MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_3

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013366	CT	3	6	131	136	0 %	50 %	0 %	50 %	260751836
2	NC_013366	AT	3	6	204	209	50 %	50 %	0 %	0 %	260751836
3	NC_013366	TA	3	6	305	310	50 %	50 %	0 %	0 %	260751836
4	NC_013366	TC	3	6	910	915	0 %	50 %	0 %	50 %	260751837
5	NC_013366	AT	3	6	1342	1347	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
6	NC_013366	CT	3	6	1840	1845	0 %	50 %	0 %	50 %	260751837
7	NC_013366	AT	3	6	1981	1986	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
8	NC_013366	AT	3	6	2173	2178	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
9	NC_013366	TA	3	6	2462	2467	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
10	NC_013366	AT	3	6	2682	2687	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
11	NC_013366	TA	3	6	2765	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
12	NC_013366	AG	3	6	3114	3119	50 %	0 %	50 %	0 %	260751837
13	NC_013366	GA	3	6	3276	3281	50 %	0 %	50 %	0 %	260751837
14	NC_013366	TA	3	6	3326	3331	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
15	NC_013366	TA	3	6	3453	3458	50 %	50 %	0 %	0 %	260751837
16	NC_013366	CA	3	6	3481	3486	50 %	0 %	0 %	50 %	260751837
17	NC_013366	CA	4	8	3672	3679	50 %	0 %	0 %	50 %	260751838
18	NC_013366	TA	3	6	3813	3818	50 %	50 %	0 %	0 %	260751838
19	NC_013366	TC	3	6	4210	4215	0 %	50 %	0 %	50 %	260751838
20	NC_013366	GA	3	6	4309	4314	50 %	0 %	50 %	0 %	260751838
21	NC_013366	GA	3	6	4771	4776	50 %	0 %	50 %	0 %	260751838
22	NC_013366	TA	3	6	5118	5123	50 %	50 %	0 %	0 %	260751838
23	NC_013366	CA	3	6	5545	5550	50 %	0 %	0 %	50 %	260751838
24	NC_013366	CA	3	6	5618	5623	50 %	0 %	0 %	50 %	260751838
25	NC_013366	CA	3	6	5766	5771	50 %	0 %	0 %	50 %	260751839
26	NC_013366	GA	3	6	5786	5791	50 %	0 %	50 %	0 %	260751839
27	NC_013366	TA	3	6	7128	7133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013366	CT	3	6	7491	7496	0 %	50 %	0 %	50 %	260751840
29	NC_013366	CT	3	6	9255	9260	0 %	50 %	0 %	50 %	260751841
30	NC_013366	CT	3	6	10057	10062	0 %	50 %	0 %	50 %	260751842
31	NC_013366	GT	3	6	11394	11399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013366	AT	3	6	11467	11472	50 %	50 %	0 %	0 %	260751844
33	NC_013366	TG	3	6	11508	11513	0 %	50 %	50 %	0 %	260751844
34	NC_013366	AG	3	6	13131	13136	50 %	0 %	50 %	0 %	260751847
35	NC_013366	GC	3	6	13145	13150	0 %	0 %	50 %	50 %	260751847
36	NC_013366	TG	3	6	13218	13223	0 %	50 %	50 %	0 %	260751847
37	NC_013366	GC	3	6	14103	14108	0 %	0 %	50 %	50 %	260751848
38	NC_013366	CA	3	6	14875	14880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013366	CG	3	6	15325	15330	0 %	0 %	50 %	50 %	260751849
40	NC_013366	TG	3	6	15457	15462	0 %	50 %	50 %	0 %	260751850
41	NC_013366	TG	3	6	16332	16337	0 %	50 %	50 %	0 %	260751851
42	NC_013366	TG	3	6	16619	16624	0 %	50 %	50 %	0 %	260751851
43	NC_013366	TG	3	6	16917	16922	0 %	50 %	50 %	0 %	260751851
44	NC_013366	CA	3	6	18061	18066	50 %	0 %	0 %	50 %	260751854
45	NC_013366	TC	4	8	18259	18266	0 %	50 %	0 %	50 %	260751854
46	NC_013366	GT	4	8	18973	18980	0 %	50 %	50 %	0 %	260751855
47	NC_013366	TC	3	6	19274	19279	0 %	50 %	0 %	50 %	260751855
48	NC_013366	AG	3	6	19746	19751	50 %	0 %	50 %	0 %	260751855
49	NC_013366	TA	3	6	20817	20822	50 %	50 %	0 %	0 %	260751855
50	NC_013366	GA	3	6	21974	21979	50 %	0 %	50 %	0 %	260751855
51	NC_013366	AG	3	6	22276	22281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013366	AT	3	6	22902	22907	50 %	50 %	0 %	0 %	260751856
53	NC_013366	GC	3	6	23239	23244	0 %	0 %	50 %	50 %	260751856
54	NC_013366	TC	4	8	23343	23350	0 %	50 %	0 %	50 %	260751856
55	NC_013366	CA	3	6	23680	23685	50 %	0 %	0 %	50 %	260751857
56	NC_013366	AT	3	6	24389	24394	50 %	50 %	0 %	0 %	260751858
57	NC_013366	AG	4	8	25586	25593	50 %	0 %	50 %	0 %	260751860
58	NC_013366	GC	3	6	26503	26508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013366	CT	3	6	26838	26843	0 %	50 %	0 %	50 %	260751861
60	NC_013366	AC	3	6	26881	26886	50 %	0 %	0 %	50 %	260751861
61	NC_013366	GA	3	6	27068	27073	50 %	0 %	50 %	0 %	260751861
62	NC_013366	TG	3	6	29261	29266	0 %	50 %	50 %	0 %	260751863
63	NC_013366	TG	3	6	29548	29553	0 %	50 %	50 %	0 %	260751863
64	NC_013366	TG	3	6	29846	29851	0 %	50 %	50 %	0 %	260751863
65	NC_013366	CG	3	6	33071	33076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013366	GA	3	6	33246	33251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013366	GC	3	6	34454	34459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013366	TG	3	6	34645	34650	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013366	CG	3	6	34923	34928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013366	CG	3	6	35036	35041	0 %	0 %	50 %	50 %	260751869
71	NC_013366	GC	3	6	36131	36136	0 %	0 %	50 %	50 %	260751871
72	NC_013366	GA	3	6	36480	36485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013366	AG	3	6	36724	36729	50 %	0 %	50 %	0 %	260751872
74	NC_013366	CG	3	6	36738	36743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013366	CG	3	6	37400	37405	0 %	0 %	50 %	50 %	260751873
76	NC_013366	TG	3	6	37955	37960	0 %	50 %	50 %	0 %	260751873
77	NC_013366	TG	3	6	38677	38682	0 %	50 %	50 %	0 %	260751873
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80	NC_013366	AG	3	6	39875	39880	50 %	0 %	50 %	0 %	260751875
81	NC_013366	TG	3	6	40103	40108	0 %	50 %	50 %	0 %	260751876
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83	NC_013366	GT	3	6	40268	40273	0 %	50 %	50 %	0 %	260751877
84	NC_013366	CG	3	6	40560	40565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013366	AG	4	8	41287	41294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013366	TC	3	6	41610	41615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013366	TA	4	8	42704	42711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013366	TG	4	8	42772	42779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013366	CT	3	6	43507	43512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_013366	GT	3	6	43638	43643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013366	TC	3	6	44019	44024	0 %	50 %	0 %	50 %	260751881
92	NC_013366	TC	3	6	44274	44279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013366	AG	3	6	44521	44526	50 %	0 %	50 %	0 %	260751882
94	NC_013366	TA	3	6	44818	44823	50 %	50 %	0 %	0 %	260751882
95	NC_013366	CT	3	6	46329	46334	0 %	50 %	0 %	50 %	260751886
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102	NC_013366	AC	3	6	49735	49740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013366	AC	3	6	50892	50897	50 %	0 %	0 %	50 %	260751890
104	NC_013366	TC	4	8	52155	52162	0 %	50 %	0 %	50 %	260751891
105	NC_013366	GT	3	6	52838	52843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013366	CA	3	6	53022	53027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013366	CT	3	6	54408	54413	0 %	50 %	0 %	50 %	260751893
108	NC_013366	AT	3	6	54547	54552	50 %	50 %	0 %	0 %	260751893
109	NC_013366	AT	3	6	54683	54688	50 %	50 %	0 %	0 %	260751893
110	NC_013366	TC	3	6	54812	54817	0 %	50 %	0 %	50 %	260751893
111	NC_013366	AT	3	6	56160	56165	50 %	50 %	0 %	0 %	260751895
112	NC_013366	AC	3	6	56780	56785	50 %	0 %	0 %	50 %	260751895
113	NC_013366	GT	3	6	57119	57124	0 %	50 %	50 %	0 %	260751895
114	NC_013366	AC	3	6	58484	58489	50 %	0 %	0 %	50 %	260751896
115	NC_013366	AG	3	6	59801	59806	50 %	0 %	50 %	0 %	260751896
116	NC_013366	CA	3	6	60392	60397	50 %	0 %	0 %	50 %	260751896
117	NC_013366	GA	3	6	60891	60896	50 %	0 %	50 %	0 %	260751896
118	NC_013366	CA	3	6	61013	61018	50 %	0 %	0 %	50 %	260751896
119	NC_013366	CT	3	6	64133	64138	0 %	50 %	0 %	50 %	260751898
120	NC_013366	AG	3	6	64753	64758	50 %	0 %	50 %	0 %	260751898
121	NC_013366	AC	3	6	65346	65351	50 %	0 %	0 %	50 %	260751899
122	NC_013366	TG	3	6	65475	65480	0 %	50 %	50 %	0 %	260751899
123	NC_013366	AG	3	6	65982	65987	50 %	0 %	50 %	0 %	260751900
124	NC_013366	AG	3	6	66784	66789	50 %	0 %	50 %	0 %	260751901
125	NC_013366	GT	3	6	68355	68360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013366	TC	3	6	69210	69215	0 %	50 %	0 %	50 %	260751902
127	NC_013366	AC	3	6	69238	69243	50 %	0 %	0 %	50 %	260751902
128	NC_013366	TC	3	6	70491	70496	0 %	50 %	0 %	50 %	260751903
129	NC_013366	AT	3	6	70756	70761	50 %	50 %	0 %	0 %	260751903
130	NC_013366	TA	3	6	70802	70807	50 %	50 %	0 %	0 %	260751903
131	NC_013366	CT	3	6	70863	70868	0 %	50 %	0 %	50 %	260751903
132	NC_013366	GA	3	6	70904	70909	50 %	0 %	50 %	0 %	260751903
133	NC_013366	CA	3	6	72011	72016	50 %	0 %	0 %	50 %	260751904
134	NC_013366	TA	3	6	72568	72573	50 %	50 %	0 %	0 %	260751905
135	NC_013366	CA	3	6	73286	73291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013366	GA	3	6	73469	73474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013366	GT	3	6	74830	74835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013366	TG	3	6	75483	75488	0 %	50 %	50 %	0 %	260751907
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143	NC_013366	AG	3	6	77243	77248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013366	AT	3	6	77537	77542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013366	GA	3	6	77570	77575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013366	TA	3	6	77642	77647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.