MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_1

Total Repeats: 246

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013369	GAAA	2	8	253	260	75 %	0 %	25 %	0 %	260763803
2	NC_013369	GAAA	2	8	504	511	75 %	0 %	25 %	0 %	260763803
3	NC_013369	TAAA	2	8	525	532	75 %	25 %	0 %	0 %	260763804
4	NC_013369	TTCT	2	8	1218	1225	0 %	75 %	0 %	25 %	260763804
5	NC_013369	CTTT	2	8	1436	1443	0 %	75 %	0 %	25 %	260763804
6	NC_013369	GAGC	2	8	1466	1473	25 %	0 %	50 %	25 %	260763804
7	NC_013369	AATG	2	8	1763	1770	50 %	25 %	25 %	0 %	260763804
8	NC_013369	TGCT	2	8	1851	1858	0 %	50 %	25 %	25 %	260763804
9	NC_013369	AGAA	2	8	2146	2153	75 %	0 %	25 %	0 %	260763804
10	NC_013369	AACA	2	8	2285	2292	75 %	0 %	0 %	25 %	260763804
11	NC_013369	TATG	2	8	2479	2486	25 %	50 %	25 %	0 %	260763804
12	NC_013369	TTGC	2	8	3609	3616	0 %	50 %	25 %	25 %	260763805
13	NC_013369	TTGC	2	8	4266	4273	0 %	50 %	25 %	25 %	260763805
14	NC_013369	AATA	2	8	4580	4587	75 %	25 %	0 %	0 %	260763805
15	NC_013369	ATGG	2	8	4742	4749	25 %	25 %	50 %	0 %	260763805
16	NC_013369	TTCT	2	8	6151	6158	0 %	75 %	0 %	25 %	260763806
17	NC_013369	TAAA	2	8	6316	6323	75 %	25 %	0 %	0 %	260763806
18	NC_013369	AGGA	2	8	6385	6392	50 %	0 %	50 %	0 %	260763806
19	NC_013369	ATAC	2	8	6717	6724	50 %	25 %	0 %	25 %	260763806
20	NC_013369	GAAA	2	8	6996	7003	75 %	0 %	25 %	0 %	260763806
21	NC_013369	AAAG	2	8	7470	7477	75 %	0 %	25 %	0 %	260763807
22	NC_013369	TGTT	2	8	8073	8080	0 %	75 %	25 %	0 %	260763809
23	NC_013369	CCTG	2	8	8387	8394	0 %	25 %	25 %	50 %	260763809
24	NC_013369	GCTG	2	8	8449	8456	0 %	25 %	50 %	25 %	260763809
25	NC_013369	CTCA	2	8	8997	9004	25 %	25 %	0 %	50 %	260763810
26	NC_013369	CATC	2	8	9313	9320	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013369	GAAA	2	8	9665	9672	75 %	0 %	25 %	0 %	260763811
28	NC_013369	GAGC	2	8	9900	9907	25 %	0 %	50 %	25 %	260763812
29	NC_013369	AGAT	2	8	11109	11116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013369	ATGA	2	8	11172	11179	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013369	TCCT	2	8	11203	11210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013369	CAGA	2	8	11640	11647	50 %	0 %	25 %	25 %	260763814
33	NC_013369	GCAG	2	8	12500	12507	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013369	CTGA	2	8	12538	12545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013369	ATTC	2	8	13627	13634	25 %	50 %	0 %	25 %	260763815
36	NC_013369	GCTG	2	8	13675	13682	0 %	25 %	50 %	25 %	260763815
37	NC_013369	AGTG	2	8	14336	14343	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013369	CGCC	2	8	14514	14521	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_013369	ACGA	2	8	14623	14630	50 %	0 %	25 %	25 %	260763816
40	NC_013369	ATAC	2	8	14759	14766	50 %	25 %	0 %	25 %	260763816
41	NC_013369	AGAA	2	8	14858	14865	75 %	0 %	25 %	0 %	260763816
42	NC_013369	ATGC	2	8	15082	15089	25 %	25 %	25 %	25 %	260763816
43	NC_013369	CTGA	2	8	15104	15111	25 %	25 %	25 %	25 %	260763816
44	NC_013369	GTCT	2	8	15737	15744	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013369	CTCA	2	8	15777	15784	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013369	CAGG	2	8	16008	16015	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013369	CCAC	2	8	16566	16573	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_013369	TCCG	2	8	17427	17434	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013369	GTAA	2	8	17594	17601	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013369	GTCA	2	8	17631	17638	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013369	GTCA	2	8	17693	17700	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013369	CGTT	2	8	18451	18458	0 %	50 %	25 %	25 %	260763818
53	NC_013369	GTGA	2	8	18953	18960	25 %	25 %	50 %	0 %	260763819
54	NC_013369	TGGC	2	8	19404	19411	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013369	CCGG	2	8	20392	20399	0 %	0 %	50 %	50 %	260763820
56	NC_013369	GGCT	2	8	20674	20681	0 %	25 %	50 %	25 %	260763820
57	NC_013369	CTGC	2	8	20909	20916	0 %	25 %	25 %	50 %	260763820
58	NC_013369	GCTG	2	8	21043	21050	0 %	25 %	50 %	25 %	260763820
59	NC_013369	CAAA	2	8	21251	21258	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013369	AACA	2	8	21376	21383	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013369	GACA	2	8	22227	22234	50 %	0 %	25 %	25 %	260763821
62	NC_013369	CTTT	2	8	22310	22317	0 %	75 %	0 %	25 %	260763821
63	NC_013369	GTAT	2	8	22400	22407	25 %	50 %	25 %	0 %	260763821
64	NC_013369	TTAT	2	8	22694	22701	25 %	75 %	0 %	0 %	260763821
65	NC_013369	ATTT	2	8	22770	22777	25 %	75 %	0 %	0 %	260763821
66	NC_013369	ATTT	2	8	22863	22870	25 %	75 %	0 %	0 %	260763821
67	NC_013369	AAAT	2	8	23436	23443	75 %	25 %	0 %	0 %	260763821
68	NC_013369	ATAA	2	8	24034	24041	75 %	25 %	0 %	0 %	260763821
69	NC_013369	ACAG	2	8	24254	24261	50 %	0 %	25 %	25 %	260763821
70	NC_013369	CTGT	2	8	24303	24310	0 %	50 %	25 %	25 %	260763821
71	NC_013369	TATT	2	8	24333	24340	25 %	75 %	0 %	0 %	260763821
72	NC_013369	TACA	2	8	25227	25234	50 %	25 %	0 %	25 %	260763821
73	NC_013369	GTCA	2	8	25327	25334	25 %	25 %	25 %	25 %	260763821
74	NC_013369	TTCT	2	8	26323	26330	0 %	75 %	0 %	25 %	260763821
75	NC_013369	ATTT	2	8	26509	26516	25 %	75 %	0 %	0 %	260763821
76	NC_013369	ATAA	2	8	26590	26597	75 %	25 %	0 %	0 %	260763821
77	NC_013369	GAGT	2	8	26905	26912	25 %	25 %	50 %	0 %	260763821
78	NC_013369	TTTG	2	8	27116	27123	0 %	75 %	25 %	0 %	260763821
79	NC_013369	ATTA	2	8	27664	27671	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
80	NC_013369	AAAT	2	8	27820	27827	75 %	25 %	0 %	0 %	260763821
81	NC_013369	TATC	2	8	27836	27843	25 %	50 %	0 %	25 %	260763821
82	NC_013369	AGGG	2	8	27975	27982	25 %	0 %	75 %	0 %	260763821
83	NC_013369	ATAA	2	8	28840	28847	75 %	25 %	0 %	0 %	260763821
84	NC_013369	AATT	2	8	28848	28855	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
85	NC_013369	AGGT	2	8	29130	29137	25 %	25 %	50 %	0 %	260763821
86	NC_013369	TACT	2	8	29427	29434	25 %	50 %	0 %	25 %	260763821
87	NC_013369	AAAC	2	8	29470	29477	75 %	0 %	0 %	25 %	260763821
88	NC_013369	TATC	2	8	29775	29782	25 %	50 %	0 %	25 %	260763821
89	NC_013369	TATT	2	8	30416	30423	25 %	75 %	0 %	0 %	260763821
90	NC_013369	AAGT	2	8	30629	30636	50 %	25 %	25 %	0 %	260763821
91	NC_013369	TTGT	2	8	30799	30806	0 %	75 %	25 %	0 %	260763821
92	NC_013369	ATTA	2	8	30979	30986	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
93	NC_013369	TGAT	2	8	31079	31086	25 %	50 %	25 %	0 %	260763821
94	NC_013369	TCCT	2	8	31106	31113	0 %	50 %	0 %	50 %	260763821
95	NC_013369	GGAA	2	8	31174	31181	50 %	0 %	50 %	0 %	260763821
96	NC_013369	TATG	2	8	31281	31288	25 %	50 %	25 %	0 %	260763821
97	NC_013369	TTAT	2	8	32297	32304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013369	CGGG	2	8	33319	33326	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013369	CTGC	2	8	34132	34139	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013369	ATTC	2	8	35424	35431	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013369	CGGT	2	8	35543	35550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013369	GCCT	2	8	35648	35655	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013369	ATTT	2	8	35960	35967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013369	CTCC	2	8	36183	36190	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_013369	GACT	2	8	36260	36267	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013369	CGGA	2	8	37005	37012	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013369	TACG	2	8	37391	37398	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013369	GGCT	2	8	37405	37412	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_013369	AGAT	2	8	37500	37507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013369	ATTG	2	8	37779	37786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013369	CTTC	2	8	38401	38408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013369	TTGT	2	8	39204	39211	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013369	TCGA	2	8	39265	39272	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013369	CTGC	2	8	39332	39339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_013369	CTTC	2	8	39999	40006	0 %	50 %	0 %	50 %	260763824
116	NC_013369	CCAG	2	8	40585	40592	25 %	0 %	25 %	50 %	260763824
117	NC_013369	TCCG	2	8	40660	40667	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013369	CCAG	2	8	41544	41551	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013369	GTCA	2	8	41702	41709	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013369	CCTG	2	8	43036	43043	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013369	TGAG	2	8	43267	43274	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013369	CAGA	2	8	43306	43313	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013369	TCAG	2	8	43940	43947	25 %	25 %	25 %	25 %	260763826
124	NC_013369	GCAT	2	8	43962	43969	25 %	25 %	25 %	25 %	260763826
125	NC_013369	GTAT	2	8	44285	44292	25 %	50 %	25 %	0 %	260763826
126	NC_013369	TCGT	2	8	44421	44428	0 %	50 %	25 %	25 %	260763826
127	NC_013369	CACT	2	8	44796	44803	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013369	GACT	2	8	44948	44955	25 %	25 %	25 %	25 %	260763827
129	NC_013369	GAAT	2	8	45574	45581	50 %	25 %	25 %	0 %	260763827
130	NC_013369	CCCA	2	8	45586	45593	25 %	0 %	0 %	75 %	260763827
131	NC_013369	ACTG	2	8	45947	45954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013369	ACAG	2	8	46364	46371	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013369	TTGT	2	8	46549	46556	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013369	TTAC	2	8	47380	47387	25 %	50 %	0 %	25 %	260763829
135	NC_013369	GTAT	2	8	47567	47574	25 %	50 %	25 %	0 %	260763829
136	NC_013369	GTGG	2	8	47747	47754	0 %	25 %	75 %	0 %	260763829
137	NC_013369	CTTT	2	8	48317	48324	0 %	75 %	0 %	25 %	260763830
138	NC_013369	TTAT	2	8	48695	48702	25 %	75 %	0 %	0 %	260763830
139	NC_013369	AAAT	2	8	48921	48928	75 %	25 %	0 %	0 %	260763830
140	NC_013369	TGAT	2	8	49361	49368	25 %	50 %	25 %	0 %	260763830
141	NC_013369	GAAA	2	8	49616	49623	75 %	0 %	25 %	0 %	260763830
142	NC_013369	TACA	2	8	50040	50047	50 %	25 %	0 %	25 %	260763830
143	NC_013369	CCTC	2	8	50266	50273	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_013369	GTTG	2	8	50682	50689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013369	ATAC	2	8	50705	50712	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_013369	TTAC	2	8	51515	51522	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.