MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_3

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013366	ATTTTA	2	12	485	496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260751836
2	NC_013366	TTCTGT	2	12	6923	6934	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	260751839
3	NC_013366	GTCTTC	2	12	8697	8708	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	260751841
4	NC_013366	AGGTGC	2	12	8978	8989	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260751841
5	NC_013366	AGCCGC	2	12	17596	17607	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260751852
6	NC_013366	GTCCTT	2	12	18639	18650	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	260751855
7	NC_013366	GGATTA	2	12	19729	19740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260751855
8	NC_013366	CAGAGT	2	12	20010	20021	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260751855
9	NC_013366	TTCTGC	2	12	22660	22671	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	260751856
10	NC_013366	GCAGAA	2	12	26266	26277	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	260751860
11	NC_013366	CTGCTA	13	78	35161	35238	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260751869
12	NC_013366	ACTCAG	2	12	36259	36270	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260751871
13	NC_013366	TCAGCC	2	12	36297	36308	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260751871
14	NC_013366	GGCGCT	2	12	37376	37387	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260751873
15	NC_013366	CAGGTG	2	12	37407	37418	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260751873
16	NC_013366	GTGGCG	2	12	37497	37508	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260751873
17	NC_013366	GCCGGA	2	12	37748	37759	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260751873
18	NC_013366	CACTGG	2	12	39142	39153	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260751874
19	NC_013366	TGGCAG	2	12	39818	39829	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260751875
20	NC_013366	ACAGTT	2	12	50988	50999	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	260751890
21	NC_013366	ATGTGG	2	12	60772	60783	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	260751896
22	NC_013366	TGGGGC	2	12	61078	61089	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260751896
23	NC_013366	TGGGGA	2	12	63586	63597	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	260751897
24	NC_013366	GCACCT	2	12	67055	67066	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260751901
25	NC_013366	GAAGAC	2	12	67336	67347	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	260751901
26	NC_013366	TCCTGC	2	12	72888	72899	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260751905

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.