MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_1

Total Repeats: 395

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013369	AGG	2	6	3524	3529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013369	AGG	2	6	3543	3548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013369	AAT	2	6	7172	7177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013369	ATA	2	6	7994	7999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013369	AGA	2	6	8035	8040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013369	CAT	2	6	9353	9358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013369	ATC	3	9	9365	9373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013369	GGA	2	6	9417	9422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013369	AAT	2	6	9487	9492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013369	CGG	2	6	10609	10614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013369	TGC	2	6	10658	10663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013369	GCT	2	6	10889	10894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013369	CTG	2	6	10958	10963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013369	CAC	2	6	11074	11079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_013369	CGA	2	6	11103	11108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013369	CTG	2	6	11140	11145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013369	TAA	2	6	11236	11241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013369	CCG	2	6	11377	11382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_013369	ACA	2	6	11557	11562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013369	CGT	2	6	12458	12463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013369	TTC	2	6	12474	12479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013369	CAG	2	6	12488	12493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013369	AAC	2	6	12529	12534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013369	CAT	2	6	12671	12676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013369	GAA	2	6	12703	12708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013369	ATG	2	6	12764	12769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013369	TTA	2	6	12817	12822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013369	TTA	2	6	12916	12921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013369	GAT	2	6	12938	12943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013369	TAT	2	6	13122	13127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013369	TGT	2	6	14078	14083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013369	TTA	2	6	14084	14089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013369	ATC	2	6	14090	14095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013369	CAT	2	6	14110	14115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013369	GAA	2	6	14284	14289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013369	CTG	2	6	14322	14327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013369	CTT	2	6	14346	14351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013369	CAA	2	6	14593	14598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013369	AAC	2	6	15671	15676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013369	CGA	2	6	15685	15690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013369	CTG	2	6	15710	15715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013369	CAG	2	6	15722	15727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013369	TGT	2	6	15812	15817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013369	GCA	2	6	15824	15829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013369	AGA	2	6	15845	15850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013369	AGA	2	6	15857	15862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013369	AAC	2	6	16088	16093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013369	ATC	2	6	16099	16104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013369	CCA	2	6	16186	16191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_013369	CTG	2	6	16225	16230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013369	CAT	2	6	16344	16349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013369	AGC	2	6	16355	16360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013369	ATG	2	6	16373	16378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013369	CGT	2	6	16744	16749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013369	AGA	2	6	16797	16802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013369	CTG	2	6	16921	16926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013369	GCG	2	6	17022	17027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013369	TTC	2	6	17038	17043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013369	TGG	2	6	17052	17057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013369	GTT	2	6	17184	17189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013369	CAG	3	9	17293	17301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013369	GTG	2	6	17307	17312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013369	GCA	2	6	17340	17345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013369	AAT	2	6	17350	17355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013369	CAG	2	6	17416	17421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013369	TCC	2	6	17617	17622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_013369	AAC	2	6	17639	17644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013369	CTT	2	6	17665	17670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013369	AGA	2	6	17679	17684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013369	AGA	2	6	17703	17708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013369	AGG	2	6	17724	17729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013369	GAT	2	6	17731	17736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013369	AAC	2	6	17737	17742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013369	ATA	2	6	17789	17794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013369	GTC	2	6	18662	18667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013369	TGT	3	9	19239	19247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013369	AGT	2	6	19455	19460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013369	AGC	2	6	19485	19490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013369	GAT	2	6	19520	19525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013369	GGT	2	6	19652	19657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013369	ACG	2	6	19820	19825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013369	TCT	2	6	19891	19896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013369	AGA	2	6	19918	19923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013369	ATC	2	6	21092	21097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013369	TCA	2	6	21206	21211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013369	GTT	2	6	21224	21229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013369	AAG	2	6	21266	21271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013369	ATT	2	6	21315	21320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013369	CGC	2	6	21339	21344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_013369	CAA	2	6	21486	21491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013369	GCA	2	6	21524	21529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013369	GCC	3	9	21558	21566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_013369	TGT	2	6	21608	21613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013369	CAT	3	9	21621	21629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013369	CAA	2	6	31548	31553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013369	GTT	2	6	31596	31601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013369	ATT	2	6	31613	31618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013369	TAG	2	6	31643	31648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013369	AGC	2	6	31854	31859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013369	TGC	3	9	31887	31895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013369	GCG	2	6	32188	32193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013369	CAG	2	6	32213	32218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013369	TAC	2	6	32312	32317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013369	GTA	2	6	32362	32367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013369	CAG	2	6	32438	32443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013369	CGC	2	6	32455	32460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_013369	GAA	2	6	32474	32479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013369	TCA	2	6	32556	32561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013369	TAA	2	6	32565	32570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013369	TTC	2	6	32643	32648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013369	CCA	2	6	32650	32655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_013369	GCT	2	6	32692	32697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013369	CTT	2	6	32779	32784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013369	TGC	2	6	32800	32805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013369	CCG	2	6	32986	32991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_013369	GAG	2	6	32992	32997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013369	TCA	2	6	33117	33122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013369	CAT	2	6	33138	33143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013369	GCA	2	6	33163	33168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013369	GCT	2	6	33405	33410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013369	TCC	2	6	33439	33444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_013369	TTC	2	6	33483	33488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013369	GAC	2	6	33533	33538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013369	GTT	2	6	33617	33622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013369	CAG	2	6	33624	33629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013369	ACG	2	6	33651	33656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013369	TCT	2	6	33736	33741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013369	TTC	2	6	33750	33755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013369	CAA	2	6	33849	33854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013369	CAC	2	6	34007	34012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_013369	GAA	2	6	34042	34047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013369	CAG	2	6	34070	34075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013369	CCG	2	6	34178	34183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_013369	CTG	2	6	34232	34237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013369	AAC	2	6	34291	34296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013369	CAC	2	6	34346	34351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_013369	ACC	2	6	34417	34422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_013369	GCT	2	6	34443	34448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013369	CTT	2	6	34538	34543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013369	GCT	2	6	34648	34653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013369	TGT	2	6	35030	35035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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395	NC_013369	CTT	2	6	85085	85090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.