MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_1

Total Repeats: 197

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013365	TG	3	6	362	367	0 %	50 %	50 %	0 %	260752013
2	NC_013365	AT	3	6	646	651	50 %	50 %	0 %	0 %	260752013
3	NC_013365	AT	3	6	5089	5094	50 %	50 %	0 %	0 %	260752019
4	NC_013365	AG	3	6	6019	6024	50 %	0 %	50 %	0 %	260752020
5	NC_013365	GT	3	6	6360	6365	0 %	50 %	50 %	0 %	260752020
6	NC_013365	TC	3	6	8327	8332	0 %	50 %	0 %	50 %	260752023
7	NC_013365	CA	3	6	9654	9659	50 %	0 %	0 %	50 %	260752024
8	NC_013365	TC	3	6	13873	13878	0 %	50 %	0 %	50 %	260752025
9	NC_013365	CG	3	6	14255	14260	0 %	0 %	50 %	50 %	260752025
10	NC_013365	AC	3	6	14451	14456	50 %	0 %	0 %	50 %	260752025
11	NC_013365	AT	3	6	15745	15750	50 %	50 %	0 %	0 %	260752026
12	NC_013365	AT	4	8	16639	16646	50 %	50 %	0 %	0 %	260752027
13	NC_013365	TG	3	6	18059	18064	0 %	50 %	50 %	0 %	260752030
14	NC_013365	AC	3	6	18711	18716	50 %	0 %	0 %	50 %	260752030
15	NC_013365	GA	3	6	20613	20618	50 %	0 %	50 %	0 %	260752032
16	NC_013365	AG	3	6	20819	20824	50 %	0 %	50 %	0 %	260752032
17	NC_013365	GA	3	6	22327	22332	50 %	0 %	50 %	0 %	260752034
18	NC_013365	AG	3	6	22508	22513	50 %	0 %	50 %	0 %	260752034
19	NC_013365	TC	3	6	22668	22673	0 %	50 %	0 %	50 %	260752035
20	NC_013365	TC	4	8	25970	25977	0 %	50 %	0 %	50 %	260752036
21	NC_013365	GA	3	6	29085	29090	50 %	0 %	50 %	0 %	260752038
22	NC_013365	AG	3	6	30588	30593	50 %	0 %	50 %	0 %	260752039
23	NC_013365	TG	3	6	32064	32069	0 %	50 %	50 %	0 %	260752040
24	NC_013365	TA	3	6	32273	32278	50 %	50 %	0 %	0 %	260752040
25	NC_013365	AT	3	6	32306	32311	50 %	50 %	0 %	0 %	260752041
26	NC_013365	TG	3	6	33279	33284	0 %	50 %	50 %	0 %	260752041
27	NC_013365	CG	3	6	33607	33612	0 %	0 %	50 %	50 %	260752041
28	NC_013365	GT	3	6	34022	34027	0 %	50 %	50 %	0 %	260752041
29	NC_013365	AG	3	6	34131	34136	50 %	0 %	50 %	0 %	260752041
30	NC_013365	TG	3	6	36723	36728	0 %	50 %	50 %	0 %	260752042
31	NC_013365	TG	3	6	39187	39192	0 %	50 %	50 %	0 %	260752044
32	NC_013365	AC	3	6	39230	39235	50 %	0 %	0 %	50 %	260752044
33	NC_013365	AG	4	8	41538	41545	50 %	0 %	50 %	0 %	260752048
34	NC_013365	GC	3	6	43655	43660	0 %	0 %	50 %	50 %	260752049
35	NC_013365	AC	3	6	45771	45776	50 %	0 %	0 %	50 %	260752050
36	NC_013365	AG	3	6	45914	45919	50 %	0 %	50 %	0 %	260752050
37	NC_013365	AC	3	6	46096	46101	50 %	0 %	0 %	50 %	260752050
38	NC_013365	GA	4	8	46563	46570	50 %	0 %	50 %	0 %	260752051
39	NC_013365	GA	3	6	46691	46696	50 %	0 %	50 %	0 %	260752051
40	NC_013365	TA	3	6	46974	46979	50 %	50 %	0 %	0 %	260752052
41	NC_013365	GT	3	6	47050	47055	0 %	50 %	50 %	0 %	260752052
42	NC_013365	TA	3	6	48128	48133	50 %	50 %	0 %	0 %	260752053
43	NC_013365	AT	3	6	49080	49085	50 %	50 %	0 %	0 %	260752054
44	NC_013365	CT	3	6	50272	50277	0 %	50 %	0 %	50 %	260752055
45	NC_013365	GA	3	6	50710	50715	50 %	0 %	50 %	0 %	260752056
46	NC_013365	GT	3	6	51767	51772	0 %	50 %	50 %	0 %	260752056
47	NC_013365	AT	3	6	52619	52624	50 %	50 %	0 %	0 %	260752057
48	NC_013365	AG	3	6	52948	52953	50 %	0 %	50 %	0 %	260752058
49	NC_013365	AT	3	6	53433	53438	50 %	50 %	0 %	0 %	260752058
50	NC_013365	TG	3	6	53471	53476	0 %	50 %	50 %	0 %	260752058
51	NC_013365	AG	3	6	55618	55623	50 %	0 %	50 %	0 %	260752060
52	NC_013365	TA	3	6	55785	55790	50 %	50 %	0 %	0 %	260752060
53	NC_013365	TG	3	6	57668	57673	0 %	50 %	50 %	0 %	260752062
54	NC_013365	AT	3	6	58110	58115	50 %	50 %	0 %	0 %	260752063
55	NC_013365	TA	4	8	58192	58199	50 %	50 %	0 %	0 %	260752063
56	NC_013365	TC	3	6	58560	58565	0 %	50 %	0 %	50 %	260752063
57	NC_013365	TC	3	6	59226	59231	0 %	50 %	0 %	50 %	260752064
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59	NC_013365	GA	3	6	64002	64007	50 %	0 %	50 %	0 %	260752071
60	NC_013365	GA	3	6	64352	64357	50 %	0 %	50 %	0 %	260752072
61	NC_013365	TG	3	6	64482	64487	0 %	50 %	50 %	0 %	260752072
62	NC_013365	CA	4	8	64991	64998	50 %	0 %	0 %	50 %	260752072
63	NC_013365	TG	3	6	65302	65307	0 %	50 %	50 %	0 %	260752073
64	NC_013365	AT	3	6	65926	65931	50 %	50 %	0 %	0 %	260752074
65	NC_013365	TG	3	6	66425	66430	0 %	50 %	50 %	0 %	260752074
66	NC_013365	GA	3	6	66486	66491	50 %	0 %	50 %	0 %	260752074
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68	NC_013365	TC	3	6	68812	68817	0 %	50 %	0 %	50 %	260752078
69	NC_013365	TG	3	6	71721	71726	0 %	50 %	50 %	0 %	260752081
70	NC_013365	GT	3	6	72321	72326	0 %	50 %	50 %	0 %	260752082
71	NC_013365	AC	3	6	75147	75152	50 %	0 %	0 %	50 %	260752087
72	NC_013365	CA	3	6	75796	75801	50 %	0 %	0 %	50 %	260752087
73	NC_013365	GA	3	6	76919	76924	50 %	0 %	50 %	0 %	260752089
74	NC_013365	GT	3	6	78615	78620	0 %	50 %	50 %	0 %	260752091
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76	NC_013365	GT	3	6	81351	81356	0 %	50 %	50 %	0 %	260752095
77	NC_013365	TC	3	6	82190	82195	0 %	50 %	0 %	50 %	260752096
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80	NC_013365	CT	3	6	85651	85656	0 %	50 %	0 %	50 %	260752100
81	NC_013365	GA	3	6	88076	88081	50 %	0 %	50 %	0 %	260752103
82	NC_013365	TG	3	6	89266	89271	0 %	50 %	50 %	0 %	260752104
83	NC_013365	TA	3	6	89607	89612	50 %	50 %	0 %	0 %	260752104
84	NC_013365	TG	3	6	90346	90351	0 %	50 %	50 %	0 %	260752106
85	NC_013365	CT	3	6	91425	91430	0 %	50 %	0 %	50 %	260752107
86	NC_013365	CA	3	6	92577	92582	50 %	0 %	0 %	50 %	260752107
87	NC_013365	AT	3	6	95477	95482	50 %	50 %	0 %	0 %	260752111
88	NC_013365	GA	3	6	97155	97160	50 %	0 %	50 %	0 %	260752113
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90	NC_013365	GC	3	6	99953	99958	0 %	0 %	50 %	50 %	260752117
91	NC_013365	GC	3	6	100402	100407	0 %	0 %	50 %	50 %	260752119
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103	NC_013365	GC	3	6	103997	104002	0 %	0 %	50 %	50 %	260752123
104	NC_013365	GC	3	6	104327	104332	0 %	0 %	50 %	50 %	260752123
105	NC_013365	CG	3	6	105031	105036	0 %	0 %	50 %	50 %	260752123
106	NC_013365	TC	3	6	105557	105562	0 %	50 %	0 %	50 %	260752124
107	NC_013365	CG	3	6	105675	105680	0 %	0 %	50 %	50 %	260752124
108	NC_013365	TC	3	6	107417	107422	0 %	50 %	0 %	50 %	260752126
109	NC_013365	CG	3	6	107535	107540	0 %	0 %	50 %	50 %	260752126
110	NC_013365	GA	3	6	108017	108022	50 %	0 %	50 %	0 %	260752127
111	NC_013365	GC	3	6	108291	108296	0 %	0 %	50 %	50 %	260752127
112	NC_013365	GA	3	6	108437	108442	50 %	0 %	50 %	0 %	260752127
113	NC_013365	GC	3	6	108798	108803	0 %	0 %	50 %	50 %	260752128
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118	NC_013365	GC	3	6	112564	112569	0 %	0 %	50 %	50 %	260752131
119	NC_013365	GA	3	6	112683	112688	50 %	0 %	50 %	0 %	260752131
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121	NC_013365	CG	3	6	115477	115482	0 %	0 %	50 %	50 %	260752134
122	NC_013365	GC	3	6	118597	118602	0 %	0 %	50 %	50 %	260752135
123	NC_013365	AT	3	6	119415	119420	50 %	50 %	0 %	0 %	260752136
124	NC_013365	AT	3	6	119735	119740	50 %	50 %	0 %	0 %	260752136
125	NC_013365	TA	3	6	120846	120851	50 %	50 %	0 %	0 %	260752139
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127	NC_013365	AT	3	6	121196	121201	50 %	50 %	0 %	0 %	260752139
128	NC_013365	GT	3	6	124639	124644	0 %	50 %	50 %	0 %	260752142
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140	NC_013365	CA	3	6	142997	143002	50 %	0 %	0 %	50 %	260752160
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.