MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_1

Total Repeats: 423

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013365	TTTC	2	8	446	453	0 %	75 %	0 %	25 %	260752013
2	NC_013365	TGAT	2	8	506	513	25 %	50 %	25 %	0 %	260752013
3	NC_013365	CTTA	2	8	585	592	25 %	50 %	0 %	25 %	260752013
4	NC_013365	TGCC	2	8	662	669	0 %	25 %	25 %	50 %	260752013
5	NC_013365	TGAA	2	8	1619	1626	50 %	25 %	25 %	0 %	260752014
6	NC_013365	TTGG	2	8	1647	1654	0 %	50 %	50 %	0 %	260752014
7	NC_013365	ATGA	2	8	1666	1673	50 %	25 %	25 %	0 %	260752014
8	NC_013365	TTTG	2	8	1690	1697	0 %	75 %	25 %	0 %	260752014
9	NC_013365	CATA	2	8	2662	2669	50 %	25 %	0 %	25 %	260752016
10	NC_013365	AATA	2	8	2685	2692	75 %	25 %	0 %	0 %	260752016
11	NC_013365	CATT	2	8	2992	2999	25 %	50 %	0 %	25 %	260752017
12	NC_013365	CGAT	2	8	3493	3500	25 %	25 %	25 %	25 %	260752017
13	NC_013365	GTCG	2	8	5208	5215	0 %	25 %	50 %	25 %	260752019
14	NC_013365	ATTG	2	8	5484	5491	25 %	50 %	25 %	0 %	260752020
15	NC_013365	TCAA	2	8	5502	5509	50 %	25 %	0 %	25 %	260752020
16	NC_013365	GCGT	2	8	6330	6337	0 %	25 %	50 %	25 %	260752020
17	NC_013365	GAGT	2	8	6818	6825	25 %	25 %	50 %	0 %	260752021
18	NC_013365	AACT	2	8	7106	7113	50 %	25 %	0 %	25 %	260752021
19	NC_013365	AAAG	2	8	7275	7282	75 %	0 %	25 %	0 %	260752021
20	NC_013365	GACG	2	8	7557	7564	25 %	0 %	50 %	25 %	260752022
21	NC_013365	GCTG	2	8	8009	8016	0 %	25 %	50 %	25 %	260752022
22	NC_013365	TGAA	2	8	9483	9490	50 %	25 %	25 %	0 %	260752024
23	NC_013365	CTTC	2	8	9572	9579	0 %	50 %	0 %	50 %	260752024
24	NC_013365	AACA	2	8	10046	10053	75 %	0 %	0 %	25 %	260752024
25	NC_013365	AAGA	2	8	11255	11262	75 %	0 %	25 %	0 %	260752024
26	NC_013365	TCCG	2	8	11307	11314	0 %	25 %	25 %	50 %	260752024
27	NC_013365	TAGA	2	8	11658	11665	50 %	25 %	25 %	0 %	260752024
28	NC_013365	GAAT	2	8	13816	13823	50 %	25 %	25 %	0 %	260752025
29	NC_013365	TGGT	2	8	14050	14057	0 %	50 %	50 %	0 %	260752025
30	NC_013365	ATTT	2	8	15759	15766	25 %	75 %	0 %	0 %	260752026
31	NC_013365	AATT	2	8	16017	16024	50 %	50 %	0 %	0 %	260752026
32	NC_013365	CAGA	2	8	16285	16292	50 %	0 %	25 %	25 %	260752027
33	NC_013365	AGTA	2	8	16541	16548	50 %	25 %	25 %	0 %	260752027
34	NC_013365	TTTG	2	8	16701	16708	0 %	75 %	25 %	0 %	260752028
35	NC_013365	ACGA	2	8	17292	17299	50 %	0 %	25 %	25 %	260752029
36	NC_013365	TGGA	2	8	17947	17954	25 %	25 %	50 %	0 %	260752029
37	NC_013365	CGCC	2	8	18593	18600	0 %	0 %	25 %	75 %	260752030
38	NC_013365	TTTA	2	8	18655	18662	25 %	75 %	0 %	0 %	260752030
39	NC_013365	AGAA	2	8	18887	18894	75 %	0 %	25 %	0 %	260752030
40	NC_013365	TCAG	2	8	19698	19705	25 %	25 %	25 %	25 %	260752031
41	NC_013365	ACTG	2	8	20861	20868	25 %	25 %	25 %	25 %	260752032
42	NC_013365	AAGT	2	8	21072	21079	50 %	25 %	25 %	0 %	260752032
43	NC_013365	TTCA	2	8	21741	21748	25 %	50 %	0 %	25 %	260752033
44	NC_013365	TGGT	2	8	22121	22128	0 %	50 %	50 %	0 %	260752034
45	NC_013365	GGAA	2	8	22425	22432	50 %	0 %	50 %	0 %	260752034
46	NC_013365	ATGG	2	8	22705	22712	25 %	25 %	50 %	0 %	260752035
47	NC_013365	CCAC	2	8	25349	25356	25 %	0 %	0 %	75 %	260752036
48	NC_013365	GATG	2	8	25556	25563	25 %	25 %	50 %	0 %	260752036
49	NC_013365	GACG	2	8	25570	25577	25 %	0 %	50 %	25 %	260752036
50	NC_013365	GTAA	2	8	25716	25723	50 %	25 %	25 %	0 %	260752036
51	NC_013365	CCAC	2	8	25730	25737	25 %	0 %	0 %	75 %	260752036
52	NC_013365	TTCC	2	8	25895	25902	0 %	50 %	0 %	50 %	260752036
53	NC_013365	ATAC	2	8	29091	29098	50 %	25 %	0 %	25 %	260752038
54	NC_013365	GATC	2	8	29241	29248	25 %	25 %	25 %	25 %	260752038
55	NC_013365	TCAG	2	8	29838	29845	25 %	25 %	25 %	25 %	260752039
56	NC_013365	CAAA	2	8	29846	29853	75 %	0 %	0 %	25 %	260752039
57	NC_013365	GCAG	2	8	29890	29897	25 %	0 %	50 %	25 %	260752039
58	NC_013365	CAGT	2	8	30046	30053	25 %	25 %	25 %	25 %	260752039
59	NC_013365	ATGG	2	8	30891	30898	25 %	25 %	50 %	0 %	260752039
60	NC_013365	ATCG	2	8	32675	32682	25 %	25 %	25 %	25 %	260752041
61	NC_013365	ACAA	2	8	33125	33132	75 %	0 %	0 %	25 %	260752041
62	NC_013365	AAGA	2	8	33180	33187	75 %	0 %	25 %	0 %	260752041
63	NC_013365	TCCA	2	8	33358	33365	25 %	25 %	0 %	50 %	260752041
64	NC_013365	ATTC	2	8	33733	33740	25 %	50 %	0 %	25 %	260752041
65	NC_013365	AAAC	2	8	33853	33860	75 %	0 %	0 %	25 %	260752041
66	NC_013365	GGTT	2	8	34053	34060	0 %	50 %	50 %	0 %	260752041
67	NC_013365	GATT	2	8	35180	35187	25 %	50 %	25 %	0 %	260752041
68	NC_013365	AGAA	2	8	35309	35316	75 %	0 %	25 %	0 %	260752041
69	NC_013365	CCAC	2	8	36559	36566	25 %	0 %	0 %	75 %	260752042
70	NC_013365	ATAC	2	8	36739	36746	50 %	25 %	0 %	25 %	260752042
71	NC_013365	GTAA	2	8	36926	36933	50 %	25 %	25 %	0 %	260752042
72	NC_013365	CCAC	2	8	36940	36947	25 %	0 %	0 %	75 %	260752042
73	NC_013365	TCTT	2	8	37182	37189	0 %	75 %	0 %	25 %	260752042
74	NC_013365	GACT	2	8	38128	38135	25 %	25 %	25 %	25 %	260752044
75	NC_013365	AAGC	2	8	38469	38476	50 %	0 %	25 %	25 %	260752044
76	NC_013365	TTGA	2	8	38694	38701	25 %	50 %	25 %	0 %	260752044
77	NC_013365	GTCA	2	8	39033	39040	25 %	25 %	25 %	25 %	260752044
78	NC_013365	CTGT	2	8	39273	39280	0 %	50 %	25 %	25 %	260752044
79	NC_013365	ACTG	2	8	39708	39715	25 %	25 %	25 %	25 %	260752044
80	NC_013365	GGCT	2	8	40031	40038	0 %	25 %	50 %	25 %	260752044
81	NC_013365	TTTC	2	8	40215	40222	0 %	75 %	0 %	25 %	260752045
82	NC_013365	CGCT	2	8	40238	40245	0 %	25 %	25 %	50 %	260752045
83	NC_013365	TGGC	2	8	40264	40271	0 %	25 %	50 %	25 %	260752045
84	NC_013365	TGCT	2	8	40299	40306	0 %	50 %	25 %	25 %	260752045
85	NC_013365	GCAA	2	8	40407	40414	50 %	0 %	25 %	25 %	260752045
86	NC_013365	GGAA	2	8	41614	41621	50 %	0 %	50 %	0 %	260752048
87	NC_013365	TTAC	2	8	41793	41800	25 %	50 %	0 %	25 %	260752048
88	NC_013365	CCAT	2	8	41952	41959	25 %	25 %	0 %	50 %	260752048
89	NC_013365	GTGG	2	8	42160	42167	0 %	25 %	75 %	0 %	260752048
90	NC_013365	TAAG	2	8	43511	43518	50 %	25 %	25 %	0 %	260752049
91	NC_013365	ATTC	2	8	43991	43998	25 %	50 %	0 %	25 %	260752049
92	NC_013365	ATTG	2	8	44115	44122	25 %	50 %	25 %	0 %	260752049
93	NC_013365	TGGG	2	8	44256	44263	0 %	25 %	75 %	0 %	260752049
94	NC_013365	TTCA	2	8	44555	44562	25 %	50 %	0 %	25 %	260752049
95	NC_013365	TGGA	2	8	44635	44642	25 %	25 %	50 %	0 %	260752049
96	NC_013365	TCTT	2	8	45007	45014	0 %	75 %	0 %	25 %	260752049
97	NC_013365	TGAA	2	8	45627	45634	50 %	25 %	25 %	0 %	260752050
98	NC_013365	GTTG	2	8	45934	45941	0 %	50 %	50 %	0 %	260752050
99	NC_013365	GAAA	2	8	46481	46488	75 %	0 %	25 %	0 %	260752051
100	NC_013365	AAAC	2	8	47570	47577	75 %	0 %	0 %	25 %	260752052
101	NC_013365	TTTG	2	8	47645	47652	0 %	75 %	25 %	0 %	260752052
102	NC_013365	TTGG	2	8	47695	47702	0 %	50 %	50 %	0 %	260752052
103	NC_013365	ATTT	2	8	48039	48046	25 %	75 %	0 %	0 %	260752053
104	NC_013365	GATG	2	8	48058	48065	25 %	25 %	50 %	0 %	260752053
105	NC_013365	GTAA	2	8	48173	48180	50 %	25 %	25 %	0 %	260752053
106	NC_013365	CTGC	2	8	48857	48864	0 %	25 %	25 %	50 %	260752053
107	NC_013365	ATTT	2	8	49116	49123	25 %	75 %	0 %	0 %	260752054
108	NC_013365	TTCA	2	8	50039	50046	25 %	50 %	0 %	25 %	260752055
109	NC_013365	CTGG	2	8	50215	50222	0 %	25 %	50 %	25 %	260752055
110	NC_013365	TCAT	2	8	51203	51210	25 %	50 %	0 %	25 %	260752056
111	NC_013365	AGTG	2	8	51802	51809	25 %	25 %	50 %	0 %	260752056
112	NC_013365	TCTA	2	8	52539	52546	25 %	50 %	0 %	25 %	260752056
113	NC_013365	CTGA	2	8	53289	53296	25 %	25 %	25 %	25 %	260752058
114	NC_013365	GGAT	2	8	53305	53312	25 %	25 %	50 %	0 %	260752058
115	NC_013365	GGAT	2	8	54143	54150	25 %	25 %	50 %	0 %	260752058
116	NC_013365	ATTT	2	8	54485	54492	25 %	75 %	0 %	0 %	260752059
117	NC_013365	TGTT	2	8	54646	54653	0 %	75 %	25 %	0 %	260752059
118	NC_013365	TTCC	2	8	54886	54893	0 %	50 %	0 %	50 %	260752059
119	NC_013365	GAAG	2	8	56499	56506	50 %	0 %	50 %	0 %	260752061
120	NC_013365	ATGC	2	8	56827	56834	25 %	25 %	25 %	25 %	260752061
121	NC_013365	GTAT	2	8	57392	57399	25 %	50 %	25 %	0 %	260752062
122	NC_013365	TAAT	2	8	57948	57955	50 %	50 %	0 %	0 %	260752062
123	NC_013365	GGCA	2	8	59179	59186	25 %	0 %	50 %	25 %	260752064
124	NC_013365	CTGG	2	8	59330	59337	0 %	25 %	50 %	25 %	260752064
125	NC_013365	CCAG	2	8	59500	59507	25 %	0 %	25 %	50 %	260752064
126	NC_013365	AATT	2	8	60015	60022	50 %	50 %	0 %	0 %	260752064
127	NC_013365	TGCC	2	8	60505	60512	0 %	25 %	25 %	50 %	260752065
128	NC_013365	TTAT	2	8	61069	61076	25 %	75 %	0 %	0 %	260752066
129	NC_013365	GAAA	2	8	61533	61540	75 %	0 %	25 %	0 %	260752067
130	NC_013365	TATC	2	8	61629	61636	25 %	50 %	0 %	25 %	260752067
131	NC_013365	ATGG	2	8	62205	62212	25 %	25 %	50 %	0 %	260752068
132	NC_013365	GGAT	2	8	62367	62374	25 %	25 %	50 %	0 %	260752069
133	NC_013365	CTGG	2	8	62486	62493	0 %	25 %	50 %	25 %	260752069
134	NC_013365	AAAC	2	8	63869	63876	75 %	0 %	0 %	25 %	260752071
135	NC_013365	GAAA	2	8	63988	63995	75 %	0 %	25 %	0 %	260752071
136	NC_013365	CCAG	2	8	64335	64342	25 %	0 %	25 %	50 %	260752072
137	NC_013365	TATT	2	8	65317	65324	25 %	75 %	0 %	0 %	260752073
138	NC_013365	CTGT	2	8	66107	66114	0 %	50 %	25 %	25 %	260752074
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.