MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_2

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013370	CG	3	6	1724	1729	0 %	0 %	50 %	50 %	260871129
2	NC_013370	CA	3	6	2312	2317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013370	GA	3	6	3027	3032	50 %	0 %	50 %	0 %	260871131
4	NC_013370	GC	3	6	3033	3038	0 %	0 %	50 %	50 %	260871131
5	NC_013370	TG	3	6	3341	3346	0 %	50 %	50 %	0 %	260871131
6	NC_013370	GA	3	6	3632	3637	50 %	0 %	50 %	0 %	260871132
7	NC_013370	AT	3	6	4213	4218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013370	TC	3	6	5333	5338	0 %	50 %	0 %	50 %	260871136
9	NC_013370	CG	3	6	6553	6558	0 %	0 %	50 %	50 %	260871137
10	NC_013370	GC	3	6	6926	6931	0 %	0 %	50 %	50 %	260871137
11	NC_013370	GC	3	6	7240	7245	0 %	0 %	50 %	50 %	260871137
12	NC_013370	GA	3	6	7484	7489	50 %	0 %	50 %	0 %	260871137
13	NC_013370	CG	3	6	7524	7529	0 %	0 %	50 %	50 %	260871137
14	NC_013370	TG	3	6	7554	7559	0 %	50 %	50 %	0 %	260871137
15	NC_013370	GC	4	8	10990	10997	0 %	0 %	50 %	50 %	260871137
16	NC_013370	GT	3	6	11999	12004	0 %	50 %	50 %	0 %	260871137
17	NC_013370	GT	3	6	12287	12292	0 %	50 %	50 %	0 %	260871137
18	NC_013370	CT	3	6	12984	12989	0 %	50 %	0 %	50 %	260871138
19	NC_013370	TG	3	6	13072	13077	0 %	50 %	50 %	0 %	260871138
20	NC_013370	GC	3	6	13661	13666	0 %	0 %	50 %	50 %	260871138
21	NC_013370	GC	3	6	13916	13921	0 %	0 %	50 %	50 %	260871138
22	NC_013370	AT	3	6	15430	15435	50 %	50 %	0 %	0 %	260871140
23	NC_013370	CG	3	6	15444	15449	0 %	0 %	50 %	50 %	260871140
24	NC_013370	GT	3	6	16021	16026	0 %	50 %	50 %	0 %	260871142
25	NC_013370	TA	3	6	16448	16453	50 %	50 %	0 %	0 %	260871143
26	NC_013370	GC	3	6	17559	17564	0 %	0 %	50 %	50 %	260871144
27	NC_013370	GC	3	6	21085	21090	0 %	0 %	50 %	50 %	260871147
28	NC_013370	TG	3	6	21182	21187	0 %	50 %	50 %	0 %	260871147
29	NC_013370	GC	3	6	21573	21578	0 %	0 %	50 %	50 %	260871147
30	NC_013370	CG	3	6	21672	21677	0 %	0 %	50 %	50 %	260871147
31	NC_013370	GC	3	6	23282	23287	0 %	0 %	50 %	50 %	260871149
32	NC_013370	CG	3	6	23844	23849	0 %	0 %	50 %	50 %	260871149
33	NC_013370	AT	3	6	24570	24575	50 %	50 %	0 %	0 %	260871150
34	NC_013370	AT	3	6	24930	24935	50 %	50 %	0 %	0 %	260871151
35	NC_013370	TG	3	6	25532	25537	0 %	50 %	50 %	0 %	260871152
36	NC_013370	TA	4	8	25908	25915	50 %	50 %	0 %	0 %	260871154
37	NC_013370	AC	3	6	26225	26230	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013370	AT	3	6	26260	26265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013370	AG	3	6	26418	26423	50 %	0 %	50 %	0 %	260871155
40	NC_013370	AT	3	6	26834	26839	50 %	50 %	0 %	0 %	260871155
41	NC_013370	GT	3	6	27574	27579	0 %	50 %	50 %	0 %	260871157
42	NC_013370	AT	3	6	27646	27651	50 %	50 %	0 %	0 %	260871157
43	NC_013370	TG	3	6	27758	27763	0 %	50 %	50 %	0 %	260871157
44	NC_013370	GC	3	6	30726	30731	0 %	0 %	50 %	50 %	260871158
45	NC_013370	AT	3	6	31358	31363	50 %	50 %	0 %	0 %	260871159
46	NC_013370	TG	3	6	33151	33156	0 %	50 %	50 %	0 %	260871161
47	NC_013370	AT	3	6	35382	35387	50 %	50 %	0 %	0 %	260871162
48	NC_013370	AC	3	6	36730	36735	50 %	0 %	0 %	50 %	260871162
49	NC_013370	GA	3	6	36739	36744	50 %	0 %	50 %	0 %	260871162
50	NC_013370	TG	3	6	37213	37218	0 %	50 %	50 %	0 %	260871163
51	NC_013370	GT	3	6	39069	39074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013370	GC	3	6	39115	39120	0 %	0 %	50 %	50 %	260871166
53	NC_013370	AT	3	6	39643	39648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013370	GA	3	6	39789	39794	50 %	0 %	50 %	0 %	260871167
55	NC_013370	GC	3	6	41794	41799	0 %	0 %	50 %	50 %	260871170
56	NC_013370	AT	3	6	42172	42177	50 %	50 %	0 %	0 %	260871171
57	NC_013370	GC	3	6	42936	42941	0 %	0 %	50 %	50 %	260871171
58	NC_013370	AC	3	6	43055	43060	50 %	0 %	0 %	50 %	260871172
59	NC_013370	GA	3	6	44466	44471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013370	GT	3	6	44487	44492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013370	TA	3	6	45122	45127	50 %	50 %	0 %	0 %	260871176
62	NC_013370	AT	3	6	45571	45576	50 %	50 %	0 %	0 %	260871176
63	NC_013370	AG	3	6	47198	47203	50 %	0 %	50 %	0 %	260871178
64	NC_013370	CG	3	6	47477	47482	0 %	0 %	50 %	50 %	260871178
65	NC_013370	GT	4	8	47568	47575	0 %	50 %	50 %	0 %	260871178
66	NC_013370	AG	3	6	49077	49082	50 %	0 %	50 %	0 %	260871179
67	NC_013370	AC	3	6	49303	49308	50 %	0 %	0 %	50 %	260871179
68	NC_013370	CG	3	6	49761	49766	0 %	0 %	50 %	50 %	260871179
69	NC_013370	TG	3	6	49916	49921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013370	CG	3	6	51195	51200	0 %	0 %	50 %	50 %	260871181
71	NC_013370	CT	3	6	51674	51679	0 %	50 %	0 %	50 %	260871181
72	NC_013370	AC	3	6	51967	51972	50 %	0 %	0 %	50 %	260871181
73	NC_013370	AT	3	6	52049	52054	50 %	50 %	0 %	0 %	260871181
74	NC_013370	AC	3	6	52648	52653	50 %	0 %	0 %	50 %	260871182
75	NC_013370	AG	3	6	54037	54042	50 %	0 %	50 %	0 %	260871184
76	NC_013370	AC	3	6	54356	54361	50 %	0 %	0 %	50 %	260871184
77	NC_013370	CT	3	6	56856	56861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013370	GC	3	6	57797	57802	0 %	0 %	50 %	50 %	260871191
79	NC_013370	CA	3	6	58029	58034	50 %	0 %	0 %	50 %	260871191
80	NC_013370	AG	4	8	58759	58766	50 %	0 %	50 %	0 %	260871192
81	NC_013370	AT	3	6	58922	58927	50 %	50 %	0 %	0 %	260871192
82	NC_013370	GC	3	6	59584	59589	0 %	0 %	50 %	50 %	260871192
83	NC_013370	CA	3	6	60758	60763	50 %	0 %	0 %	50 %	260871192
84	NC_013370	GC	3	6	61189	61194	0 %	0 %	50 %	50 %	260871192
85	NC_013370	AG	3	6	61203	61208	50 %	0 %	50 %	0 %	260871192
86	NC_013370	TG	3	6	62454	62459	0 %	50 %	50 %	0 %	260871193
87	NC_013370	GC	3	6	62739	62744	0 %	0 %	50 %	50 %	260871194
88	NC_013370	TA	3	6	63155	63160	50 %	50 %	0 %	0 %	260871195
89	NC_013370	CT	3	6	63830	63835	0 %	50 %	0 %	50 %	260871196
90	NC_013370	GC	3	6	63961	63966	0 %	0 %	50 %	50 %	260871196
91	NC_013370	CG	3	6	64870	64875	0 %	0 %	50 %	50 %	260871197
92	NC_013370	AT	3	6	66550	66555	50 %	50 %	0 %	0 %	260871198
93	NC_013370	CG	3	6	66886	66891	0 %	0 %	50 %	50 %	260871198
94	NC_013370	AG	3	6	68175	68180	50 %	0 %	50 %	0 %	260871200
95	NC_013370	AT	3	6	69673	69678	50 %	50 %	0 %	0 %	260871202
96	NC_013370	GC	3	6	70456	70461	0 %	0 %	50 %	50 %	260871203
97	NC_013370	CG	3	6	71189	71194	0 %	0 %	50 %	50 %	260871203
98	NC_013370	CA	3	6	71577	71582	50 %	0 %	0 %	50 %	260871204
99	NC_013370	AG	3	6	72536	72541	50 %	0 %	50 %	0 %	260871206
100	NC_013370	GC	3	6	73267	73272	0 %	0 %	50 %	50 %	260871208
101	NC_013370	CG	3	6	73479	73484	0 %	0 %	50 %	50 %	260871208
102	NC_013370	GC	3	6	74509	74514	0 %	0 %	50 %	50 %	260871210
103	NC_013370	AG	4	8	75430	75437	50 %	0 %	50 %	0 %	260871212
104	NC_013370	GC	3	6	76569	76574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013370	GC	3	6	77616	77621	0 %	0 %	50 %	50 %	260871213
106	NC_013370	GC	3	6	80142	80147	0 %	0 %	50 %	50 %	260871217
107	NC_013370	GA	3	6	81250	81255	50 %	0 %	50 %	0 %	260871219
108	NC_013370	CT	3	6	82147	82152	0 %	50 %	0 %	50 %	260871221
109	NC_013370	AG	3	6	82743	82748	50 %	0 %	50 %	0 %	260871223
110	NC_013370	TA	3	6	82909	82914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013370	GC	3	6	82945	82950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013370	TA	3	6	83314	83319	50 %	50 %	0 %	0 %	260871224
113	NC_013370	TA	3	6	83775	83780	50 %	50 %	0 %	0 %	260871224
114	NC_013370	CA	3	6	84339	84344	50 %	0 %	0 %	50 %	260871226
115	NC_013370	TG	3	6	85343	85348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013370	GC	3	6	85782	85787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013370	TC	3	6	86872	86877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013370	TG	3	6	87870	87875	0 %	50 %	50 %	0 %	260871232
119	NC_013370	CG	3	6	88170	88175	0 %	0 %	50 %	50 %	260871233
120	NC_013370	AT	3	6	88375	88380	50 %	50 %	0 %	0 %	260871234
121	NC_013370	AT	3	6	88564	88569	50 %	50 %	0 %	0 %	260871234
122	NC_013370	GA	3	6	88687	88692	50 %	0 %	50 %	0 %	260871234
123	NC_013370	GC	3	6	89831	89836	0 %	0 %	50 %	50 %	260871236
124	NC_013370	CT	3	6	90349	90354	0 %	50 %	0 %	50 %	260871237
125	NC_013370	AG	3	6	90889	90894	50 %	0 %	50 %	0 %	260871238
126	NC_013370	CG	4	8	91100	91107	0 %	0 %	50 %	50 %	260871238
127	NC_013370	GC	3	6	93013	93018	0 %	0 %	50 %	50 %	260871239
128	NC_013370	TC	3	6	93814	93819	0 %	50 %	0 %	50 %	260871240
129	NC_013370	TC	4	8	94641	94648	0 %	50 %	0 %	50 %	260871241
130	NC_013370	CA	3	6	95228	95233	50 %	0 %	0 %	50 %	260871243
131	NC_013370	CA	3	6	95418	95423	50 %	0 %	0 %	50 %	260871243
132	NC_013370	GC	3	6	96333	96338	0 %	0 %	50 %	50 %	260871244
133	NC_013370	GC	3	6	96385	96390	0 %	0 %	50 %	50 %	260871244
134	NC_013370	AT	3	6	96472	96477	50 %	50 %	0 %	0 %	260871244
135	NC_013370	AC	3	6	96597	96602	50 %	0 %	0 %	50 %	260871244
136	NC_013370	CA	3	6	96603	96608	50 %	0 %	0 %	50 %	260871244
137	NC_013370	TG	3	6	97594	97599	0 %	50 %	50 %	0 %	260871247
138	NC_013370	TC	3	6	97808	97813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.