MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_3

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013366	TGTTA	2	10	4470	4479	20 %	60 %	20 %	0 %	260751838
2	NC_013366	CAGGT	2	10	4813	4822	20 %	20 %	40 %	20 %	260751838
3	NC_013366	AGAAC	2	10	5521	5530	60 %	0 %	20 %	20 %	260751838
4	NC_013366	TCTCT	2	10	5898	5907	0 %	60 %	0 %	40 %	260751839
5	NC_013366	CAGAA	2	10	6285	6294	60 %	0 %	20 %	20 %	260751839
6	NC_013366	CCATT	2	10	7436	7445	20 %	40 %	0 %	40 %	260751840
7	NC_013366	ACATC	2	10	7604	7613	40 %	20 %	0 %	40 %	260751840
8	NC_013366	CCGGG	2	10	11776	11785	0 %	0 %	60 %	40 %	260751844
9	NC_013366	AAAAC	2	10	11972	11981	80 %	0 %	0 %	20 %	260751845
10	NC_013366	GCCCC	2	10	14956	14965	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11	NC_013366	AAATC	2	10	15491	15500	60 %	20 %	0 %	20 %	260751850
12	NC_013366	AAGAC	2	10	21184	21193	60 %	0 %	20 %	20 %	260751855
13	NC_013366	AATAA	2	10	27457	27466	80 %	20 %	0 %	0 %	260751862
14	NC_013366	CATTA	2	10	27688	27697	40 %	40 %	0 %	20 %	260751862
15	NC_013366	GCCAG	2	10	28077	28086	20 %	0 %	40 %	40 %	260751862
16	NC_013366	GGCAC	2	10	30558	30567	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_013366	TGTAC	2	10	31082	31091	20 %	40 %	20 %	20 %	260751865
18	NC_013366	GGAAG	2	10	31759	31768	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013366	TTATG	2	10	31839	31848	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013366	CCGGG	2	10	33212	33221	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_013366	CCGCC	2	10	38754	38763	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
22	NC_013366	ACTGA	2	10	38802	38811	40 %	20 %	20 %	20 %	260751874
23	NC_013366	CATTC	2	10	39690	39699	20 %	40 %	0 %	40 %	260751875
24	NC_013366	ATCAC	2	10	40618	40627	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_013366	TTTAT	2	10	43724	43733	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013366	CAGGG	2	10	45280	45289	20 %	0 %	60 %	20 %	260751883
27	NC_013366	CCGTG	2	10	47439	47448	0 %	20 %	40 %	40 %	260751887
28	NC_013366	GCCCG	2	10	47954	47963	0 %	0 %	40 %	60 %	260751888
29	NC_013366	AAATG	2	10	49382	49391	60 %	20 %	20 %	0 %	260751889
30	NC_013366	GCTGG	2	10	50392	50401	0 %	20 %	60 %	20 %	260751890
31	NC_013366	GCAGT	2	10	53306	53315	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013366	CACGG	2	10	56434	56443	20 %	0 %	40 %	40 %	260751895
33	NC_013366	GTGCT	2	10	56885	56894	0 %	40 %	40 %	20 %	260751895
34	NC_013366	GACCT	2	10	58257	58266	20 %	20 %	20 %	40 %	260751896
35	NC_013366	ACCGG	2	10	62435	62444	20 %	0 %	40 %	40 %	260751896
36	NC_013366	GCCGT	2	10	62506	62515	0 %	20 %	40 %	40 %	260751896
37	NC_013366	ACCTG	2	10	63044	63053	20 %	20 %	20 %	40 %	260751896
38	NC_013366	TCTGG	2	10	63381	63390	0 %	40 %	40 %	20 %	260751897
39	NC_013366	TACCA	2	10	71565	71574	40 %	20 %	0 %	40 %	260751904
40	NC_013366	ATACA	2	10	71772	71781	60 %	20 %	0 %	20 %	260751904
41	NC_013366	TATAA	2	10	77494	77503	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.