MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_3

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013366	AAAC	2	8	7203	7210	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013366	GCGG	2	8	10668	10675	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013366	GGAA	2	8	10993	11000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013366	TCAT	2	8	11937	11944	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013366	TAAT	2	8	12186	12193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013366	TGGC	2	8	13365	13372	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013366	CATT	2	8	14770	14777	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013366	GACA	2	8	14811	14818	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013366	CCCT	2	8	14933	14940	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_013366	CTGC	2	8	15755	15762	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013366	TCCG	2	8	17083	17090	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013366	CCTC	2	8	24832	24839	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_013366	TTAC	2	8	26651	26658	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013366	CTGC	2	8	28684	28691	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013366	TCCG	2	8	30012	30019	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013366	ACGG	2	8	31038	31045	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013366	TTTC	2	8	31831	31838	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013366	ATTT	2	8	32519	32526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013366	GTCA	2	8	32558	32565	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013366	CGCT	2	8	33270	33277	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013366	CCCG	2	8	33382	33389	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_013366	GAAG	2	8	33758	33765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013366	CAGT	2	8	34424	34431	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013366	GTCT	2	8	34856	34863	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013366	GGCG	2	8	40394	40401	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013366	CAGT	2	8	42742	42749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013366	ATTA	2	8	42831	42838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013366	ATTA	2	8	44213	44220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013366	CCGC	2	8	50167	50174	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_013366	GGAG	2	8	50208	50215	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013366	GGCA	2	8	52887	52894	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013366	GATG	2	8	53049	53056	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013366	TCAG	2	8	53207	53214	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013366	AGAC	2	8	54192	54199	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013366	AAGA	2	8	54331	54338	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013366	GAAA	2	8	55680	55687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013366	AAAT	2	8	55690	55697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013366	AAAT	2	8	55721	55728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013366	GACT	2	8	55835	55842	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013366	TGGT	2	8	68295	68302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013366	CTGA	2	8	68330	68337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013366	TTAC	2	8	71236	71243	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013366	CAGC	2	8	73756	73763	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013366	GCAG	2	8	73921	73928	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013366	TTAT	2	8	74023	74030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013366	ATTT	2	8	74091	74098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013366	ATTT	2	8	74121	74128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013366	ATTT	2	8	74513	74520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013366	CTGC	2	8	74906	74913	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013366	TCCG	2	8	76234	76241	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013366	GTAA	2	8	77182	77189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013366	ATCA	2	8	77477	77484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013366	TTAT	2	8	77674	77681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.