MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_4

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013367	CAG	2	6	121	126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751909
2	NC_013367	CGA	2	6	450	455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751909
3	NC_013367	CCT	2	6	664	669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260751909
4	NC_013367	AGC	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013367	TTG	2	6	975	980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013367	GGT	2	6	1030	1035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013367	CGC	2	6	1042	1047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_013367	GGT	2	6	1101	1106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013367	GGT	2	6	1154	1159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751910
10	NC_013367	CTT	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260751910
11	NC_013367	TCT	2	6	1383	1388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260751910
12	NC_013367	ATC	2	6	1596	1601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751911
13	NC_013367	CTG	2	6	1650	1655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751911
14	NC_013367	TGA	2	6	1729	1734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751911
15	NC_013367	CAT	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751911
16	NC_013367	CGT	2	6	2360	2365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751911
17	NC_013367	GCT	2	6	2533	2538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751911
18	NC_013367	TGA	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751911
19	NC_013367	CGC	2	6	2699	2704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260751911
20	NC_013367	GGA	2	6	2839	2844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751911
21	NC_013367	ACC	2	6	2907	2912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260751911
22	NC_013367	TTA	2	6	2943	2948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751911
23	NC_013367	ATG	2	6	2999	3004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751911
24	NC_013367	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751911
25	NC_013367	CGA	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751911
26	NC_013367	AAC	2	6	3366	3371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751911
27	NC_013367	TGT	2	6	3379	3384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751911
28	NC_013367	CAG	2	6	3403	3408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751911
29	NC_013367	TGT	2	6	3420	3425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751911
30	NC_013367	GGA	2	6	3439	3444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751911
31	NC_013367	AGG	2	6	3472	3477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260751911
32	NC_013367	ATG	2	6	3585	3590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751911
33	NC_013367	CAT	2	6	3644	3649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751911
34	NC_013367	GCT	2	6	3662	3667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751911
35	NC_013367	CAA	3	9	3761	3769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751911
36	NC_013367	CGC	2	6	3770	3775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260751911
37	NC_013367	CCT	2	6	3892	3897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_013367	TGG	2	6	4100	4105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751912
39	NC_013367	GGT	3	9	4125	4133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751912
40	NC_013367	GTG	2	6	4177	4182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751912
41	NC_013367	GGT	2	6	4209	4214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751912
42	NC_013367	GGT	2	6	4251	4256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751912
43	NC_013367	CAG	2	6	4282	4287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751912
44	NC_013367	ATG	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751912
45	NC_013367	GAT	2	6	4521	4526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751912
46	NC_013367	GTT	2	6	4590	4595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751912
47	NC_013367	GAT	2	6	4596	4601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751912
48	NC_013367	GTT	2	6	4629	4634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751912
49	NC_013367	GGT	2	6	4658	4663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751912
50	NC_013367	TAA	2	6	4739	4744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751912
51	NC_013367	CAG	2	6	4753	4758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751912
52	NC_013367	ATA	2	6	4786	4791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751912
53	NC_013367	GGT	2	6	4827	4832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751912
54	NC_013367	AAC	2	6	4927	4932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260751912
55	NC_013367	GAA	2	6	4941	4946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751912
56	NC_013367	CAG	2	6	4956	4961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751912
57	NC_013367	ATA	2	6	5251	5256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751912
58	NC_013367	TGC	3	9	5273	5281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751912
59	NC_013367	GAT	2	6	5448	5453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751912
60	NC_013367	CGA	2	6	5528	5533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751912
61	NC_013367	GAA	2	6	5553	5558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260751912
62	NC_013367	TAA	2	6	5600	5605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751912
63	NC_013367	TCA	2	6	5681	5686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751912
64	NC_013367	TGG	2	6	5708	5713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751912
65	NC_013367	CAT	2	6	5848	5853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751913
66	NC_013367	TGA	2	6	5866	5871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751913
67	NC_013367	GAT	2	6	5882	5887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751913
68	NC_013367	TTA	2	6	5941	5946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751913
69	NC_013367	TAA	2	6	5956	5961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751913
70	NC_013367	TTA	2	6	5982	5987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751913
71	NC_013367	GCT	2	6	6008	6013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751913
72	NC_013367	GTT	2	6	6057	6062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013367	CAA	2	6	6090	6095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013367	ATT	2	6	6123	6128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751914
75	NC_013367	CTT	2	6	6135	6140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260751914
76	NC_013367	ATT	2	6	6147	6152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751914
77	NC_013367	TCA	2	6	6210	6215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751914
78	NC_013367	TGT	2	6	6610	6615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260751916
79	NC_013367	GAC	2	6	6899	6904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260751917
80	NC_013367	GGT	2	6	6918	6923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260751917
81	NC_013367	TGA	2	6	6944	6949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751917
82	NC_013367	ATA	2	6	6988	6993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751917
83	NC_013367	AAT	2	6	6996	7001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751917
84	NC_013367	ATC	2	6	7054	7059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260751917
85	NC_013367	TAT	2	6	7306	7311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751918
86	NC_013367	GCT	2	6	7372	7377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260751918
87	NC_013367	GTT	2	6	7421	7426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013367	CAA	2	6	7454	7459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013367	ATT	2	6	7487	7492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013367	CTT	2	6	7499	7504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013367	ATT	2	6	7511	7516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013367	TCA	2	6	7574	7579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.