MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_1

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013369	GAAA	2	8	253	260	75 %	0 %	25 %	0 %	260763803
2	NC_013369	GAAA	2	8	504	511	75 %	0 %	25 %	0 %	260763803
3	NC_013369	TAAA	2	8	525	532	75 %	25 %	0 %	0 %	260763804
4	NC_013369	TTCT	2	8	1218	1225	0 %	75 %	0 %	25 %	260763804
5	NC_013369	CTTT	2	8	1436	1443	0 %	75 %	0 %	25 %	260763804
6	NC_013369	GAGC	2	8	1466	1473	25 %	0 %	50 %	25 %	260763804
7	NC_013369	AATG	2	8	1763	1770	50 %	25 %	25 %	0 %	260763804
8	NC_013369	TGCT	2	8	1851	1858	0 %	50 %	25 %	25 %	260763804
9	NC_013369	AGAA	2	8	2146	2153	75 %	0 %	25 %	0 %	260763804
10	NC_013369	AACA	2	8	2285	2292	75 %	0 %	0 %	25 %	260763804
11	NC_013369	TATG	2	8	2479	2486	25 %	50 %	25 %	0 %	260763804
12	NC_013369	TTGC	2	8	3609	3616	0 %	50 %	25 %	25 %	260763805
13	NC_013369	TTGC	2	8	4266	4273	0 %	50 %	25 %	25 %	260763805
14	NC_013369	AATA	2	8	4580	4587	75 %	25 %	0 %	0 %	260763805
15	NC_013369	ATGG	2	8	4742	4749	25 %	25 %	50 %	0 %	260763805
16	NC_013369	TTCT	2	8	6151	6158	0 %	75 %	0 %	25 %	260763806
17	NC_013369	TAAA	2	8	6316	6323	75 %	25 %	0 %	0 %	260763806
18	NC_013369	AGGA	2	8	6385	6392	50 %	0 %	50 %	0 %	260763806
19	NC_013369	ATAC	2	8	6717	6724	50 %	25 %	0 %	25 %	260763806
20	NC_013369	GAAA	2	8	6996	7003	75 %	0 %	25 %	0 %	260763806
21	NC_013369	AAAG	2	8	7470	7477	75 %	0 %	25 %	0 %	260763807
22	NC_013369	TGTT	2	8	8073	8080	0 %	75 %	25 %	0 %	260763809
23	NC_013369	CCTG	2	8	8387	8394	0 %	25 %	25 %	50 %	260763809
24	NC_013369	GCTG	2	8	8449	8456	0 %	25 %	50 %	25 %	260763809
25	NC_013369	CTCA	2	8	8997	9004	25 %	25 %	0 %	50 %	260763810
26	NC_013369	GAAA	2	8	9665	9672	75 %	0 %	25 %	0 %	260763811
27	NC_013369	GAGC	2	8	9900	9907	25 %	0 %	50 %	25 %	260763812
28	NC_013369	CAGA	2	8	11640	11647	50 %	0 %	25 %	25 %	260763814
29	NC_013369	ATTC	2	8	13627	13634	25 %	50 %	0 %	25 %	260763815
30	NC_013369	GCTG	2	8	13675	13682	0 %	25 %	50 %	25 %	260763815
31	NC_013369	ACGA	2	8	14623	14630	50 %	0 %	25 %	25 %	260763816
32	NC_013369	ATAC	2	8	14759	14766	50 %	25 %	0 %	25 %	260763816
33	NC_013369	AGAA	2	8	14858	14865	75 %	0 %	25 %	0 %	260763816
34	NC_013369	ATGC	2	8	15082	15089	25 %	25 %	25 %	25 %	260763816
35	NC_013369	CTGA	2	8	15104	15111	25 %	25 %	25 %	25 %	260763816
36	NC_013369	CGTT	2	8	18451	18458	0 %	50 %	25 %	25 %	260763818
37	NC_013369	GTGA	2	8	18953	18960	25 %	25 %	50 %	0 %	260763819
38	NC_013369	CCGG	2	8	20392	20399	0 %	0 %	50 %	50 %	260763820
39	NC_013369	GGCT	2	8	20674	20681	0 %	25 %	50 %	25 %	260763820
40	NC_013369	CTGC	2	8	20909	20916	0 %	25 %	25 %	50 %	260763820
41	NC_013369	GCTG	2	8	21043	21050	0 %	25 %	50 %	25 %	260763820
42	NC_013369	GACA	2	8	22227	22234	50 %	0 %	25 %	25 %	260763821
43	NC_013369	CTTT	2	8	22310	22317	0 %	75 %	0 %	25 %	260763821
44	NC_013369	GTAT	2	8	22400	22407	25 %	50 %	25 %	0 %	260763821
45	NC_013369	TTAT	2	8	22694	22701	25 %	75 %	0 %	0 %	260763821
46	NC_013369	ATTT	2	8	22770	22777	25 %	75 %	0 %	0 %	260763821
47	NC_013369	ATTT	2	8	22863	22870	25 %	75 %	0 %	0 %	260763821
48	NC_013369	AAAT	2	8	23436	23443	75 %	25 %	0 %	0 %	260763821
49	NC_013369	ATAA	2	8	24034	24041	75 %	25 %	0 %	0 %	260763821
50	NC_013369	ACAG	2	8	24254	24261	50 %	0 %	25 %	25 %	260763821
51	NC_013369	CTGT	2	8	24303	24310	0 %	50 %	25 %	25 %	260763821
52	NC_013369	TATT	2	8	24333	24340	25 %	75 %	0 %	0 %	260763821
53	NC_013369	TACA	2	8	25227	25234	50 %	25 %	0 %	25 %	260763821
54	NC_013369	GTCA	2	8	25327	25334	25 %	25 %	25 %	25 %	260763821
55	NC_013369	TTCT	2	8	26323	26330	0 %	75 %	0 %	25 %	260763821
56	NC_013369	ATTT	2	8	26509	26516	25 %	75 %	0 %	0 %	260763821
57	NC_013369	ATAA	2	8	26590	26597	75 %	25 %	0 %	0 %	260763821
58	NC_013369	GAGT	2	8	26905	26912	25 %	25 %	50 %	0 %	260763821
59	NC_013369	TTTG	2	8	27116	27123	0 %	75 %	25 %	0 %	260763821
60	NC_013369	ATTA	2	8	27664	27671	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
61	NC_013369	AAAT	2	8	27820	27827	75 %	25 %	0 %	0 %	260763821
62	NC_013369	TATC	2	8	27836	27843	25 %	50 %	0 %	25 %	260763821
63	NC_013369	AGGG	2	8	27975	27982	25 %	0 %	75 %	0 %	260763821
64	NC_013369	ATAA	2	8	28840	28847	75 %	25 %	0 %	0 %	260763821
65	NC_013369	AATT	2	8	28848	28855	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
66	NC_013369	AGGT	2	8	29130	29137	25 %	25 %	50 %	0 %	260763821
67	NC_013369	TACT	2	8	29427	29434	25 %	50 %	0 %	25 %	260763821
68	NC_013369	AAAC	2	8	29470	29477	75 %	0 %	0 %	25 %	260763821
69	NC_013369	TATC	2	8	29775	29782	25 %	50 %	0 %	25 %	260763821
70	NC_013369	TATT	2	8	30416	30423	25 %	75 %	0 %	0 %	260763821
71	NC_013369	AAGT	2	8	30629	30636	50 %	25 %	25 %	0 %	260763821
72	NC_013369	TTGT	2	8	30799	30806	0 %	75 %	25 %	0 %	260763821
73	NC_013369	ATTA	2	8	30979	30986	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
74	NC_013369	TGAT	2	8	31079	31086	25 %	50 %	25 %	0 %	260763821
75	NC_013369	TCCT	2	8	31106	31113	0 %	50 %	0 %	50 %	260763821
76	NC_013369	GGAA	2	8	31174	31181	50 %	0 %	50 %	0 %	260763821
77	NC_013369	TATG	2	8	31281	31288	25 %	50 %	25 %	0 %	260763821
78	NC_013369	CTTC	2	8	39999	40006	0 %	50 %	0 %	50 %	260763824
79	NC_013369	CCAG	2	8	40585	40592	25 %	0 %	25 %	50 %	260763824
80	NC_013369	TCAG	2	8	43940	43947	25 %	25 %	25 %	25 %	260763826
81	NC_013369	GCAT	2	8	43962	43969	25 %	25 %	25 %	25 %	260763826
82	NC_013369	GTAT	2	8	44285	44292	25 %	50 %	25 %	0 %	260763826
83	NC_013369	TCGT	2	8	44421	44428	0 %	50 %	25 %	25 %	260763826
84	NC_013369	GACT	2	8	44948	44955	25 %	25 %	25 %	25 %	260763827
85	NC_013369	GAAT	2	8	45574	45581	50 %	25 %	25 %	0 %	260763827
86	NC_013369	CCCA	2	8	45586	45593	25 %	0 %	0 %	75 %	260763827
87	NC_013369	TTAC	2	8	47380	47387	25 %	50 %	0 %	25 %	260763829
88	NC_013369	GTAT	2	8	47567	47574	25 %	50 %	25 %	0 %	260763829
89	NC_013369	GTGG	2	8	47747	47754	0 %	25 %	75 %	0 %	260763829
90	NC_013369	CTTT	2	8	48317	48324	0 %	75 %	0 %	25 %	260763830
91	NC_013369	TTAT	2	8	48695	48702	25 %	75 %	0 %	0 %	260763830
92	NC_013369	AAAT	2	8	48921	48928	75 %	25 %	0 %	0 %	260763830
93	NC_013369	TGAT	2	8	49361	49368	25 %	50 %	25 %	0 %	260763830
94	NC_013369	GAAA	2	8	49616	49623	75 %	0 %	25 %	0 %	260763830
95	NC_013369	TACA	2	8	50040	50047	50 %	25 %	0 %	25 %	260763830
96	NC_013369	TTGT	2	8	51943	51950	0 %	75 %	25 %	0 %	260763832
97	NC_013369	CTTT	3	12	52000	52011	0 %	75 %	0 %	25 %	260763832
98	NC_013369	CCTG	2	8	52188	52195	0 %	25 %	25 %	50 %	260763833
99	NC_013369	GTTT	2	8	52497	52504	0 %	75 %	25 %	0 %	260763833
100	NC_013369	TTCT	2	8	52635	52642	0 %	75 %	0 %	25 %	260763833
101	NC_013369	GCAA	2	8	52748	52755	50 %	0 %	25 %	25 %	260763833
102	NC_013369	GCTG	2	8	53488	53495	0 %	25 %	50 %	25 %	260763834
103	NC_013369	TTCA	2	8	53901	53908	25 %	50 %	0 %	25 %	260763834
104	NC_013369	TGGC	2	8	54023	54030	0 %	25 %	50 %	25 %	260763834
105	NC_013369	CGGG	2	8	54181	54188	0 %	0 %	75 %	25 %	260763835
106	NC_013369	CTGT	2	8	54271	54278	0 %	50 %	25 %	25 %	260763835
107	NC_013369	ACTG	2	8	54622	54629	25 %	25 %	25 %	25 %	260763836
108	NC_013369	GCAG	2	8	55064	55071	25 %	0 %	50 %	25 %	260763836
109	NC_013369	ATGA	2	8	55312	55319	50 %	25 %	25 %	0 %	260763837
110	NC_013369	GCCA	2	8	55387	55394	25 %	0 %	25 %	50 %	260763837
111	NC_013369	CTTT	2	8	56549	56556	0 %	75 %	0 %	25 %	260763840
112	NC_013369	TGGC	2	8	56653	56660	0 %	25 %	50 %	25 %	260763840
113	NC_013369	CCGT	2	8	56740	56747	0 %	25 %	25 %	50 %	260763840
114	NC_013369	CCAT	2	8	59958	59965	25 %	25 %	0 %	50 %	260763844
115	NC_013369	CTGG	2	8	60696	60703	0 %	25 %	50 %	25 %	260763845
116	NC_013369	GCTG	2	8	60975	60982	0 %	25 %	50 %	25 %	260763845
117	NC_013369	AGGA	2	8	61049	61056	50 %	0 %	50 %	0 %	260763845
118	NC_013369	TCAC	2	8	61163	61170	25 %	25 %	0 %	50 %	260763845
119	NC_013369	TACA	2	8	62030	62037	50 %	25 %	0 %	25 %	260763848
120	NC_013369	TGAC	2	8	62481	62488	25 %	25 %	25 %	25 %	260763849
121	NC_013369	CAGC	2	8	62626	62633	25 %	0 %	25 %	50 %	260763849
122	NC_013369	TGAT	2	8	62730	62737	25 %	50 %	25 %	0 %	260763849
123	NC_013369	CCTG	2	8	63243	63250	0 %	25 %	25 %	50 %	260763850
124	NC_013369	TGAG	2	8	63781	63788	25 %	25 %	50 %	0 %	260763851
125	NC_013369	GGAA	2	8	64016	64023	50 %	0 %	50 %	0 %	260763851
126	NC_013369	TGAT	2	8	64326	64333	25 %	50 %	25 %	0 %	260763852
127	NC_013369	CAGT	2	8	64348	64355	25 %	25 %	25 %	25 %	260763852
128	NC_013369	TGCA	2	8	64755	64762	25 %	25 %	25 %	25 %	260763852
129	NC_013369	GTTC	2	8	65013	65020	0 %	50 %	25 %	25 %	260763852
130	NC_013369	TCAG	2	8	65091	65098	25 %	25 %	25 %	25 %	260763852
131	NC_013369	CCGG	2	8	65146	65153	0 %	0 %	50 %	50 %	260763852
132	NC_013369	ATGG	2	8	65287	65294	25 %	25 %	50 %	0 %	260763852
133	NC_013369	GGCA	2	8	65652	65659	25 %	0 %	50 %	25 %	260763852
134	NC_013369	ATCC	2	8	65768	65775	25 %	25 %	0 %	50 %	260763852
135	NC_013369	TGCG	2	8	65973	65980	0 %	25 %	50 %	25 %	260763852
136	NC_013369	GAAG	2	8	66178	66185	50 %	0 %	50 %	0 %	260763852
137	NC_013369	GTGG	2	8	66238	66245	0 %	25 %	75 %	0 %	260763852
138	NC_013369	ATTC	2	8	69810	69817	25 %	50 %	0 %	25 %	260763854
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.