013370	AACA	2	8	60795	60802	75 %	0 %	0 %	25 %	260871192
143	NC_013370	CCAC	2	8	62051	62058	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_013370	ATTA	2	8	63321	63328	50 %	50 %	0 %	0 %	260871195
145	NC_013370	GATT	2	8	64728	64735	25 %	50 %	25 %	0 %	260871197
146	NC_013370	TCGT	2	8	64859	64866	0 %	50 %	25 %	25 %	260871197
147	NC_013370	ATCG	2	8	65642	65649	25 %	25 %	25 %	25 %	260871197
148	NC_013370	AACA	2	8	66339	66346	75 %	0 %	0 %	25 %	260871198
149	NC_013370	GATT	2	8	66526	66533	25 %	50 %	25 %	0 %	260871198
150	NC_013370	GACG	2	8	66571	66578	25 %	0 %	50 %	25 %	260871198
151	NC_013370	GATT	2	8	66764	66771	25 %	50 %	25 %	0 %	260871198
152	NC_013370	CCGC	2	8	67172	67179	0 %	0 %	25 %	75 %	260871199
153	NC_013370	CATC	2	8	67482	67489	25 %	25 %	0 %	50 %	260871199
154	NC_013370	GAAT	2	8	67774	67781	50 %	25 %	25 %	0 %	260871200
155	NC_013370	TAAG	2	8	67983	67990	50 %	25 %	25 %	0 %	260871200
156	NC_013370	GATT	2	8	68742	68749	25 %	50 %	25 %	0 %	260871201
157	NC_013370	TGCC	2	8	68817	68824	0 %	25 %	25 %	50 %	260871201
158	NC_013370	AAAC	2	8	69418	69425	75 %	0 %	0 %	25 %	260871202
159	NC_013370	GCCT	2	8	71057	71064	0 %	25 %	25 %	50 %	260871203
160	NC_013370	TCTT	2	8	71111	71118	0 %	75 %	0 %	25 %	260871203
161	NC_013370	CATT	2	8	71311	71318	25 %	50 %	0 %	25 %	260871203
162	NC_013370	TGAT	2	8	71685	71692	25 %	50 %	25 %	0 %	260871204
163	NC_013370	AGAA	2	8	72140	72147	75 %	0 %	25 %	0 %	260871206
164	NC_013370	TGCA	2	8	72342	72349	25 %	25 %	25 %	25 %	260871206
165	NC_013370	AATT	2	8	72681	72688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_013370	AATG	2	8	72832	72839	50 %	25 %	25 %	0 %	260871207
167	NC_013370	TCAC	2	8	72924	72931	25 %	25 %	0 %	50 %	260871208
168	NC_013370	GGGA	2	8	73070	73077	25 %	0 %	75 %	0 %	260871208
169	NC_013370	TCGG	2	8	74164	74171	0 %	25 %	50 %	25 %	260871210
170	NC_013370	ATCG	2	8	74179	74186	25 %	25 %	25 %	25 %	260871210
171	NC_013370	AATG	2	8	74310	74317	50 %	25 %	25 %	0 %	260871210
172	NC_013370	GATG	2	8	74532	74539	25 %	25 %	50 %	0 %	260871210
173	NC_013370	GGAA	2	8	75506	75513	50 %	0 %	50 %	0 %	260871212
174	NC_013370	TTAC	2	8	75685	75692	25 %	50 %	0 %	25 %	260871212
175	NC_013370	CCAT	2	8	75844	75851	25 %	25 %	0 %	50 %	260871212
176	NC_013370	GTGG	2	8	76052	76059	0 %	25 %	75 %	0 %	260871212
177	NC_013370	CAAT	2	8	77031	77038	50 %	25 %	0 %	25 %	260871213
178	NC_013370	TCAG	2	8	77162	77169	25 %	25 %	25 %	25 %	260871213
179	NC_013370	AGCG	2	8	77538	77545	25 %	0 %	50 %	25 %	260871213
180	NC_013370	GCAA	2	8	77730	77737	50 %	0 %	25 %	25 %	260871213
181	NC_013370	GTTG	2	8	78158	78165	0 %	50 %	50 %	0 %	260871213
182	NC_013370	CTAT	2	8	78661	78668	25 %	50 %	0 %	25 %	260871214
183	NC_013370	CAAT	2	8	78927	78934	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
184	NC_013370	GAAG	2	8	79110	79117	50 %	0 %	50 %	0 %	260871215
185	NC_013370	TGAA	2	8	79462	79469	50 %	25 %	25 %	0 %	260871215
186	NC_013370	CGTG	2	8	80106	80113	0 %	25 %	50 %	25 %	260871217
187	NC_013370	ATTA	2	8	80300	80307	50 %	50 %	0 %	0 %	260871218
188	NC_013370	ATTT	2	8	80359	80366	25 %	75 %	0 %	0 %	260871218
189	NC_013370	CGAT	2	8	81011	81018	25 %	25 %	25 %	25 %	260871219
190	NC_013370	ATCA	2	8	81833	81840	50 %	25 %	0 %	25 %	260871220
191	NC_013370	TAAA	2	8	82316	82323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_013370	CCAG	2	8	82681	82688	25 %	0 %	25 %	50 %	260871223
193	NC_013370	GCTG	2	8	82927	82934	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
194	NC_013370	TGGC	2	8	82956	82963	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
195	NC_013370	GCAA	2	8	83357	83364	50 %	0 %	25 %	25 %	260871224
196	NC_013370	TGCC	2	8	83441	83448	0 %	25 %	25 %	50 %	260871224
197	NC_013370	CTGG	2	8	83637	83644	0 %	25 %	50 %	25 %	260871224
198	NC_013370	CTGG	2	8	84959	84966	0 %	25 %	50 %	25 %	260871228
199	NC_013370	TATT	2	8	85178	85185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_013370	GCGG	2	8	85835	85842	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
201	NC_013370	ATGG	2	8	86212	86219	25 %	25 %	50 %	0 %	260871230
202	NC_013370	CATC	2	8	87754	87761	25 %	25 %	0 %	50 %	260871232
203	NC_013370	ACCT	2	8	88536	88543	25 %	25 %	0 %	50 %	260871234
204	NC_013370	TGGT	2	8	88838	88845	0 %	50 %	50 %	0 %	260871235
205	NC_013370	GAAA	2	8	89361	89368	75 %	0 %	25 %	0 %	260871236
206	NC_013370	AATA	2	8	89523	89530	75 %	25 %	0 %	0 %	260871236
207	NC_013370	TCGT	2	8	89810	89817	0 %	50 %	25 %	25 %	260871236
208	NC_013370	AAAT	2	8	90126	90133	75 %	25 %	0 %	0 %	260871237
209	NC_013370	TGAT	2	8	90309	90316	25 %	50 %	25 %	0 %	260871237
210	NC_013370	GAAC	2	8	90412	90419	50 %	0 %	25 %	25 %	260871237
211	NC_013370	TGAT	2	8	90542	90549	25 %	50 %	25 %	0 %	260871237
212	NC_013370	GATA	2	8	91073	91080	50 %	25 %	25 %	0 %	260871238
213	NC_013370	AAAG	2	8	91356	91363	75 %	0 %	25 %	0 %	260871238
214	NC_013370	ACGA	2	8	91423	91430	50 %	0 %	25 %	25 %	260871238
215	NC_013370	GTGA	2	8	92321	92328	25 %	25 %	50 %	0 %	260871239
216	NC_013370	AATG	2	8	93299	93306	50 %	25 %	25 %	0 %	260871239
217	NC_013370	GCTC	2	8	93748	93755	0 %	25 %	25 %	50 %	260871240
218	NC_013370	CCAC	2	8	94020	94027	25 %	0 %	0 %	75 %	260871241
219	NC_013370	GATG	2	8	94227	94234	25 %	25 %	50 %	0 %	260871241
220	NC_013370	GACG	2	8	94241	94248	25 %	0 %	50 %	25 %	260871241
221	NC_013370	GTAA	2	8	94387	94394	50 %	25 %	25 %	0 %	260871241
222	NC_013370	CCAC	2	8	94401	94408	25 %	0 %	0 %	75 %	260871241
223	NC_013370	TTCC	2	8	94566	94573	0 %	50 %	0 %	50 %	260871241
224	NC_013370	CTCA	2	8	95734	95741	25 %	25 %	0 %	50 %	260871243
225	NC_013370	TAAC	2	8	96620	96627	50 %	25 %	0 %	25 %	260871244
226	NC_013370	ATCA	2	8	96826	96833	50 %	25 %	0 %	25 %	260871244
227	NC_013370	TCTG	2	8	96878	96885	0 %	50 %	25 %	25 %	260871244
228	NC_013370	CTGG	2	8	97301	97308	0 %	25 %	50 %	25 %	260871245
229	NC_013370	TGGT	2	8	97478	97485	0 %	50 %	50 %	0 %	260871245
230	NC_013370	TGAA	2	8	97486	97493	50 %	25 %	25 %	0 %	260871245

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.