MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_5

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013368	GTC	2	6	97	102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751920
2	NC_013368	CAG	2	6	127	132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751920
3	NC_013368	TGA	2	6	150	155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751920
4	NC_013368	GCT	2	6	301	306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751922
5	NC_013368	AAC	2	6	324	329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751922
6	NC_013368	CCG	2	6	401	406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260751922
7	NC_013368	TGG	2	6	501	506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751922
8	NC_013368	GAT	2	6	575	580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751922
9	NC_013368	CTG	2	6	633	638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751923
10	NC_013368	AAT	2	6	1056	1061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751923
11	NC_013368	AGG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751923
12	NC_013368	GGT	2	6	1184	1189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751923
13	NC_013368	GAA	2	6	1299	1304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751923
14	NC_013368	AAC	2	6	1445	1450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751923
15	NC_013368	CGG	2	6	1510	1515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260751923
16	NC_013368	GCT	2	6	1524	1529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751923
17	NC_013368	GCG	2	6	1642	1647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260751923
18	NC_013368	AAC	2	6	1774	1779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751923
19	NC_013368	GAA	3	9	1791	1799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751923
20	NC_013368	GCA	2	6	1875	1880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751923
21	NC_013368	GCA	2	6	1929	1934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751923
22	NC_013368	CAG	2	6	1996	2001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751923
23	NC_013368	CAG	2	6	2055	2060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751923
24	NC_013368	TTG	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751924
25	NC_013368	TCA	2	6	2327	2332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751924
26	NC_013368	CGG	2	6	2558	2563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260751925
27	NC_013368	TGG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751925
28	NC_013368	GTG	2	6	3151	3156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751926
29	NC_013368	AGG	2	6	3167	3172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751926
30	NC_013368	TCA	2	6	3174	3179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751926
31	NC_013368	ATT	2	6	3264	3269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751926
32	NC_013368	ATT	2	6	3276	3281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751926
33	NC_013368	GTG	2	6	3394	3399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751926
34	NC_013368	GCT	2	6	3423	3428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751926
35	NC_013368	CAG	2	6	3538	3543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751926
36	NC_013368	TAA	2	6	3548	3553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751926
37	NC_013368	TAT	2	6	3611	3616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751926
38	NC_013368	GTC	2	6	3673	3678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751926
39	NC_013368	GAA	2	6	3792	3797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751926
40	NC_013368	TAA	2	6	3851	3856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751926
41	NC_013368	ATG	2	6	3859	3864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751926
42	NC_013368	GTG	2	6	3889	3894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751926
43	NC_013368	GAT	2	6	3978	3983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751926
44	NC_013368	CCT	2	6	4071	4076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260751926
45	NC_013368	ATG	2	6	4092	4097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751926
46	NC_013368	CTG	3	9	4195	4203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751926
47	NC_013368	AGA	2	6	4319	4324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751926
48	NC_013368	CGA	2	6	4429	4434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751926
49	NC_013368	CAG	2	6	4588	4593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751926
50	NC_013368	TAG	2	6	4594	4599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751926
51	NC_013368	ATC	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751926
52	NC_013368	ACG	2	6	4734	4739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751926
53	NC_013368	TGG	2	6	4760	4765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751926
54	NC_013368	TGC	2	6	4796	4801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751926
55	NC_013368	AAC	2	6	4870	4875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751926
56	NC_013368	GAG	2	6	4965	4970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751926
57	NC_013368	ATT	2	6	5185	5190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751927
58	NC_013368	GTT	2	6	5302	5307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751927
59	NC_013368	GCT	2	6	5312	5317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751927
60	NC_013368	TGA	2	6	5359	5364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751927
61	NC_013368	CAT	3	9	5592	5600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751928
62	NC_013368	GCA	2	6	5933	5938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751929
63	NC_013368	AGA	2	6	6010	6015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751929
64	NC_013368	AGG	2	6	6105	6110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751929
65	NC_013368	TGA	2	6	6131	6136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751929

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.