MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_1

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013365	TTTTG	2	10	11828	11837	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013365	ATCAG	2	10	12062	12071	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013365	ATGCG	2	10	12278	12287	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013365	TAATC	2	10	13221	13230	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013365	AAGAA	2	10	13679	13688	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013365	CCCGG	2	10	23324	23333	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_013365	ATGGT	2	10	24826	24835	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013365	GAAGC	2	10	27264	27273	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013365	CAATA	2	10	35841	35850	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013365	CAAGA	2	10	36323	36332	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013365	GTACT	2	10	60233	60242	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013365	ATCCT	2	10	69752	69761	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_013365	ATTTT	2	10	76530	76539	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013365	GAATT	2	10	79380	79389	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013365	TTAAG	2	10	91326	91335	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013365	TTACC	2	10	98207	98216	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_013365	ATCCA	2	10	99664	99673	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_013365	CCGTC	2	10	106078	106087	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_013365	TTAAA	2	10	113538	113547	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013365	GCCAA	2	10	116149	116158	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_013365	GCATC	2	10	116640	116649	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_013365	CGCGC	2	10	117819	117828	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_013365	CCCTG	2	10	118991	119000	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_013365	TTCTC	2	10	121519	121528	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_013365	ATATA	2	10	123619	123628	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013365	AATTC	2	10	145705	145714	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013365	GTTCC	2	10	159012	159021	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_013365	CTCTC	2	10	165447	165456	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_013365	GTTTC	2	10	186246	186255	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013365	ACCCT	2	10	193565	193574	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_013365	TTTAA	2	10	201877	201886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013365	TTGAA	2	10	204502	204511	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.