MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_1

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013365	TTCG	2	8	1027	1034	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013365	TGCT	2	8	1056	1063	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013365	TCAT	2	8	1108	1115	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013365	TGAA	2	8	1750	1757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013365	TGAA	2	8	1793	1800	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013365	CTGG	2	8	1985	1992	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013365	TTAA	2	8	2051	2058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013365	GAAA	2	8	2166	2173	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013365	TGCC	2	8	11886	11893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013365	TGAA	2	8	11998	12005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013365	AACC	2	8	12093	12100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013365	GGGT	2	8	12103	12110	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013365	TAAG	2	8	12332	12339	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013365	ATTG	2	8	13102	13109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013365	TTTA	2	8	16128	16135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013365	TAAA	2	8	19295	19302	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013365	TTTG	2	8	21379	21386	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013365	ATGT	2	8	21391	21398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013365	TTAT	2	8	21473	21480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013365	CTGA	2	8	21634	21641	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013365	TGCC	2	8	23304	23311	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013365	CGAT	2	8	23817	23824	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013365	AAGT	2	8	23838	23845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013365	GATA	2	8	24520	24527	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013365	CAAC	2	8	24680	24687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013365	GACA	2	8	27230	27237	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013365	CAAA	2	8	28571	28578	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013365	GAAA	2	8	28947	28954	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013365	ATTT	2	8	31103	31110	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013365	CTGC	2	8	31295	31302	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013365	TTGG	2	8	35565	35572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013365	TGCC	2	8	35769	35776	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013365	TGTC	2	8	37820	37827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013365	CGCT	2	8	37871	37878	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013365	CAAT	2	8	37892	37899	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013365	GCTG	2	8	37941	37948	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013365	AGCA	2	8	38015	38022	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013365	CGGC	2	8	40445	40452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013365	TCAA	2	8	40454	40461	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013365	CCAA	2	8	40783	40790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013365	CTAA	2	8	40867	40874	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013365	TGAA	2	8	43135	43142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013365	TTTA	2	8	45098	45105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013365	TAAC	2	8	45322	45329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013365	ATGA	2	8	45410	45417	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013365	TTCC	2	8	45451	45458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013365	GCGG	2	8	47868	47875	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013365	TTTA	2	8	54243	54250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013365	TGCT	2	8	54326	54333	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013365	CGGT	2	8	54365	54372	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013365	CCAC	2	8	59072	59079	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_013365	GTAA	2	8	61730	61737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013365	CCTG	2	8	62789	62796	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013365	TTTA	2	8	66734	66741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013365	AAAT	2	8	66906	66913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013365	TTTA	2	8	67358	67365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013365	TAAT	2	8	68253	68260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013365	ATCC	2	8	68651	68658	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013365	TCCC	2	8	69673	69680	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_013365	GTAT	2	8	70938	70945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013365	GTCG	2	8	73324	73331	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013365	AAAC	2	8	75964	75971	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013365	GGTG	2	8	76719	76726	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013365	GCTG	2	8	77790	77797	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013365	TTCC	2	8	78515	78522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013365	ATCA	2	8	80283	80290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013365	GTCT	2	8	80393	80400	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013365	TTTA	2	8	81561	81568	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013365	CTCA	2	8	84148	84155	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013365	ATTT	2	8	90450	90457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013365	TTGA	2	8	90808	90815	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013365	CTTT	2	8	90893	90900	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013365	TCCT	2	8	90973	90980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013365	AATT	2	8	92850	92857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013365	TGTT	2	8	94594	94601	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013365	CTAT	2	8	98007	98014	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013365	TTTA	2	8	98015	98022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013365	CCAA	2	8	98253	98260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013365	CCTT	2	8	103049	103056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013365	GTTC	2	8	103098	103105	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013365	AATC	2	8	113560	113567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013365	GAGC	2	8	115815	115822	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013365	GCCC	2	8	115971	115978	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84	NC_013365	GGCA	2	8	116201	116208	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013365	CGCC	2	8	116717	116724	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_013365	ACCG	2	8	116802	116809	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013365	GGAC	2	8	117540	117547	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013365	GGAC	2	8	117616	117623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_013365	ATTT	2	8	119937	119944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013365	TATT	2	8	119973	119980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013365	CTTT	2	8	121550	121557	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013365	AGTG	2	8	121827	121834	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013365	CCGG	2	8	123664	123671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013365	TTAA	2	8	125693	125700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013365	GAAT	2	8	125761	125768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013365	TTTG	2	8	129687	129694	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013365	TGAA	2	8	131085	131092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013365	GGAA	2	8	132951	132958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013365	GTTA	2	8	133801	133808	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013365	ACCA	2	8	134512	134519	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013365	GCAA	2	8	137678	137685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013365	CAGC	2	8	137756	137763	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013365	GATT	2	8	145756	145763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013365	AAGT	2	8	146027	146034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013365	TCAC	2	8	146092	146099	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013365	TAGA	2	8	147916	147923	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013365	TCAC	2	8	148050	148057	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013365	TTTC	2	8	159112	159119	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_013365	TTTC	2	8	159711	159718	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013365	GTCA	2	8	162246	162253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013365	CCTT	2	8	163469	163476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013365	TCCG	2	8	163594	163601	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013365	GCCA	2	8	164098	164105	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013365	GGGC	2	8	165646	165653	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013365	GAAT	2	8	166721	166728	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013365	TGGC	2	8	166750	166757	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013365	AGAA	2	8	166795	166802	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013365	TCAG	2	8	167056	167063	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013365	AGTC	2	8	167302	167309	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013365	GGAC	2	8	168270	168277	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013365	AGCC	2	8	168292	168299	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013365	ACAG	2	8	169765	169772	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013365	GTAT	2	8	170406	170413	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013365	CTTA	2	8	173968	173975	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013365	TTAA	2	8	176629	176636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013365	AATA	2	8	176666	176673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013365	TTAA	2	8	178009	178016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013365	CTGT	2	8	178026	178033	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013365	AAAT	2	8	178155	178162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013365	CATT	2	8	178961	178968	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013365	TTTC	2	8	178973	178980	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013365	GAAT	2	8	178986	178993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013365	ATTA	2	8	178994	179001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013365	TAAA	2	8	180884	180891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013365	GAAC	2	8	181453	181460	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013365	AGGA	2	8	181479	181486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013365	AAGT	2	8	182198	182205	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013365	CTTT	2	8	183105	183112	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013365	AATT	2	8	183145	183152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013365	TGGC	2	8	184869	184876	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_013365	GCCC	2	8	185785	185792	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_013365	CCGA	2	8	189897	189904	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_013365	ATCC	2	8	190845	190852	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013365	CCTG	2	8	191846	191853	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_013365	GTGG	2	8	191858	191865	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013365	GAGT	2	8	193147	193154	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013365	CATC	2	8	193303	193310	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_013365	AGGG	2	8	196312	196319	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013365	GCTC	2	8	198553	198560	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013365	TAAT	2	8	201857	201864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013365	AAAT	2	8	201917	201924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013365	GTGA	2	8	201985	201992	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013365	AATT	2	8	204137	204144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013365	GATT	2	8	204245	204252	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_013365	TTGA	2	8	204477	204484	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.