MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_1

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013369	CT	3	6	131	136	0 %	50 %	0 %	50 %	260763803
2	NC_013369	AT	3	6	204	209	50 %	50 %	0 %	0 %	260763803
3	NC_013369	TA	3	6	305	310	50 %	50 %	0 %	0 %	260763803
4	NC_013369	TC	3	6	910	915	0 %	50 %	0 %	50 %	260763804
5	NC_013369	AT	3	6	1342	1347	50 %	50 %	0 %	0 %	260763804
6	NC_013369	CT	3	6	1840	1845	0 %	50 %	0 %	50 %	260763804
7	NC_013369	AT	3	6	1981	1986	50 %	50 %	0 %	0 %	260763804
8	NC_013369	AT	3	6	2173	2178	50 %	50 %	0 %	0 %	260763804
9	NC_013369	TA	3	6	2462	2467	50 %	50 %	0 %	0 %	260763804
10	NC_013369	AT	3	6	2682	2687	50 %	50 %	0 %	0 %	260763804
11	NC_013369	TA	3	6	2765	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	260763804
12	NC_013369	AG	3	6	3114	3119	50 %	0 %	50 %	0 %	260763804
13	NC_013369	GA	3	6	3276	3281	50 %	0 %	50 %	0 %	260763804
14	NC_013369	TA	3	6	3326	3331	50 %	50 %	0 %	0 %	260763804
15	NC_013369	TA	3	6	3453	3458	50 %	50 %	0 %	0 %	260763804
16	NC_013369	CA	3	6	3481	3486	50 %	0 %	0 %	50 %	260763804
17	NC_013369	CA	4	8	3672	3679	50 %	0 %	0 %	50 %	260763805
18	NC_013369	TA	3	6	3813	3818	50 %	50 %	0 %	0 %	260763805
19	NC_013369	TC	3	6	4210	4215	0 %	50 %	0 %	50 %	260763805
20	NC_013369	GA	3	6	4309	4314	50 %	0 %	50 %	0 %	260763805
21	NC_013369	GA	3	6	4771	4776	50 %	0 %	50 %	0 %	260763805
22	NC_013369	TA	3	6	5118	5123	50 %	50 %	0 %	0 %	260763805
23	NC_013369	CA	3	6	5545	5550	50 %	0 %	0 %	50 %	260763805
24	NC_013369	CA	3	6	5618	5623	50 %	0 %	0 %	50 %	260763805
25	NC_013369	CA	3	6	5766	5771	50 %	0 %	0 %	50 %	260763806
26	NC_013369	GA	3	6	5786	5791	50 %	0 %	50 %	0 %	260763806
27	NC_013369	TA	3	6	7128	7133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013369	TC	3	6	7669	7674	0 %	50 %	0 %	50 %	260763808
29	NC_013369	AT	3	6	7943	7948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013369	GC	3	6	8630	8635	0 %	0 %	50 %	50 %	260763809
31	NC_013369	TG	3	6	9609	9614	0 %	50 %	50 %	0 %	260763811
32	NC_013369	CA	3	6	9729	9734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013369	CA	3	6	9756	9761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013369	GA	3	6	9811	9816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013369	AT	3	6	11485	11490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013369	CA	3	6	11941	11946	50 %	0 %	0 %	50 %	260763814
37	NC_013369	AT	3	6	12777	12782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013369	AT	3	6	13206	13211	50 %	50 %	0 %	0 %	260763815
39	NC_013369	CT	3	6	13618	13623	0 %	50 %	0 %	50 %	260763815
40	NC_013369	TC	3	6	13636	13641	0 %	50 %	0 %	50 %	260763815
41	NC_013369	GC	4	8	14498	14505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013369	TA	3	6	14610	14615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013369	AG	3	6	14996	15001	50 %	0 %	50 %	0 %	260763816
44	NC_013369	AC	3	6	15675	15680	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013369	GA	3	6	15941	15946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013369	TG	3	6	16988	16993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013369	AG	3	6	17500	17505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013369	AT	3	6	19429	19434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013369	TG	3	6	19505	19510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013369	TA	3	6	19954	19959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013369	GC	3	6	20237	20242	0 %	0 %	50 %	50 %	260763820
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53	NC_013369	GC	3	6	20887	20892	0 %	0 %	50 %	50 %	260763820
54	NC_013369	CG	3	6	21452	21457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013369	CA	3	6	21515	21520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013369	CA	3	6	21689	21694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013369	CG	3	6	21817	21822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013369	AG	3	6	22080	22085	50 %	0 %	50 %	0 %	260763821
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60	NC_013369	AT	3	6	22345	22350	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
61	NC_013369	AT	3	6	22406	22411	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
62	NC_013369	TA	4	8	23013	23020	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
63	NC_013369	AT	4	8	23059	23066	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
64	NC_013369	AT	4	8	23523	23530	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
65	NC_013369	AT	3	6	23770	23775	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
66	NC_013369	TA	3	6	24381	24386	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
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70	NC_013369	AT	3	6	24559	24564	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
71	NC_013369	TC	3	6	25403	25408	0 %	50 %	0 %	50 %	260763821
72	NC_013369	AT	4	8	25692	25699	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
73	NC_013369	TG	3	6	25706	25711	0 %	50 %	50 %	0 %	260763821
74	NC_013369	TA	3	6	25905	25910	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
75	NC_013369	TA	3	6	26485	26490	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
76	NC_013369	AT	4	8	26671	26678	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
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80	NC_013369	TA	4	8	27702	27709	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
81	NC_013369	TA	3	6	28327	28332	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
82	NC_013369	CT	3	6	28526	28531	0 %	50 %	0 %	50 %	260763821
83	NC_013369	AT	3	6	28535	28540	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
84	NC_013369	TA	3	6	28669	28674	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
85	NC_013369	AT	3	6	29415	29420	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
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88	NC_013369	AT	3	6	30291	30296	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
89	NC_013369	TC	3	6	30398	30403	0 %	50 %	0 %	50 %	260763821
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91	NC_013369	TA	3	6	30667	30672	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
92	NC_013369	AT	3	6	30783	30788	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
93	NC_013369	TA	3	6	31206	31211	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
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108	NC_013369	GT	3	6	41616	41621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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110	NC_013369	TC	3	6	43105	43110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013369	GT	3	6	43371	43376	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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113	NC_013369	TA	3	6	44436	44441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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115	NC_013369	AT	3	6	45385	45390	50 %	50 %	0 %	0 %	260763827
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117	NC_013369	TA	3	6	46031	46036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013369	TA	4	8	46396	46403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013369	CT	3	6	46422	46427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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127	NC_013369	GC	3	6	51367	51372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013369	CT	3	6	51702	51707	0 %	50 %	0 %	50 %	260763832
129	NC_013369	AC	3	6	51745	51750	50 %	0 %	0 %	50 %	260763832
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.