MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_1

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013369	CT	3	6	131	136	0 %	50 %	0 %	50 %	260763803
2	NC_013369	AT	3	6	204	209	50 %	50 %	0 %	0 %	260763803
3	NC_013369	TA	3	6	305	310	50 %	50 %	0 %	0 %	260763803
4	NC_013369	TC	3	6	910	915	0 %	50 %	0 %	50 %	260763804
5	NC_013369	AT	3	6	1342	1347	50 %	50 %	0 %	0 %	260763804
6	NC_013369	CT	3	6	1840	1845	0 %	50 %	0 %	50 %	260763804
7	NC_013369	AT	3	6	1981	1986	50 %	50 %	0 %	0 %	260763804
8	NC_013369	AT	3	6	2173	2178	50 %	50 %	0 %	0 %	260763804
9	NC_013369	TA	3	6	2462	2467	50 %	50 %	0 %	0 %	260763804
10	NC_013369	AT	3	6	2682	2687	50 %	50 %	0 %	0 %	260763804
11	NC_013369	TA	3	6	2765	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	260763804
12	NC_013369	AG	3	6	3114	3119	50 %	0 %	50 %	0 %	260763804
13	NC_013369	GA	3	6	3276	3281	50 %	0 %	50 %	0 %	260763804
14	NC_013369	TA	3	6	3326	3331	50 %	50 %	0 %	0 %	260763804
15	NC_013369	TA	3	6	3453	3458	50 %	50 %	0 %	0 %	260763804
16	NC_013369	CA	3	6	3481	3486	50 %	0 %	0 %	50 %	260763804
17	NC_013369	CA	4	8	3672	3679	50 %	0 %	0 %	50 %	260763805
18	NC_013369	TA	3	6	3813	3818	50 %	50 %	0 %	0 %	260763805
19	NC_013369	TC	3	6	4210	4215	0 %	50 %	0 %	50 %	260763805
20	NC_013369	GA	3	6	4309	4314	50 %	0 %	50 %	0 %	260763805
21	NC_013369	GA	3	6	4771	4776	50 %	0 %	50 %	0 %	260763805
22	NC_013369	TA	3	6	5118	5123	50 %	50 %	0 %	0 %	260763805
23	NC_013369	CA	3	6	5545	5550	50 %	0 %	0 %	50 %	260763805
24	NC_013369	CA	3	6	5618	5623	50 %	0 %	0 %	50 %	260763805
25	NC_013369	CA	3	6	5766	5771	50 %	0 %	0 %	50 %	260763806
26	NC_013369	GA	3	6	5786	5791	50 %	0 %	50 %	0 %	260763806
27	NC_013369	TC	3	6	7669	7674	0 %	50 %	0 %	50 %	260763808
28	NC_013369	GC	3	6	8630	8635	0 %	0 %	50 %	50 %	260763809
29	NC_013369	TG	3	6	9609	9614	0 %	50 %	50 %	0 %	260763811
30	NC_013369	CA	3	6	11941	11946	50 %	0 %	0 %	50 %	260763814
31	NC_013369	AT	3	6	13206	13211	50 %	50 %	0 %	0 %	260763815
32	NC_013369	CT	3	6	13618	13623	0 %	50 %	0 %	50 %	260763815
33	NC_013369	TC	3	6	13636	13641	0 %	50 %	0 %	50 %	260763815
34	NC_013369	AG	3	6	14996	15001	50 %	0 %	50 %	0 %	260763816
35	NC_013369	GC	3	6	20237	20242	0 %	0 %	50 %	50 %	260763820
36	NC_013369	CA	4	8	20458	20465	50 %	0 %	0 %	50 %	260763820
37	NC_013369	GC	3	6	20887	20892	0 %	0 %	50 %	50 %	260763820
38	NC_013369	AG	3	6	22080	22085	50 %	0 %	50 %	0 %	260763821
39	NC_013369	TA	4	8	22203	22210	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
40	NC_013369	AT	3	6	22345	22350	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
41	NC_013369	AT	3	6	22406	22411	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
42	NC_013369	TA	4	8	23013	23020	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
43	NC_013369	AT	4	8	23059	23066	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
44	NC_013369	AT	4	8	23523	23530	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
45	NC_013369	AT	3	6	23770	23775	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
46	NC_013369	TA	3	6	24381	24386	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
47	NC_013369	CT	3	6	24403	24408	0 %	50 %	0 %	50 %	260763821
48	NC_013369	GT	3	6	24448	24453	0 %	50 %	50 %	0 %	260763821
49	NC_013369	AT	6	12	24492	24503	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
50	NC_013369	AT	3	6	24559	24564	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
51	NC_013369	TC	3	6	25403	25408	0 %	50 %	0 %	50 %	260763821
52	NC_013369	AT	4	8	25692	25699	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
53	NC_013369	TG	3	6	25706	25711	0 %	50 %	50 %	0 %	260763821
54	NC_013369	TA	3	6	25905	25910	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
55	NC_013369	TA	3	6	26485	26490	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
56	NC_013369	AT	4	8	26671	26678	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
57	NC_013369	TA	3	6	26716	26721	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
58	NC_013369	GA	3	6	27202	27207	50 %	0 %	50 %	0 %	260763821
59	NC_013369	CT	3	6	27654	27659	0 %	50 %	0 %	50 %	260763821
60	NC_013369	TA	4	8	27702	27709	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
61	NC_013369	TA	3	6	28327	28332	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
62	NC_013369	CT	3	6	28526	28531	0 %	50 %	0 %	50 %	260763821
63	NC_013369	AT	3	6	28535	28540	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
64	NC_013369	TA	3	6	28669	28674	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
65	NC_013369	AT	3	6	29415	29420	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
66	NC_013369	AT	3	6	30030	30035	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
67	NC_013369	TC	3	6	30143	30148	0 %	50 %	0 %	50 %	260763821
68	NC_013369	AT	3	6	30291	30296	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
69	NC_013369	TC	3	6	30398	30403	0 %	50 %	0 %	50 %	260763821
70	NC_013369	CT	4	8	30440	30447	0 %	50 %	0 %	50 %	260763821
71	NC_013369	TA	3	6	30667	30672	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
72	NC_013369	AT	3	6	30783	30788	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
73	NC_013369	TA	3	6	31206	31211	50 %	50 %	0 %	0 %	260763821
74	NC_013369	TG	3	6	39909	39914	0 %	50 %	50 %	0 %	260763824
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76	NC_013369	TG	3	6	40494	40499	0 %	50 %	50 %	0 %	260763824
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79	NC_013369	AT	3	6	45385	45390	50 %	50 %	0 %	0 %	260763827
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84	NC_013369	TG	3	6	47412	47417	0 %	50 %	50 %	0 %	260763829
85	NC_013369	TA	3	6	49025	49030	50 %	50 %	0 %	0 %	260763830
86	NC_013369	AT	3	6	49823	49828	50 %	50 %	0 %	0 %	260763830
87	NC_013369	TA	3	6	50537	50542	50 %	50 %	0 %	0 %	260763831
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91	NC_013369	TG	3	6	53701	53706	0 %	50 %	50 %	0 %	260763834
92	NC_013369	CA	3	6	55030	55035	50 %	0 %	0 %	50 %	260763836
93	NC_013369	GC	3	6	55620	55625	0 %	0 %	50 %	50 %	260763838
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104	NC_013369	AT	3	6	64849	64854	50 %	50 %	0 %	0 %	260763852
105	NC_013369	GT	3	6	65364	65369	0 %	50 %	50 %	0 %	260763852
106	NC_013369	AT	3	6	66748	66753	50 %	50 %	0 %	0 %	260763852
107	NC_013369	AT	3	6	67668	67673	50 %	50 %	0 %	0 %	260763853
108	NC_013369	AT	3	6	69389	69394	50 %	50 %	0 %	0 %	260763854
109	NC_013369	CT	3	6	69801	69806	0 %	50 %	0 %	50 %	260763854
110	NC_013369	TC	3	6	69819	69824	0 %	50 %	0 %	50 %	260763854
111	NC_013369	AG	3	6	71179	71184	50 %	0 %	50 %	0 %	260763855
112	NC_013369	CA	3	6	73687	73692	50 %	0 %	0 %	50 %	260763857
113	NC_013369	TG	3	6	74136	74141	0 %	50 %	50 %	0 %	260763857
114	NC_013369	TG	3	6	74423	74428	0 %	50 %	50 %	0 %	260763857
115	NC_013369	TG	3	6	74721	74726	0 %	50 %	50 %	0 %	260763857
116	NC_013369	AG	3	6	76092	76097	50 %	0 %	50 %	0 %	260763860
117	NC_013369	TC	3	6	78512	78517	0 %	50 %	0 %	50 %	260763861
118	NC_013369	AC	3	6	78540	78545	50 %	0 %	0 %	50 %	260763861
119	NC_013369	TC	3	6	79793	79798	0 %	50 %	0 %	50 %	260763862
120	NC_013369	AT	3	6	80058	80063	50 %	50 %	0 %	0 %	260763862
121	NC_013369	TA	3	6	80104	80109	50 %	50 %	0 %	0 %	260763862
122	NC_013369	CT	3	6	80165	80170	0 %	50 %	0 %	50 %	260763862
123	NC_013369	GA	3	6	80206	80211	50 %	0 %	50 %	0 %	260763862
124	NC_013369	CA	3	6	81313	81318	50 %	0 %	0 %	50 %	260763863
125	NC_013369	TA	3	6	81870	81875	50 %	50 %	0 %	0 %	260763864

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.