MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_1

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013369	TA	3	6	7128	7133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013369	AT	3	6	7943	7948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013369	CA	3	6	9729	9734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013369	CA	3	6	9756	9761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013369	GA	3	6	9811	9816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013369	AT	3	6	11485	11490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013369	AT	3	6	12777	12782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013369	GC	4	8	14498	14505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013369	TA	3	6	14610	14615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013369	AC	3	6	15675	15680	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013369	GA	3	6	15941	15946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013369	TG	3	6	16988	16993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013369	AG	3	6	17500	17505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013369	AT	3	6	19429	19434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013369	TG	3	6	19505	19510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013369	TA	3	6	19954	19959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013369	CG	3	6	21452	21457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013369	CA	3	6	21515	21520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013369	CA	3	6	21689	21694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013369	CG	3	6	21817	21822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013369	CT	3	6	31535	31540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013369	GT	3	6	33087	33092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013369	CA	3	6	35642	35647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013369	CA	3	6	36035	36040	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013369	GC	3	6	36766	36771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013369	AG	3	6	37215	37220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013369	AG	3	6	37625	37630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013369	TA	3	6	37753	37758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013369	TG	3	6	38311	38316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013369	TG	3	6	38614	38619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013369	TA	3	6	41385	41390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013369	GT	3	6	41616	41621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013369	CA	3	6	42058	42063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013369	TC	3	6	43105	43110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013369	GT	3	6	43371	43376	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013369	TA	3	6	44436	44441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013369	TA	3	6	46031	46036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013369	TA	4	8	46396	46403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013369	CT	3	6	46422	46427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013369	GC	3	6	51367	51372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013369	CA	3	6	68124	68129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013369	AT	3	6	68960	68965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013369	GC	4	8	70681	70688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013369	TA	3	6	70793	70798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013369	AC	3	6	71858	71863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013369	GA	3	6	72124	72129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013369	TG	3	6	73171	73176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013369	AG	3	6	73463	73468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013369	GT	3	6	77657	77662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013369	CA	3	6	82588	82593	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013369	GA	3	6	82771	82776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013369	AG	4	8	84470	84477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013369	GC	3	6	84577	84582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013369	AG	3	6	84720	84725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013369	AT	3	6	85014	85019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013369	GA	3	6	85047	85052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013369	TA	3	6	85119	85124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.